| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,192,444 | (T)7→8 | coding (237/630 nt) | yqiJ → | putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,192,437 | 1 | . | T | 92.3% | 248.5 / 11.5 | 78 | coding (230/630 nt) | yqiJ | putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/4); new base T (42/30); total (44/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GG‑TT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGCATTATACCGGTA > NC_000913/3192299‑3192565 | gCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GG‑t < 2:635126/140‑1 (MQ=255)gCGGGCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACAACTTGACCATTATGAATCTATAACCACAGGTTATAATAGACAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTGTCCTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GG‑t < 2:167222/140‑1 (MQ=255) aTGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GG‑tt‑tttt‑ttg < 1:390042/140‑3 (MQ=255) tcCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTa > 2:525232/1‑140 (MQ=255) cGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTAtt > 1:333758/1‑140 (MQ=255) gCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCa < 2:396808/140‑1 (MQ=255) gCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGATCTCGTCGGTCTCTGCTTACTGGCTAGT‑TT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCa > 2:210571/1‑140 (MQ=255) caTCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTgcag > 1:36906/1‑139 (MQ=255) caTCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTgcag < 2:36906/139‑1 (MQ=255) gACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCt < 2:49165/140‑1 (MQ=255) gACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCt > 2:97700/1‑140 (MQ=255) ttATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGcatc > 1:42921/1‑140 (MQ=255) ttATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGcatc < 1:346669/140‑1 (MQ=255) ttATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGACACCCTGTTCCAGCATGCCTGcatc > 1:232423/1‑140 (MQ=255) tATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGcatca > 2:497785/1‑140 (MQ=255) aTGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TTGTCTTATTGGCTTCCTGTTGCAGCATGCCTGcatcat > 1:305463/1‑140 (MQ=255) aTGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGcatcat > 1:404074/1‑140 (MQ=255) tGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGATCTTATTTGCATCCGGTTGCAGCATGCCTGCATCATg > 1:295911/1‑140 (MQ=255) cTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTg < 2:134722/140‑1 (MQ=255) tataACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTgg > 2:460868/1‑140 (MQ=255) ataACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGc > 2:429535/1‑140 (MQ=255) taACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCa > 1:559076/1‑140 (MQ=255) taACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCa > 2:27905/1‑140 (MQ=255) taACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GG‑TT‑TTTTATGGTCTTATTGGAATCGTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCa > 2:213242/1‑140 (MQ=255) acaGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATcac < 2:588619/140‑1 (MQ=255) caGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGt < 2:401610/128‑1 (MQ=255) caGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGt > 1:401610/1‑128 (MQ=255) caGGTCATATTAGCCAAGCACTCCATTATCTAAATATTGGAAGATTGCAAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATcacc < 2:305463/140‑1 (MQ=255) aGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATcacca > 1:374734/1‑140 (MQ=255) ggTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCa < 2:354284/132‑1 (MQ=255) ggTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCa > 1:354284/1‑132 (MQ=255) atTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGa > 2:412068/1‑140 (MQ=255) gCCAGGCACTTCATTTTCTCAATATCGGAGGATTGCCTGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCt < 1:245987/140‑1 (MQ=255) gCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCg > 2:347059/1‑140 (MQ=255) gCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCg > 2:470468/1‑140 (MQ=255) gCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATAACCACTGTCGAACCTGTTCg < 1:128280/140‑1 (MQ=255) gCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGACTGGCATTCACCACTGTCGAACCTGTTCg > 1:275595/1‑140 (MQ=255) tCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCTTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGtt > 2:435448/1‑140 (MQ=255) tCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGGTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGtt > 1:475044/1‑140 (MQ=255) aTTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTcc < 1:429535/140‑1 (MQ=255) cAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCTATCACCACTGTCGAACCTGTTGGTGGTTCCTGTCAGt > 1:327877/1‑140 (MQ=255) cAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGt > 1:397131/1‑140 (MQ=255) cAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGt < 2:374734/140‑1 (MQ=255) cAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGt > 1:507607/1‑140 (MQ=255) cAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGt > 1:74998/1‑140 (MQ=255) cAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGCCAAGCGCCACTGTCGAACCTGGACGTGGTTCCTGTCAGt > 2:320934/1‑140 (MQ=255) atatTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGttt > 1:524741/1‑140 (MQ=255) aatTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTa < 2:392969/139‑1 (MQ=255) ggAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTg > 1:485735/1‑128 (MQ=255) ggAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTg < 2:630821/128‑1 (MQ=255) ggAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTg < 2:485735/128‑1 (MQ=255) ggAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTg > 1:630821/1‑128 (MQ=255) gAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGtt < 2:42921/140‑1 (MQ=255) gAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGtt < 2:572419/140‑1 (MQ=255) aaGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGttt > 1:442039/1‑140 (MQ=255) ttGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGa > 2:633322/1‑140 (MQ=255) ttGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAAACACCACTGGCGAACCTATTCGTGGTACCTGACAGTTTACTGTTTACGa > 2:244930/1‑140 (MQ=255) tGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTTGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGat < 2:605984/140‑1 (MQ=255) ccAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGatta > 2:118583/1‑140 (MQ=255) gCTCTCGTCGTTCTCTGGTTACCGGCT‑GG‑TTATTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTg < 2:232423/140‑1 (MQ=255) gCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTg < 1:470468/140‑1 (MQ=255) tctcTTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCg < 1:435448/140‑1 (MQ=255) tctcGTCGTTCTCTGTTTACTGGCT‑GG‑TTGTTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCg < 1:302497/140‑1 (MQ=255) tctcGTCGTTCTCTGTTTACTGCCT‑AG‑TTGTTTT‑TGGCCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCg < 1:302888/140‑1 (MQ=255) tctcGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCg < 1:412068/140‑1 (MQ=255) tctcGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCg < 2:483184/140‑1 (MQ=255) tctcGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCg < 2:524741/140‑1 (MQ=255) tctcGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCg < 1:634582/140‑1 (MQ=255) tctcGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTACCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCg < 2:89910/140‑1 (MQ=255) cctcGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCAGCACTGCCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGCTTACGATTATTGCg < 2:359581/139‑1 (MQ=255) tcgtcgTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGt > 2:346923/1‑140 (MQ=255) tcgtcgTTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGt < 2:565328/140‑1 (MQ=255) gtcgtTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGc > 2:503967/1‑140 (MQ=255) gtcgtTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGc > 2:549481/1‑140 (MQ=255) tcgtTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGCa < 2:368357/140‑1 (MQ=255) tcgtTCTCTGCTTACAGGCTGGG‑TT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGCa < 1:228400/140‑1 (MQ=255) cgtTCTCTGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGCAt < 1:97700/140‑1 (MQ=255) ctGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGCATTATAcc > 2:613206/1‑140 (MQ=255) ctGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGCATTATAcc > 2:486777/1‑140 (MQ=255) tGCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGCATTATACCg > 2:114292/1‑140 (MQ=255) gCTTACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGCATTATACCgg < 1:525232/140‑1 (MQ=255) ttACTGGCT‑GGTTT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGATTCCTGTCCGTTTACTCTTTACGATCATTGCGGTGCATTATACCGGTa > 2:228400/1‑140 (MQ=255) | GCGGTCACATGCTCTCCGGTGCTCTTGATGCACATCTTGACCATTATGATTCTATAACCACAGGTCATATTAGCCAGGCACTTCATTATCTCAATATTGGAAGATTGCCAGCTCTCGTCGTTCTCTGCTTACTGGCT‑GG‑TT‑TTTT‑TGGTCTTATTGGCATCCTGTTGCAGCATGCCTGCATCATGGTCTGGCAATCACCACTGTCGAACCTGTTCGTGGTTCCTGTCAGTTTACTGTTTACGATTATTGCGGTGCATTATACCGGTA > NC_000913/3192299‑3192565 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |