| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3653230 | NA (NA) | 488 (1.080) | 126/276 | 0.3 | 94.8% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3766089 | 27 (0.060) | coding (3907/4134 nt) | rhsA | rhs element protein RhsA | |||||
Only 100 of 488 total aligned reads displayed.
AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3653092‑3653230‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTG < NC_000913/3766089‑3765952 TCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAAT > 2:5485954/1‑140 TCTTTTCTGGTCTGACGTCGCTTACTGCTGATTTCACTGTCGGCGAAGATAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGC < 2:3023084/140‑1 TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGC < 2:6676881/140‑1 TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGC < 2:5279697/140‑1 TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGC < 1:6346057/140‑1 TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGC < 1:7427713/140‑1 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCT < 2:920946/140‑1 TTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAG > 1:5780378/1‑140 TCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGACGGCGGAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGA < 1:3264312/140‑1 GACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTA < 2:4635817/140‑1 GACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTA < 2:3765348/140‑1 ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGCGACGTGTGCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTAT > 2:2433646/1‑140 CGGCGCTTACTGCTGTATTCACTGTTGGCAAAGGTAACTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATT < 1:3655901/140‑1 CGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATT < 1:15235/140‑1 GGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCCTAATGCTAGTCCCGGATTATT < 2:1422585/140‑1 CTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAG > 1:7004785/1‑140 TGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGA < 2:635224/140‑1 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGA < 1:1196212/140‑1 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGA < 1:4499280/140‑1 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGA < 1:4316687/140‑1 TGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATT > 2:4581159/1‑127 TTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAA > 2:4019997/1‑140 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATT > 1:402591/1‑140 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATT > 1:1299156/1‑140 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATT > 2:5433603/1‑140 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATT > 1:5567010/1‑140 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCAGATGATGCA‑‑ATATGAGAGAGTCAAATATT > 1:2565063/1‑140 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTG < 1:4399150/140‑1 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTG < 1:167792/140‑1 GGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATG > 1:1837492/1‑140 GTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGC < 2:5821659/140‑1 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTG > 2:5651872/1‑133 GTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCT‑‑ATATAAGAGAGTAAAATCGTCTTTGTGATGCTGTA > 2:3555501/1‑140 GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCG > 2:4474635/1‑140 TCATGATGAACCCTGTTCTATGTCTTCAGCTGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCAC < 1:2421403/140‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCA > 2:7439715/1‑140 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCA > 1:502049/1‑140 GATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGGTGATAAACATGTTCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATT < 1:2683187/140‑1 GATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATT < 1:771146/140‑1 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATT < 2:1090284/139‑1 ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTC > 2:6028899/1‑140 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAGATAGTCTCTGTGATGCGGTATAGTTCCACCATTTTGTCA > 2:2107459/1‑140 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAAGATTCTTTGTGAGGCGGTATCGGTCCACCATTTTGTCA > 1:2132323/1‑140 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAAT > 1:511834/1‑140 TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGGTGCTGTATCGTTCTACCATTTTGTCAATG > 1:3110037/1‑140 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGC > 1:6425412/1‑140 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGC > 1:4860202/1‑140 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCT > 2:6244847/1‑140 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAATCAAATATTCTTGGTGGTGCTGTATGGTTCAACCATTTTGTCAATGCT > 2:2864455/1‑140 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGC > 1:5475633/1‑140 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATT < 1:6584455/124‑1 TGGCTCCAGATGACAAACATGAACTCATATCTGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGC < 2:2655624/140‑1 GGCTCCAGATGACAATCATGATATCGTATGAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCA < 1:3555501/140‑1 GGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCA < 2:7287710/140‑1 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCA < 2:1239347/140‑1 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCAT > 2:6862021/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCAT > 2:766466/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCAT > 2:4750854/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCAT > 2:4848466/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCAT > 2:257985/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCAT > 1:1055449/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCAT > 1:7228656/1‑140 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCAGTATCATACCACCATTTTGTCCATGCTTTTGCAGCAT > 1:3418235/1‑140 GATTACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTAT < 1:7161856/140‑1 GACAAACATGATCTCCTATCAGGGATTTGATCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCAT < 1:3326320/140‑1 GACAAACATGATCTCATCTCAGCGACTTGTTGGCAGCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCAT < 2:2745787/140‑1 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCAT < 1:87012/140‑1 CAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCT > 2:6985077/1‑140 ATGATCTCATATCAGGGACTTGCTCGCACGTT‑CCCTACTGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTG < 1:2843247/140‑1 ATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTG < 1:1377137/140‑1 ATCTCATATCAGGGACTTGTTCCCACCTT‑CCATAATGCTCGTCCCGGACTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTG < 2:3110037/140‑1 CTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCT > 1:474385/1‑140 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCAACCATTTTCTCAGTGCATTTGCAGCGTTATAATCTGCTTGCTGCTGTG > 2:2171525/1‑140 TATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCCATGCTTTAGCAGCAATATCATGTGCTTGCTGCTGTGC > 1:2252216/1‑140 TATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGC > 2:5865103/1‑140 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCA > 1:5178967/1‑140 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCAACATTTTGTAAATGCTTGTGCAGCATTATCAGCTGCTTGCTGCTGTGCA > 2:1951431/1‑140 TCAGGGACTTGTTCGGACCTT‑CCCTCATGCTAGTCCCAGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAG < 1:1951431/140‑1 GGGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATCTTGTCAATGCTTCTCCCGCATTATCCTCTGTTTGCTGCTGTGCAGGGC > 2:3364035/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCATTGCTTTTGCTGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGACT > 2:1296972/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCT > 1:958919/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCT > 2:1578684/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCT > 1:4205993/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCT > 1:5386715/1‑140 GGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCT < 1:5891715/123‑1 GGACTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTAATCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCT > 2:4376660/1‑123 CTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTT > 2:5026941/1‑140 CTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTT < 1:6752337/140‑1 CTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTT > 2:4241029/1‑140 CTTGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGG > 2:3837810/1‑134 TGTTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGG > 2:6595177/1‑140 TTCGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCAATATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGG > 2:4139532/1‑140 CGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCA < 1:5661457/140‑1 CGCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCA < 2:1752377/140‑1 GCACCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATGATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAG > 1:2802137/1‑126 CCTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGA < 1:4628187/140‑1 CTT‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAA < 2:5126649/140‑1 T‑CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAATT > 2:7181248/1‑140 CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTG > 1:6166443/1‑140 CCCTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTG > 1:3780899/1‑140 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTT‑CC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3653092‑3653230‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAATGCTAGTCCCGGATTATTCA‑‑ATATTAGAGAGTCAAATATTCTTTGTGATGCTGTATCGTTCCACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCTTTTGGGCCATGGAATTG < NC_000913/3766089‑3765952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |