| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,812,983 | C→T | S123L (TCG→TTG) | emrB → | multidrug efflux pump membrane subunit EmrB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,812,983 | 0 | C | T | 99.5% | 1380.1 / NA | 412 | S123L (TCG→TTG) | emrB | multidrug efflux pump membrane subunit EmrB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (222/186); minor base A (1/1); total (224/188) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 429 total aligned reads displayed.
GGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTCGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGG > NC_000913/2812846‑2813118 | gAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTTCATCATTGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCa < 1:3294225/140‑1 (MQ=255) gAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCa < 1:5653040/140‑1 (MQ=255) gAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCa < 1:5402705/140‑1 (MQ=255) gAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCa < 1:920586/140‑1 (MQ=255) gAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTGGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCa < 2:3163155/140‑1 (MQ=255) gAAGTGAAACTGTTCCTATGGTGCACCATCGTCTTCGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCa < 2:2472010/140‑1 (MQ=255) aCTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGGTTGGCGCGGGGCCGTTTATCCGGCTTTTGCAAAGTCTAt > 2:2049762/1‑140 (MQ=255) aCTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGCCGCGGGGCCGTTCATCCCACTTTTGCAAAGTCTAt > 2:3275272/1‑140 (MQ=255) tGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTg < 2:1271366/140‑1 (MQ=255) ttCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCt < 2:7032826/140‑1 (MQ=255) tCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTg > 2:5335232/1‑140 (MQ=255) ttGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATa > 1:4849959/1‑140 (MQ=255) tGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATaa < 1:6886257/140‑1 (MQ=255) ggTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAAc > 2:4265733/1‑140 (MQ=255) gTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGc < 1:1610322/131‑1 (MQ=255) gTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCATTGATCCTGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACt > 1:2104400/1‑140 (MQ=255) caccaTCGCCTTTGCTGTTGCGGCGTGGGCGCGCGTTGTCTCCAGCAGGCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTAcc < 2:3588867/140‑1 (MQ=255) caccaTCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTAcc < 1:4154751/140‑1 (MQ=255) caccaTCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTAcc > 2:1844539/1‑140 (MQ=255) ccaTCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTTTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCg < 1:3275272/140‑1 (MQ=255) ttGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTTATCCCGCTGTTGGAAATTCTATTGCAGAATGACTACCCGCCAGCCaaa > 2:1996268/1‑140 (MQ=255) gCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACg > 2:5951244/1‑140 (MQ=255) tcgtGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATcgc > 1:7455864/1‑140 (MQ=255) tcgtGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATcgc > 1:5993690/1‑140 (MQ=255) tcgtGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATcgc > 2:1629252/1‑140 (MQ=255) tcgtGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATcgc > 2:6390024/1‑140 (MQ=255) gtGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCgcgc > 1:4232858/1‑140 (MQ=255) gtGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCgcgc > 1:4396094/1‑140 (MQ=255) tGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGTTCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCt > 1:6142301/1‑140 (MQ=255) tGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCt > 1:1375420/1‑140 (MQ=255) tGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTC‑‑‑‑TGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCg < 2:4454663/140‑1 (MQ=255) ggCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTgg > 2:714521/1‑140 (MQ=255) cgcgtggtgTCTCCAGCAGCCTGAATATACTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCg > 2:6854677/4‑140 (MQ=255) tctcCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCg > 2:6291282/1‑140 (MQ=255) cagcagCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCGGCCAAACGCTCGATAGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGa > 1:2022380/1‑140 (MQ=255) agcagcCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGTTTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGAt < 1:1183190/137‑1 (MQ=255) agcagcCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATACCTACCCGCTAGCCAAAGGCTCGATCTCGCTTGCGTTGTGGTCGATGAc > 2:2093700/1‑140 (MQ=255) tGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGAtt > 2:177914/1‑140 (MQ=255) tGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGAtt > 2:7415777/1‑140 (MQ=255) tGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATCGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGCCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGAtt > 2:1886885/1‑140 (MQ=255) gAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTg < 1:6561498/140‑1 (MQ=255) aaTATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGAATGt < 1:5150626/140‑1 (MQ=255) atatGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTc > 1:1727783/1‑140 (MQ=255) cTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCATACGCTCGAACGCGCTGCCGTTGTGGACGATGACGGTGATTGTCGCGcc > 2:2350079/1‑140 (MQ=255) cTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGcc > 2:1510109/1‑140 (MQ=255) gATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCaa > 2:1033780/1‑140 (MQ=255) gATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCaa > 1:4055993/1‑140 (MQ=255) gATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCaa > 2:5499461/1‑140 (MQ=255) tcttctTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGGTCGATCGCGCTGTCGTTGTGGTCGAGGACGGTGATTGTCGCGCCAAtt > 2:2412022/1‑140 (MQ=255) tcttctTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAAtt > 1:7417021/1‑140 (MQ=255) tcttctTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCCGGCGTTGTGGTCGAGGACGGTGATTGTCGCGCCAAtt > 1:2587688/1‑140 (MQ=255) cttcttCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAAttt > 1:754592/1‑140 (MQ=255) ttcttcCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTg < 2:4062189/140‑1 (MQ=255) cttcCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGTCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCg > 2:4667483/1‑140 (MQ=255) cttcCGCGTGATTCAGGGGATTGTCACCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGt > 1:3761868/1‑126 (MQ=255) cttcCGCGTGATTCAGGGGATTGTCACCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGt < 2:3761868/126‑1 (MQ=255) ccGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGcc < 1:1287175/140‑1 (MQ=255) gcgTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTTGTCGATGCCGGCGAGTGTCGCACCAATTTGCGGCCCg > 1:3501228/1‑140 (MQ=255) gcgTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCg > 2:3955830/1‑140 (MQ=255) gcgTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCg > 1:1054808/1‑140 (MQ=255) gcgTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCg > 2:923911/1‑140 (MQ=255) gcgTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTACAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCg > 2:5796155/1‑140 (MQ=255) gcgTGATTCAGGGGATTGTCGCCAGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGGGTTGGGGTCGATGACGGTGATTGTCACGCCAAAGTGCGACCCg > 1:4697917/1‑140 (MQ=255) cgTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGGCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGa > 2:5156848/1‑140 (MQ=255) cgTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGTTCGATGAGGGTGATGGTCGCGGCAATTTGCGGCCCGa > 1:2847511/1‑140 (MQ=255) cgTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGAGGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGa > 1:2724231/1‑140 (MQ=255) cgTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGa > 2:6642040/1‑140 (MQ=255) tGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGTTGATTGTCGCGCCGATTTGCGGCCCGATc > 1:3101985/1‑140 (MQ=255) aTTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCt > 2:822262/1‑140 (MQ=255) aTTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCt > 1:5911661/1‑140 (MQ=255) tCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTcg < 1:7098320/140‑1 (MQ=255) tCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGGTGATCCCGCTTTCGCAAAGTCTATTTCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTcg < 2:2587688/140‑1 (MQ=255) tCAGGGGATTGTCGCCGAGCCGCTGATCCCGGTCTGGCAAAGTCTATTTCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTcg < 2:3501651/140‑1 (MQ=255) ggATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTcggcggg > 1:232924/1‑139 (MQ=255) ggATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTCCAACGTCTATTGCTGATTAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGt < 2:3087189/140‑1 (MQ=255) ggATTGTCGCCGGGCAGTTGATACCACTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGt < 1:3158939/140‑1 (MQ=255) ttGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTtat < 2:7474627/140‑1 (MQ=255) tGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCTAATTTGGGGCCCGATCCTCGGCGGTtata > 1:2455563/1‑140 (MQ=255) tGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCTAATATGGGGCCCGATCCTCGGCGGGtatt > 1:3675236/1‑139 (MQ=255) tGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGcc > 1:7349075/1‑122 (MQ=255) tGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTcggc > 2:7577520/1‑133 (MQ=255) tGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTcg < 1:6311489/131‑1 (MQ=255) tGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTtata > 2:5588508/1‑140 (MQ=255) tGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTtata > 2:6045086/1‑140 (MQ=255) gTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTatat < 1:6672617/140‑1 (MQ=255) gTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTatat < 2:6579839/140‑1 (MQ=255) cGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGCTTTATCa > 1:6792396/1‑140 (MQ=255) gCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAg < 2:3804815/140‑1 (MQ=255) gCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAg < 1:4984725/140‑1 (MQ=255) cGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCg < 1:1817021/140‑1 (MQ=255) cGGGCCGTTGATCCCGCTTTTGAAAAGTCTATTGCCGAATAACTACCCCCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCg < 2:2728189/140‑1 (MQ=255) gCCGTTGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCg < 1:5522768/137‑1 (MQ=255) tttGATCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAAtt < 1:6390024/139‑1 (MQ=255) tCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCAc < 2:495159/140‑1 (MQ=255) tCCCGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCAc < 2:219889/140‑1 (MQ=255) cccGCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACt < 1:1891886/140‑1 (MQ=255) gCTTTTGCAAAGTCTGTTGCTGCATGACTTCCCGCCACCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTggg < 1:2412022/140‑1 (MQ=255) gCTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTggg < 1:3955830/140‑1 (MQ=255) cTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCAc < 1:785451/135‑1 (MQ=255) cTTTTGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTgggg < 2:1364544/140‑1 (MQ=255) | GGAAGTGAAACTGTTCCTTTGGTCCACCATCGCCTTTGCTATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGATTCAGGGGATTGTCGCCGGGCCGTTGATCCCGCTTTCGCAAAGTCTATTGCTGAATAACTACCCGCCAGCCAAACGCTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGG > NC_000913/2812846‑2813118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |