Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,831,404 | (C)5→6 | coding (579/1221 nt) | astC ← | succinylornithine transaminase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,831,399 | 1 | . | C | 97.0% | 823.8 / 11.7 | 231 | coding (584/1221 nt) | astC | succinylornithine transaminase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/7); new base C (63/161); total (63/168) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.94e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
GTAGTGCATATAGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TT‑CC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAGGCTGGCTG > NC_000913/1831260‑1831532 | gTAGTGCATATAGGCGTACAGTGCCACGGGGCGCCCGTCGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑tt < 1:3348943/140‑1 (MQ=255) gTAGTGCATATAGGCATACAGTTCCCCGGTGGCCCCGACCCCGGTTTGGACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑tt < 2:3159016/140‑1 (MQ=255) gTAGTGCATATAGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑tt < 1:6711962/140‑1 (MQ=255) gTAGTGCATATAGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑tt < 1:748980/140‑1 (MQ=255) gTAGTGCATATAGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑tt < 2:6181026/140‑1 (MQ=255) caggTGCATATAGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑tt < 1:7016873/137‑1 (MQ=255) agacagCATATAGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑tt < 1:5060975/135‑1 (MQ=255) gTGCATATAGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TT‑cc‑c < 1:6839865/140‑1 (MQ=255) gTGCATATAGGCATACAGTTCCCCGCTGCACCCGACGTCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TT‑cc‑c < 1:2102083/140‑1 (MQ=255) taGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TT‑cc‑cccctgga < 1:3948742/140‑6 (MQ=255) aGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTTCACAAATCACGCCGACCTTGTAAAAAAACCGTGCTGGCTGGGCCCACA‑CCCCC‑CT‑cc‑ccccccgat > 2:4462262/1‑134 (MQ=255) aGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGAt < 1:1000185/140‑1 (MQ=255) aGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGATACACAAATTACACAAACCCTTTAAAAAAACGTTGCTGGCTTGGCCCCCA‑ccccc‑cc‑cc‑ccccccccc > 2:1186823/1‑134 (MQ=255) ggCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATg < 1:6329757/140‑1 (MQ=255) cagcAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGt < 1:4686974/137‑1 (MQ=255) aTACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGt < 2:5608401/140‑1 (MQ=255) cccGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGCACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTCAAAACGCGCTGCTGGGTTGCGCCCCA‑CCCCCATC‑CC‑CCCCGGGTGGGTTCGGCAGTc > 2:1880520/1‑140 (MQ=255) cGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCAc < 1:5815724/140‑1 (MQ=255) cGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGCCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCAc < 1:6949881/140‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAGTCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCg < 2:3267727/140‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCg < 1:5473373/140‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCg < 1:4320317/140‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCg < 1:880765/140‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCg < 1:413004/140‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCg < 1:4025978/140‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCg < 1:1557194/140‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCg < 1:1293185/140‑1 (MQ=255) tGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAAATCACCCAGACCCTGTAAAAAAACGTTGTTGGCTGGGGCCCCACCCCCC‑CC‑CC‑CCCCCGCTGGGGTCGACAAACAcccc > 2:4366308/1‑138 (MQ=255) tGCGCCCGACGCCGGTTTGTACGTCCTCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGc < 1:2594019/140‑1 (MQ=255) cgcCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGcac < 1:16499/140‑1 (MQ=255) cgcCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGcac < 1:1182828/140‑1 (MQ=255) gACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTa < 1:5096059/140‑1 (MQ=255) gcGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCCCGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACC‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTag < 2:5240582/139‑1 (MQ=255) aCGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTag < 1:4454677/140‑1 (MQ=255) aCGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAAACAATAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTag < 1:3261475/140‑1 (MQ=255) gCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTagag < 2:7275058/140‑1 (MQ=255) tcatcaAAAATCAACAGCGCATTGTCGCGCTTACACAGTTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAgcg < 1:2337476/140‑1 (MQ=255) atcaAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAgcgcg < 1:5876605/140‑1 (MQ=255) atcaAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAgcgcg < 1:4856987/140‑1 (MQ=255) aaaaTCAACAGCGCAGTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTgg < 1:3236494/140‑1 (MQ=255) aaaTCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGc < 2:3943067/140‑1 (MQ=255) aaaTCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGACTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGc < 1:4375320/140‑1 (MQ=255) aaaTCAACAGCGCATTGTGGCGCTTCCACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGc < 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aGCGCATTGTGGCGGATACACACTTGACGGAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTaa < 1:3497201/140‑1 (MQ=255) cgcATTGTGGCGGTTACCCAATCCACGCAGACCTTTTAATAACGCGTTTCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAata < 2:2113299/140‑1 (MQ=255) cgcATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAata < 1:4817920/140‑1 (MQ=255) cgcATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAata < 1:7215347/140‑1 (MQ=255) cgcATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAata < 1:7347461/140‑1 (MQ=255) cgcATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAata < 2:1111932/140‑1 (MQ=255) cgcATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAata < 1:1373813/140‑1 (MQ=255) cacATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAata < 2:7465911/138‑1 (MQ=255) acagttGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAata < 1:4300408/136‑1 (MQ=255) cATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATc < 1:1194529/140‑1 (MQ=255) cATTGTGGCGGTTACACAAATTACCCCGACCCTTTAAAAAAACGGTGCTGGGTGGCGCCCCACCCCCC‑CC‑CC‑CCCCCGGGGGGGGCGACAAACACCCCACACGGGGAGGCGTCAAACAACGCGCCGGCGGAGGTAaaatt > 2:6028782/1‑139 (MQ=255) 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1:3842663/1‑140 (MQ=255) aaCGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCACAGTTAATATCGTTAAACGCAGCATGACGAAAATCCGCCGGCAGTGgcg > 2:3381102/1‑140 (MQ=255) aaCGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAAACACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGgcg > 1:4523496/1‑140 (MQ=255) cgcgTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCa < 2:2284544/140‑1 (MQ=255) cgcgTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCa < 1:552599/140‑1 (MQ=255) cgcgTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTCATATGCAGCATGACAAATATCCGCCGGCAGTGGCGCa > 1:3014858/1‑140 (MQ=255) cgTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGAGGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCaaa > 1:2815314/1‑140 (MQ=255) cgTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCaaa < 2:6483376/140‑1 (MQ=255) cgTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCaaa > 1:5724240/1‑140 (MQ=255) ttGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAAt > 2:5845547/1‑140 (MQ=255) ttGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAAt > 1:4474041/1‑140 (MQ=255) gctggctgGCACCACG‑CCGCC‑TC‑CCTCCCCGGATGGGGTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATcc < 1:2282786/140‑1 (MQ=255) ctggcACCACA‑CCGCT‑TTCCC‑CCCTGGATCGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGa < 1:3596846/140‑1 (MQ=255) ctggcACCACA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGa > 1:3989226/1‑140 (MQ=255) caccacC‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGGAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGaa > 1:1071543/1‑137 (MQ=255) caccacA‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAg > 1:5961512/1‑140 (MQ=255) caca‑CCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAggct < 2:5070411/140‑1 (MQ=255) acagccGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACCATCTCCGCACAGGTAGTGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAggct < 2:2957627/136‑1 (MQ=255) ca‑cCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAggctgg > 2:4862172/1‑140 (MQ=255) ca‑cCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAggctgg > 2:2493229/1‑140 (MQ=255) ca‑cCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAggctgg > 1:5246116/1‑140 (MQ=255) ca‑cCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAggctgg > 1:3907813/1‑140 (MQ=255) ca‑cCGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATACCCGCCGGCAGTGGCACAAAATCCTGTGAATAggctgg > 1:2970637/1‑140 (MQ=255) cGCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAGgctggctg < 2:3737429/140‑1 (MQ=255) gCC‑TTCCC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAggctgg < 2:4582340/136‑1 (MQ=255) | GTAGTGCATATAGGCATACAGTTCCCCGGTGCGCCCGACGCCGGTTTGTACTTCATCAAAAATCAACAGCGCATTGTGGCGGTTACACAATTCACGCAGACCTTGTAAAAACGCGTTGCTGGCTGGCACCACA‑CCGCC‑TT‑CC‑CCCTGGATGGGTTCGACAATCACCGCACAGGTAGAGTCGTCAATCAGCGCGCTGGCAGAGTTAATATCGTTATATGCAGCATGACGAATATCCGCCGGCAGTGGCGCAAAATCCTGTGAATAGGCTGGCTG > NC_000913/1831260‑1831532 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |