| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,085,268 | A→G | G185G (GGT→GGC) | fdoG ← | formate dehydrogenase O subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,085,268 | 0 | A | G | 99.3% | 1585.3 / NA | 437 | G185G (GGT→GGC) | fdoG | formate dehydrogenase O subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (217/214); minor base C (0/3); total (217/220) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 443 total aligned reads displayed.
ATCACCACGACGAGGTTGGCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATACCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTGCGCAATGTAGTTAGCATCGCGGT > NC_000913/4085137‑4085404 | aTCACCACGACGAGGTTTGCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCCTCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGAC‑TGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAgcgcg < 2:3203140/140‑1 (MQ=18)aTCACCACGACGAGGTTGGCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAgcgc > 1:4674163/1‑140 (MQ=255) tCACCACGACGAGGTTGGCGTTCTTGATGTCGCCCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAgcgcg < 1:5117950/140‑1 (MQ=255) tCACCACGACGAGGTTGGCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAgcgcg < 1:153363/140‑1 (MQ=255) ccacGACGAGGTTGGCGGTCTTGATGTCGACCCAGCGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCgg < 2:2366735/140‑1 (MQ=255) gacgaGGTTGGCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGgaga > 1:907561/1‑140 (MQ=255) aGGTTGGCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAAttt < 2:6039695/140‑1 (MQ=255) aGGTTGGCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAAttt > 1:3805053/1‑140 (MQ=255) ttGGCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTTCCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTg > 1:6326312/1‑140 (MQ=255) ttGGCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTg < 2:6631555/140‑1 (MQ=255) tGGCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGc > 2:6358187/1‑140 (MQ=255) ggCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCg > 2:1418755/1‑140 (MQ=255) gCGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGt > 2:1621315/1‑140 (MQ=255) cGTTCTTGATGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCTACCTCGAACATGCCCAGCGCGAGGGAGAATTTTTGCGtt > 2:2292202/1‑140 (MQ=18) tGTCGACCCAGTGGTTGGTCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCg > 2:760563/1‑140 (MQ=255) gACCCAGTGGTTGGTCACCGCACCGCGACCATATGTTGGTGCAAGACTAGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGttt < 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ggtCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGTAGACTTTGTGCGTTAAGTAGCGGGTTTCGTTACTCGAcg > 2:2639129/1‑140 (MQ=21) ggtCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGAcg < 1:1639739/140‑1 (MQ=255) ggtCATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGAcg > 1:661662/1‑140 (MQ=255) cATCGCACCGCGACCTAATGTTGGAACAAGACTTGCTGCCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCgg < 1:3702490/140‑1 (MQ=255) cATCGCACCGCGACCAGTTGTTGGAGCAAGTTTGGTTGCCGTTGGTCCCTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGTGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTTGTTACTCGACGCgg < 2:3646046/140‑1 (MQ=255) cATCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCCCGCGGGAGTATTCTTGCGTTAAATACCCGGTTTCGTTACTCGACGCgg > 2:3032769/1‑140 (MQ=21) tCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGaa > 1:6438508/1‑140 (MQ=255) tCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGaa > 1:4380653/1‑140 (MQ=255) tCGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGaa > 2:5285511/1‑140 (MQ=255) cGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAg > 2:6260993/1‑140 (MQ=255) cGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAg < 2:4183927/140‑1 (MQ=255) cGCACCGCGACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAg > 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cgcgACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCTACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGCTAAATAGCCGGCTTCGTTACTCGACGCGGAAGcacac > 1:2414536/1‑140 (MQ=255) gcgACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGcacaca > 2:1241742/1‑140 (MQ=255) cgACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAg < 1:760563/140‑1 (MQ=255) cgACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAg < 1:170888/140‑1 (MQ=255) cgACCAAATGTTGGAGCAAGACTTGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAg < 1:4278653/140‑1 (MQ=255) gACCAAATGTTGGAGAAAGACTCGCAACCATTGGTCCCTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGc < 1:2267404/140‑1 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tGCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGt < 2:1838503/140‑1 (MQ=255) gCTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGtt > 2:7214228/1‑140 (MQ=255) cTACCGTTGGTCCGTGTCAGACTCGCGCCTGCTTGTCGACCGCGAGCACGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTa < 2:1921874/140‑1 (MQ=255) cTACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCAGGTGGAGAGCCAGCGGTTa > 2:730780/1‑140 (MQ=255) tACCGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTaa < 2:5363178/140‑1 (MQ=255) cGTTGGTCCGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGGCAGCGGTTAACAg > 2:7035873/1‑140 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ccGTGTCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGcc > 2:4796899/1‑140 (MQ=255) tgtCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGCAGCACACAACATCCCGATGGAGAGCGAGCGGTTAACAGTCACGCCTTc > 2:2570258/1‑140 (MQ=255) tgtCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGGGCGAGCGGTTAACAGTCACGCCTTc > 1:3432829/1‑140 (MQ=255) tgtCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTc > 1:6674886/1‑140 (MQ=255) tgtCAGACACGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTc > 1:6992545/1‑140 (MQ=255) acacGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGtt < 2:4963958/140‑1 (MQ=255) acacGCGCCTGGTTGCCGACCGCGACCATCCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGtt < 1:2067217/140‑1 (MQ=255) acGCGCCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCAGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGtttt < 1:730780/140‑1 (MQ=255) gcgcCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTgc > 1:4085231/1‑140 (MQ=255) gcgcCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTgc > 2:686144/1‑140 (MQ=255) gcgcCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTgc < 1:7392602/140‑1 (MQ=255) cgcCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGtttt > 2:34885/1‑137 (MQ=255) cgcCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTgcg < 1:4796899/140‑1 (MQ=255) cgcCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTgcg < 1:6733243/140‑1 (MQ=255) cgcCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTgcg < 2:1329396/140‑1 (MQ=255) cgcCTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTgc > 1:610729/1‑139 (MQ=255) cgcCTGGTTGTCGACAGCGAGCATGTCCAGCGCGCGGTAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTgcg < 1:3529455/140‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTCGACCGTGAGCATGCCAAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTGCGCa < 1:3319593/140‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTGCGCa < 1:5209057/140‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTGCGCa < 1:5357994/140‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTGCGCa < 1:1241742/140‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTGCGCa < 1:1820218/140‑1 (MQ=255) tGGTTGTCGACCGCGTGCATGCTCAACGCACGGGAGAGTTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTGCGCAAt < 1:2528847/140‑1 (MQ=255) gTCGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGATTAACAGCCACGCCTTCGGCGGTTTGCGCAATGTAGt > 1:1926014/1‑140 (MQ=255) cGACCGCGAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTGCGCAATGTAGTTa > 2:4330945/1‑140 (MQ=255) cgAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGGGTCTTGCGCCATGTAGTTAGCATcg > 1:2671517/1‑140 (MQ=255) cgAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTgcg < 1:7142991/123‑1 (MQ=255) cgAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTGCGCAATGTAGTTAGCATcg > 1:4513524/1‑140 (MQ=255) gAGCATGCCCAGCGCGCGGGAGAATTTTTGCGTTAAATAGCCGGTTTCGTTACTCGACGCGGAAGCACACAGCATCCCGGTGGAGAGCCAGCGGTTAACAGTCACGCCTTCGGCGTTTTGCGCAATGTAGTTAGCATcgc < 2:4032115/140‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |