| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,501,651 | A→G | K30K (AAA→AAG) | tehB → | tellurite methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,501,651 | 0 | A | G | 99.0% | 1514.8 / ‑4.9 | 415 | K30K (AAA→AAG) | tehB | tellurite methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/3); new base G (228/182); total (229/186) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 423 total aligned reads displayed.
GTTAGTCAGAACCGAGCGCGCCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGT‑‑‑‑‑CGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAA > NC_000913/1501514‑1501786 | tCAGAACCGAGCGCGCCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAGCCGGGTa < 1:124781/140‑1 (MQ=255) cAGAACCGAGCGCGCCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAGCCGGGTaa < 1:6338032/140‑1 (MQ=255) cAGAACCGAGCGCGCCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAGCCGGGTaa < 2:4585361/140‑1 (MQ=255) cAGAACCGAGCGCGCCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGGAAGCGGTGAAAGCGGTTAAGCCGGGTaa > 1:4443992/1‑140 (MQ=255) aaCCGAGCGCGCCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAGCCGGGTAAAAc > 1:5469511/1‑140 (MQ=255) aaCCGAGCGCGCCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAGCCGGGTAAAAc > 2:5155151/1‑140 (MQ=255) ccGAGCGCGCCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAGCCGGGTAAAACGc < 2:252867/140‑1 (MQ=255) ccGAGCGCGCCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAGCCGGGTAAAACGc < 1:5303963/140‑1 (MQ=255) aGCGCGCCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAGCCGGGTAAAACGc < 1:1019589/137‑1 (MQ=255) gcgcgcCGTTTTAATGAAAGCAGAGGACAAAGAATGATCATTCGTGACGAAAACTATTTTACTGATAAATATGAATTAACCCGCACACACTCTGAAGTACTGCAAGCGGTGAAATTGGTTAAGCCGGGTAAAACGCTGGa > 1:3241987/1‑140 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |