| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,910,815 | T→C | T93A (ACA→GCA) | mazF ← | endoribonuclease toxin MazF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 2,910,815 | 0 | T | C | 99.5% | 2237.3 / NA | 611 | T93A (ACA→GCA) | mazF | endoribonuclease toxin MazF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); major base C (339/266); minor base A (1/2); total (342/269) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 618 total aligned reads displayed.
GATTCATTGAATTGTCCTGAAAATTGCGGGTCTGTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACAC > NC_000913/2910679‑2910951 | ttGTCCTGAAAATTGCGGGTCTGTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGCTCCTTTCTTCGTTg < 2:6762907/140‑1 (MQ=255) ttGTCCTGAAAATTGCGGGTCTGTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGCACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGCTCCTTTCTTCGTTg < 2:3808339/140‑1 (MQ=255) tGTCCTGAAAATTGCGGGTCTGTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGc > 2:5503258/1‑140 (MQ=255) tGTCCTGAAAATTGCGGGTCTGTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGc < 1:1016046/140‑1 (MQ=255) 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gggTCTGTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCa < 1:4196055/140‑1 (MQ=255) cTGTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCg < 1:5603286/140‑1 (MQ=255) tGTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGa < 1:4936073/140‑1 (MQ=255) tGTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGa < 1:3957679/140‑1 (MQ=255) gTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGAt > 2:6585826/1‑140 (MQ=255) aCCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCt > 1:7330121/1‑140 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1:5187855/1‑140 (MQ=255) tcaggggCAACTGCTCCTTTCTGCGATGCCCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACa < 1:2871273/137‑1 (MQ=255) gggCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGa > 1:4049414/1‑140 (MQ=255) ggCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGaa < 2:1312052/140‑1 (MQ=255) ggCAACTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGaa < 2:4376832/140‑1 (MQ=255) aaCTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATGTCCATTCGATTGCTTTGTACaactgtctc > 1:3344705/1‑133 (MQ=255) aCTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAATGGAGATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAacaca > 2:3379658/1‑140 (MQ=255) aCTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAacaca > 1:6069875/1‑140 (MQ=255) aCTGCTCCTTTCTTCCTTGCTCCTCATGCTCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAacaca < 1:2476707/140‑1 (MQ=255) cTGCTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAacacac < 1:3773410/140‑1 (MQ=255) | GATTCATTGAATTGTCCTGAAAATTGCGGGTCTGTCAGGTGGAAACCTGTGACCAGAATAGAAGTGAGTTAGTAACACTACCCAATCAGTACGTTAATTTTGGCTTTAATGAGTTGTAATTCCTCTGGGGCAACTGTTCCTTTCTTCGTTGCTCCTCTTGCCCGCCAGGCGATACTTTTTACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACAC > NC_000913/2910679‑2910951 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |