| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,857,096 | Δ2,538 bp | coding (4‑2541/2562 nt) | mutS → | DNA mismatch repair protein MutS |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2857096 | 2859633 | 2538 | 57 [0] | [0] 59 | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2857095 | 0 (0.000) | 57 (1.440) | 42/278 | 0.1 | 100% | coding (3/2562 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
| ? | NC_000913 | 2859634 = | 0 (0.000) | coding (2542/2562 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS | |||||
CATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2856964‑2857095‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACA > NC_000913/2859634‑2859771 CATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAA < 2:590324/140‑1 AGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCC < 2:55941/140‑1 AGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCC < 2:42302/140‑1 GCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTA > 2:534930/1‑140 CGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAAT > 1:618332/1‑140 TTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAA < 1:610338/140‑1 CCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATA < 1:374283/140‑1 GATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTG < 2:336874/140‑1 CTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCG > 2:67785/1‑140 CGGTATCATGTGCGCCTCATGTCATTACAACTAAAATAACAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGA < 2:322742/140‑1 TATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTGTCGGGAATA > 2:441253/1‑140 TATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATA < 2:522375/140‑1 TATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATA > 1:522375/1‑140 TCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACGCCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATT < 2:618332/140‑1 TGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGA > 1:67212/1‑140 CGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAAGTCCCGATCGTCTTTGGCTATCGGGAATATTAACGACA > 1:171404/1‑140 GCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAA > 2:554100/1‑140 CTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACT > 2:602018/1‑140 ATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGAC > 2:472882/1‑140 GATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAAT < 2:572537/140‑1 ATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATA > 2:548902/1‑140 ATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATA > 2:517485/1‑140 TTACAACGAAAATAACAACCATGACGCCCGATTTAATTTCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAA < 1:314442/140‑1 TACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTGCCGATAGTTTTTGGCTGTCGGGAATATTAAGGACAACTGACGAATAAA > 2:176506/1‑140 TACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAA > 2:21183/1‑140 TACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTGGCTTTCGGGAATCTTAAGTACAACTGACGAATAAA > 2:308788/1‑140 gCAACGAATATAAAAACCATCACAACCAATTTAATATCAGAGAACGGGACATAACCCCATGCGCTTGAAAAGCCTGGTGTAATAACAATCCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATCAAA < 2:402835/139‑1 ACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATAATAACGACAAATGACGAATAAAATAA > 1:209190/1‑140 AAAATAAAAACCATCGCACCCCGTTCAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAA < 1:308788/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 1:621597/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 1:21183/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 2:590750/140‑1 TAAAAACCATCACACTCCATTTAATATCATGGAACCGTACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:225089/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 2:336698/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 2:157096/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:67785/140‑1 AAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCC > 2:435505/1‑140 ACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTTACGAATAAAATAAAAACACCCTGTA < 1:504637/140‑1 CCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAA > 2:110903/1‑140 CCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTATTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAA > 1:563791/1‑140 ATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCT < 1:548902/140‑1 ATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTT > 2:648538/1‑140 ATCAGGGAACCGGACATCACCCTATGCGCTTCAAGTGCCAGGTGTAATCACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTA < 2:192765/140‑1 ATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTA < 1:648538/140‑1 AGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAACAAAAACACCCTGTAGAATAGGTAAGCTTATTTTACAG > 1:318273/1‑140 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGG > 2:410391/1‑140 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGG > 1:27214/1‑140 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGG > 2:612239/1‑140 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGA > 2:91157/1‑124 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGA < 1:91157/124‑1 GGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATACAAACACCGTGTGTAATAGGAACGCTTATTTTACAGGG > 1:214489/1‑140 GGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAAC > 1:475904/1‑140 ACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCTTGTATAAAAGGCAAACTTATTTTACAGGGTAAAACCA > 1:238794/1‑140 ATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATG < 1:612239/140‑1 AACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCC > 1:84188/1‑140 CATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTA > 1:50591/1‑140 TGCGCTTGAAGAGCCCGGTGTACTATCAACTCCCGATCGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACA < 1:176506/140‑1 CATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2856964‑2857095‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACA > NC_000913/2859634‑2859771 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |