Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,536,190 | T→C | intergenic (+159/+424) | yjhR → / ← nanS | KpLE2 phage‑like element; PLD‑like domain‑containing protein YjhR/N‑acetyl‑9‑O‑acetylneuraminate esterase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_000913 | 4,536,190 | 0 | T | C | 99.3% | 1944.3 / NA | 584 | intergenic (+159/+424) | yjhR/nanS | KpLE2 phage‑like element; PLD‑like domain‑containing protein YjhR/N‑acetyl‑9‑O‑acetylneuraminate esterase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base C (170/407); minor base G (3/1); total (173/411) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.13e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 721 total aligned reads displayed.
ACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGG > NC_000913/4536053‑4536326 | aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACTTAATCATTATCCATTGAATAATGCGCCTGGTATTAATGGCGGGCGCtt > 2:2556322/1‑140 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGCGCtt > 1:4248972/1‑140 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGCGCtt > 1:270557/1‑140 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGCGCtt > 1:6287198/1‑140 (MQ=255) 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2:475639/1‑140 (MQ=255) ccTGGGATTAATGGCGGGCGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAAc < 1:2556322/140‑1 (MQ=255) tGGGATTAATGGCGGGCGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACgg < 2:5334073/140‑1 (MQ=255) tGGGATTAATGGCGGGCGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACgg < 1:6331470/140‑1 (MQ=255) tGGGATTAATGGCGGGCGCTTTCAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATGATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACgg < 2:2473915/140‑1 (MQ=255) tGGGATTAATGGCGGGCCCTTTAAGGAATGAAAGAAAATACAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACgg < 2:2393669/140‑1 (MQ=255) tGGGATTAATGGCGGCCGCTTTCAGCAATGAAAGAAATTGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACgg < 1:3381685/140‑1 (MQ=255) ttAATGGCGGGCGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCatat < 2:3875678/140‑1 (MQ=255) ggcgggcgCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGa < 1:1638601/140‑1 (MQ=255) ggcgggcgCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGa < 1:6782184/140‑1 (MQ=255) ggcgggcgCTTTTAGCAATGAACGACAATCCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGa < 1:2007698/140‑1 (MQ=255) | ACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGG > NC_000913/4536053‑4536326 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |