| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,614,700 | T→C | T2A (ACC→GCC) | sad ← | NAD(+)‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,614,700 | 0 | T | C | 99.4% | 1313.8 / ‑6.1 | 356 | T2A (ACC→GCC) | sad | NAD(+)‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (109/245); total (110/246) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 358 total aligned reads displayed.
CTCGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCG > NC_000913/1614563‑1614836 | ctcGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCa > 2:7503200/1‑140 (MQ=255)ctcGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCa > 2:4838755/1‑140 (MQ=255)ctcGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCa > 2:1742515/1‑140 (MQ=255)ctcGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCa > 1:3417202/1‑140 (MQ=255) tcGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCAt > 2:802595/1‑140 (MQ=255) tcGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCAt < 1:7205679/140‑1 (MQ=255) tcGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCAt > 1:1713028/1‑140 (MQ=255) tcGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGACTTATCGAAATTACAAGAGTTGCCGGAGTAATGGCCAt > 1:2006963/1‑140 (MQ=255) tcGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTCGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCAt > 2:1140829/1‑140 (MQ=255) cgcgCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATc < 2:6567286/140‑1 (MQ=255) cgcgCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATc < 1:5472541/140‑1 (MQ=255) cgcgCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATc < 1:459649/140‑1 (MQ=255) cgcgCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATc < 1:2910336/140‑1 (MQ=255) cgcgCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATc < 2:7058823/140‑1 (MQ=255) gcgcCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCTTGCGTTGCCGGAGTAATGGCCATCg > 1:3457036/1‑140 (MQ=255) gcgcCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCg > 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aGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTa < 1:802595/140‑1 (MQ=255) aGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTa < 2:63650/140‑1 (MQ=255) gTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTTCGTTTTCAATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTAt < 2:2657191/140‑1 (MQ=255) gTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTAt < 2:1580392/140‑1 (MQ=255) gAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCt < 2:1526540/140‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTa < 1:240135/140‑1 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tgcCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCATGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCa < 2:4564921/140‑1 (MQ=255) tgcCGCCAGCTGAAGTGCGTTTGCGATATTGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCa < 1:2195649/140‑1 (MQ=255) cgccAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATgg < 1:1836407/140‑1 (MQ=255) ccAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAGTTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTa < 1:4231796/140‑1 (MQ=255) ccAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCa > 1:5242709/1‑135 (MQ=255) ccAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTa < 2:1699813/140‑1 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caggttgttCACCCGTGGCAGGATTTATCTAAATTGCCTGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACt < 1:2460550/137‑1 (MQ=255) aaaGTTGTTCACCCGTGGCACGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACt > 2:4892936/1‑140 (MQ=255) cACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGa < 1:1023118/140‑1 (MQ=255) ccGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATc > 2:6926235/1‑140 (MQ=255) ccGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATc > 1:7151926/1‑140 (MQ=255) ccGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATc < 1:4741509/140‑1 (MQ=255) tGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCgag < 1:6926235/140‑1 (MQ=255) gCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGa > 2:4771965/1‑132 (MQ=255) gCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGaa < 1:497622/140‑1 (MQ=255) gCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGACCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGaa < 2:3457036/140‑1 (MQ=255) aTTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCGACATATTCAAGAATCGAGAATGCTa > 1:3591644/1‑140 (MQ=255) aTCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGaa < 2:5878300/131‑1 (MQ=255) 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gCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGAc > 1:7513106/1‑128 (MQ=255) cGGAGTAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGt > 2:3841589/1‑140 (MQ=255) tAATGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATGGAGAATGTTATGGATCAGACCAGACTGGAGATGTTCAAc > 2:3227022/1‑140 (MQ=255) aTGGCCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGTGAAGGCTATGGATCTGCCCCAGCTGGAGATGTTCAAcgc > 2:2458954/1‑140 (MQ=255) | CTCGCGCCAGTCGCGAAAGCCTGCTGCCGCCAGCTGAAGTGCGTTTTCGATATCGTCAGCGCCAGCCCACGGCAGCACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCG > NC_000913/1614563‑1614836 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |