Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 2,720,083 | T→C | V44A (GTA→GCA) | patZ → | peptidyl‑lysine acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,720,083 | 0 | T | C | 99.8% | 1345.6 / ‑5.7 | 399 | V44A (GTA→GCA) | patZ | peptidyl‑lysine acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (174/224); total (175/224) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.21e-01 |
Only 100 of 430 total aligned reads displayed.
GACCGGTATGAGTCAGCGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGTACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGCTCTTCTGGAAGAGCT > NC_000913/2719946‑2720218 | gaCCGGTATGAGTCAGCGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCAc > 2:5124276/1‑140 (MQ=255) aCCGGTATGAGTCAGCGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACt < 1:6096247/140‑1 (MQ=255) tGAGTCAGCGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAAACTGTTGGGGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCgggg > 2:2271624/1‑138 (MQ=255) gAGTCAGCGAGGACTTGAAGCACTAGTGCGACCAAAAGCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGa < 1:2650149/140‑1 (MQ=255) gTCAGCGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGTGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACg > 1:7235885/1‑140 (MQ=255) gTCAGCGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACg > 1:5913568/1‑140 (MQ=255) gCGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTGACCTGCTGGCGGAAAGACTTAACGGCCCGGCACTCCCGGGGACGCCAg > 2:3670491/1‑140 (MQ=255) gCGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAg > 2:1748114/1‑140 (MQ=255) cGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGTGGGTGGCGTTAACGGAACGGCACTCCCGGTGACGCCAGc > 2:2200722/1‑140 (MQ=255) cGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGc > 2:6569737/1‑140 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ctactGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGtt > 1:4245703/1‑140 (MQ=255) actGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTgg < 2:5037670/140‑1 (MQ=255) actGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTgg > 1:4196387/1‑140 (MQ=255) cGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGgtgt > 1:6924408/1‑140 (MQ=255) gACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGgtgtg < 2:3808032/140‑1 (MQ=255) aCCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCCGCCTGGAAAGCGGGGTTGGgggtgt > 1:351795/1‑140 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gATAGCGGTAATTGGTGCGTCGATGGAACTCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTtggcctggc < 1:2953295/140‑1 (MQ=255) aGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCgg < 2:1275010/140‑1 (MQ=255) gCGGTAATTGGCGCGTTGATGAAACCCAATCGCTCGGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGa < 2:3567454/140‑1 (MQ=255) gCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGa < 2:5205316/140‑1 (MQ=255) ggTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGata > 1:4775105/1‑140 (MQ=255) gTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGatat > 2:4981738/1‑140 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1:1214135/1‑140 (MQ=255) ctgGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGcc < 2:5793546/132‑1 (MQ=255) ctgGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTaa > 1:933220/1‑140 (MQ=255) tgGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAAt > 1:46348/1‑140 (MQ=255) cGGGAGGCTGTTTCGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCtt < 2:4701908/140‑1 (MQ=255) ggAGGCTTTAACGGACCTGCACCCCCGGTGAGGCCAGCCAGGAAAGCGTTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGc < 2:2062480/140‑1 (MQ=255) ggAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGc < 2:293445/140‑1 (MQ=255) ggAGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGc < 2:720082/140‑1 (MQ=255) aGGCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGctc < 1:1345889/140‑1 (MQ=255) ggCTTTAACGGACCGTCACTCCGGGCGACGCCAGCCTCGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGctct < 1:3181860/140‑1 (MQ=255) ggCTTTAACGGACCGGCCCTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGGTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGctct < 2:3396744/140‑1 (MQ=255) ggCTTTAACGGACCGGCACTCCCGGTGACACCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGctct < 1:4403250/140‑1 (MQ=255) gcgttAACGGACCGGCACTCCCGGGGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGGTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACTCCCGACCTAGCGGTATTCTGTACCAATTCCAGCCGTAATGTTGCtctt > 2:3588061/4‑140 (MQ=255) aCCGGCACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGCTCTTCTGGAAGAGc > 2:4802537/1‑140 (MQ=255) ccGGTACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGCTCTTCTGGAAGAGCt > 2:7530995/1‑140 (MQ=255) | GACCGGTATGAGTCAGCGAGGACTGGAAGCACTACTGCGACCAAAATCGATAGCGGTAATTGGCGCGTCGATGAAACCCAATCGCGCAGGTTACCTGATGATGCGTAACCTGCTGGCGGGAGGCTTTAACGGACCGGTACTCCCGGTGACGCCAGCCTGGAAAGCGGTGTTGGGTGTGTTGGCCTGGCCGGATATTGCCAGCTTGCCCTTTACACCCGACCTTGCGGTTTTATGTACCAATGCCAGCCGTAATCTTGCTCTTCTGGAAGAGCT > NC_000913/2719946‑2720218 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |