| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,635,322 | C→T | E176K (GAA→AAA) | ydfN ← | Qin prophage; putative side tail fiber assembly protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,635,322 | 0 | C | T | 98.9% | 452.6 / ‑5.0 | 174 | E176K (GAA→AAA) | ydfN | Qin prophage; putative side tail fiber assembly protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (63/109); minor base A (1/1); total (64/110) | |||||||||||
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Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CGTGTTCGTGCCACCAAATGCACCGGAACTCTTGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTGGTTCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTCCGTCCCCAAATCCGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTGTGCGATTTAATGCCGTCCTGTTCCT > NC_000913/1635185‑1635387 | cGTGTTCGTGCCACCAAATGCACCGGAACTCTTGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTAGATTTAGAGCCATAATCAAACAACGATGTGGTTTTCg > 1:2638466/1‑140 (MQ=255) tgtTCGTGCCACCAAATGCACCGGAACTCTTGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTc > 2:6232127/1‑140 (MQ=255) tgtTCGTGCCACCAAATGCACCGGAACTCTTGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTACCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTc > 1:4410867/1‑140 (MQ=255) ttCGTGCCCCCAAATGCACCGGCACTCTTGTTTTGGTGCGCACCGGCAATATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTccc < 2:3611163/140‑1 (MQ=21) 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2:4532783/129‑1 (MQ=11) gTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATg > 1:4532783/1‑129 (MQ=11) tCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCTCCGGTGTTATTAGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATGCCGTCCTGTTcc < 1:2481101/140‑1 (MQ=11) tCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTTTTACTCGAGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATGCCGTCCTGTTcc < 2:2588179/140‑1 (MQ=11) tCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATGCCGTCCTGTTcc < 1:5259378/140‑1 (MQ=11) tCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATGCCGTCCTGTTcc < 2:529439/140‑1 (MQ=11) tCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATGCCGTCCTGTTcc < 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2:1857786/1‑139 (MQ=11) cccGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTCGGTGTGTGATTTAATGCCGTCCTGTTCCt > 1:2282461/1‑140 (MQ=14) | CGTGTTCGTGCCACCAAATGCACCGGAACTCTTGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTGGTTCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTCCGTCCCCAAATCCGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTGTGCGATTTAATGCCGTCCTGTTCCT > NC_000913/1635185‑1635387 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |