Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,494,288 | C→A | C40F (TGC→TTC) | idnD ← | L‑idonate 5‑dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,494,288 | 0 | C | A | 99.9% | 2547.8 / NA | 723 | C40F (TGC→TTC) | idnD | L‑idonate 5‑dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base A (335/384); minor base G (1/0); total (337/386) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 736 total aligned reads displayed.
CTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTC > NC_000913/4494151‑4494422 | aCCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAGATTACCTAGTTTGCCTACCTGATAAAAATGAAAATCGGAACCGAAAAt > 2:2053910/1‑140 (MQ=255) aCCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGAAAAt > 1:7184322/1‑140 (MQ=255) aCCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGAAAAt > 2:3970389/1‑140 (MQ=255) aCCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGCAACCGAAAAt > 1:5691377/1‑140 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |