| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,816,136 | C→T | intergenic (+8/+250) | katE → / ← chbG | catalase II/chitin disaccharide deacetylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,816,136 | 0 | C | T | 99.4% | 1191.8 / NA | 354 | intergenic (+8/+250) | katE/chbG | catalase II/chitin disaccharide deacetylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (152/200); minor base A (1/1); total (153/201) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 361 total aligned reads displayed.
TGACCAGGGTGAAGAAGGGATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGCGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGAAACACGTAGGCCTGATAAGCGA > NC_000913/1815999‑1816270 | ggTGAAGAAGGGATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAAtt > 2:7378562/1‑140 (MQ=255) ggTGAAGAAGGGATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAAtt > 2:1824101/1‑140 (MQ=255) ggTGAAGAAGGGATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACACATTCCTAAGATGGACAAAATTCCTACCTGGTGGGAGGTGGCGCAAtt > 2:2891950/1‑140 (MQ=255) gTGAAGAAGGGATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTg > 2:4602415/1‑140 (MQ=255) agaagGGATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGcgcc > 2:83268/1‑140 (MQ=255) ggATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAGATTCCTGACTGATGGGGGGTGTCGCAATTGCGCCGCCTc > 2:2800476/1‑140 (MQ=255) ggATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATTGGAGGTGGCACAATTGCGCCGCCTc > 1:2290312/1‑140 (MQ=255) ggATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTc > 1:7056628/1‑140 (MQ=255) gATTGTGGAAGCTGATAGCGCTGACTGTAGTTTTATGTATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCa < 1:3495823/140‑1 (MQ=255) gATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCgccgcc < 1:3768474/137‑1 (MQ=255) gATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCa > 2:56649/1‑140 (MQ=255) aTTGTGGATGCTGACAGGGCTGACGGTAGTGATGTGGATGAACTGCTATCGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 2:3624216/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACTGCGCTGCCGCTAGCTTTATGGCTGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 1:2008356/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACCGCGCTGCCGGTAGGTTTATGGTTGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 1:2891950/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACCGCGCTGACGTTAGTTTTATGGGTGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 1:2643456/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACAGCGCTGCCGGTAGTTTTATTGATCAACTGCTACCGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 2:2249016/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 1:5892331/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 1:6147279/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 1:6212783/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 2:7218116/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 1:1514757/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 2:5893210/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 2:337259/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 2:4522203/140‑1 (MQ=255) tgtgGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCa > 1:7467697/1‑137 (MQ=255) tgtgGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAAt < 2:1021665/140‑1 (MQ=255) tgtgGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAAt < 1:1119161/140‑1 (MQ=255) gtgGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 2:4006019/137‑1 (MQ=255) tgGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGa < 1:7329328/140‑1 (MQ=255) aaGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGAttt < 1:1729944/140‑1 (MQ=255) aGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTa > 2:1644008/1‑140 (MQ=255) gCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCaa < 1:6771016/131‑1 (MQ=255) cTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACa > 1:1320576/1‑140 (MQ=255) gACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATa > 2:3868216/1‑140 (MQ=255) cAGCGCTGACGGTAGTTTTATGTATGAACTGCTAAGGCTGATGGCAGCCCACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGt < 2:3240873/140‑1 (MQ=255) cAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGt < 1:5497974/140‑1 (MQ=255) cAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGAAGGTGGCGCAATTGCGACGCCCCAAATGATCTACAtctg > 2:3516084/1‑137 (MQ=255) gcTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTgcgc < 1:1824101/140‑1 (MQ=255) cTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCt < 1:4531522/140‑1 (MQ=255) gACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATa > 2:4863222/1‑131 (MQ=255) tGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGAt > 2:6833750/1‑140 (MQ=255) tGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGAt > 2:1425702/1‑140 (MQ=255) ggATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATg < 1:7238023/140‑1 (MQ=255) aTGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATgcg < 1:444864/140‑1 (MQ=255) aTGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATgcg < 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cTGCTAACGCTGATGACAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTg < 1:3328393/140‑1 (MQ=255) tGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGa < 1:1628263/140‑1 (MQ=255) gCTAACGCTGATGGCAGCACACAGCATGTGGTCACGCGTTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGaa < 1:2457699/140‑1 (MQ=255) aCGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACTAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGcc < 2:3001365/140‑1 (MQ=255) gCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCtt > 2:5488536/1‑140 (MQ=255) gATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc < 1:4602415/140‑1 (MQ=255) gATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGCGCGGTTTGTTTATGCCGGATGAGGCGTGAACGCCTTATc > 2:2435512/1‑140 (MQ=255) gcagcaCACCGCGTGAGGTCACGCAGTCCGAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGc < 1:3580703/140‑1 (MQ=255) gcaCACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTa > 1:7193464/1‑140 (MQ=255) gcaCACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTa < 1:911474/140‑1 (MQ=255) ccGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACaaaa < 2:1055734/140‑1 (MQ=255) cgcgTGTGGTCACGCTTTCCTAAGAGTGAAAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAc < 1:2696031/140‑1 (MQ=255) cgcgTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGGCGGATGCGGCGAGAGCGCCTTGTCCGGCCTACAAAAc > 1:2065943/1‑140 (MQ=255) cgcgTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAc > 2:5200525/1‑140 (MQ=255) cgcgTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAc > 1:5407528/1‑140 (MQ=255) cgcgTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAc > 1:4295272/1‑140 (MQ=255) gcgTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACt > 1:5538241/1‑140 (MQ=255) gcgTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACt > 1:6594443/1‑140 (MQ=255) cgTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTATGTTTATGCCGGATGCTGCGTGAACCCCTTGTCCGGCCTACAAAACtg > 2:3151237/1‑140 (MQ=39) gtgtGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGG‑CTACAAAACtgtg > 2:5339083/1‑140 (MQ=255) gtgGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc < 1:6056354/122‑1 (MQ=255) gtgGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc > 2:6056354/1‑122 (MQ=255) gtgGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGc < 1:298801/140‑1 (MQ=255) gtgGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGc < 2:6173072/140‑1 (MQ=255) gtgGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGc > 1:4904252/1‑140 (MQ=255) gtgGTCACGCATTCCTAAGATTCACCAAAATCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGc < 1:2089552/140‑1 (MQ=255) ggTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCaa < 1:4092480/140‑1 (MQ=255) gTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATTCGGGGTGGACGCCTTATCCGGGTTACAAAAATGTGCaaa > 2:3712607/1‑140 (MQ=38) cACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCaaaat < 1:4718448/140‑3 (MQ=255) cACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAAtt < 2:7084256/140‑1 (MQ=255) tCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATACGGCGTGACCGCGTTAGCCGGCCTAAAAAAGTGTGCAAATTCAatata > 2:2521857/1‑140 (MQ=37) aGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCa < 1:5320574/140‑1 (MQ=255) gATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGCGAACGCCTGATCGGGCGTACAAAACAGTGCCAATTCAATATATTGCAg > 2:2145616/1‑140 (MQ=37) ttGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGa > 1:102520/1‑140 (MQ=255) ttGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAGCCGACCTGCAAAACTGTGCAAGTTCAATATATTGCAGGa > 2:2032676/1‑140 (MQ=37) tGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGaa < 2:1253141/140‑1 (MQ=255) gACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCGGGCCTACCAAACTGTGGAAATTCAATATATTGCAGGaaa > 2:2950024/1‑140 (MQ=255) gACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCa < 1:5104185/135‑1 (MQ=255) gACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGaaa > 1:6466197/1‑140 (MQ=255) gACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGaaa > 2:6330751/1‑140 (MQ=255) gACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGaaa > 2:6644911/1‑140 (MQ=255) gACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGaaa > 1:3925399/1‑140 (MQ=255) gACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGaaa > 1:1229375/1‑140 (MQ=255) gACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGaaa > 2:4349446/1‑140 (MQ=255) cAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGAAaca > 1:3082267/1‑140 (MQ=255) aaaTTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGAAACACg < 1:6644911/140‑1 (MQ=255) aaaTTCCTGCCTGATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGAAACACg < 2:6526166/140‑1 (MQ=255) cctgcctgATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGAAACACGTAGGc < 2:6988393/140‑1 (MQ=255) gcctgATGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTATGCAAATGCAAGATTTTGCAGGAAACACGTAGGCCTg > 1:2224594/1‑140 (MQ=25) aTGGGAGGTGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGaa > 2:1200972/1‑122 (MQ=255) | TGACCAGGGTGAAGAAGGGATTGTGGAAGCTGACAGCGCTGACGGTAGTTTTATGGATGAACTGCTAACGCTGATGGCAGCACACCGCGTGTGGTCACGCATTCCTAAGATTGACAAAATTCCTGCCTGATGGGAGGCGGCGCAATTGCGCCGCCTCAAATGATTTACATAGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACTGTGCAAATTCAATATATTGCAGGAAACACGTAGGCCTGATAAGCGA > NC_000913/1815999‑1816270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |