Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,639,721 | A→G | intergenic (‑1/‑390) | uspB ← / → uspA | putative universal stress (ethanol tolerance) protein B/universal stress global stress response regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,639,721 | 0 | A | G | 95.6% | 293.4 / ‑1.9 | 92 | intergenic (‑1/‑390) | uspB/uspA | putative universal stress (ethanol tolerance) protein B/universal stress global stress response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/2); new base G (44/43); total (47/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
CAACATATTGATAGAGCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATACCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCTATAGA > NC_000913/3639588‑3639851 | cAACATATTGATAGAGCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGcctcct > 1:522671/1‑140 (MQ=255) ttGATAGAGCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGc > 1:133931/1‑140 (MQ=255) ttGATAGAGCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGc > 1:620294/1‑140 (MQ=255) agagCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCCTATCATGCCCCCTCCCCGGCGACCt > 1:293838/1‑140 (MQ=255) gagCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTg > 2:156348/1‑140 (MQ=255) gagCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTg > 1:638807/1‑140 (MQ=255) gagCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTg > 1:611622/1‑140 (MQ=255) gagCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAAGGCGACGGTGCTCATCATGCCTTCTCCCCGGCGACCTg > 1:257065/1‑140 (MQ=255) gagCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAACCCCAAAATAATGAGACGGTGCTTATGATGCTTCCTCCCCGGCGACCTg > 2:226929/1‑140 (MQ=255) agCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGc > 1:606353/1‑140 (MQ=255) gCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGcc > 2:47639/1‑140 (MQ=255) cAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATTCCTCCTACCCGGCGACCTGccc > 1:228543/1‑140 (MQ=255) cAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCAACGGTGCATATGATACCTCCTGCCCGGCGACCTGccc > 1:282451/1‑140 (MQ=255) aaTGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCcg < 2:449863/140‑1 (MQ=255) tGGATCGCTGTTACGCAATACCCCTAACAACGCCCCTAGTGATGAGAATTAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCcgcg < 2:312677/140‑1 (MQ=255) tGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCcgcg > 2:102895/1‑140 (MQ=255) tGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCcgcg > 2:514593/1‑140 (MQ=255) cGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACGATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGtt > 2:333194/1‑140 (MQ=255) cGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTTCTTTTCATGCCTCCTCCCCGGAGACCTGCCCGCGGAGtt > 2:224396/1‑140 (MQ=255) cGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGtt > 2:524766/1‑140 (MQ=255) cGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAACGCGACGGTGCTTTTCATGCCTCCTCACCGGAGACCTGCCCGCGGAGtt > 2:244918/1‑140 (MQ=255) cAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTcc > 1:382513/1‑140 (MQ=255) ttACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCAcc > 1:342343/1‑140 (MQ=255) aCGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCGCCGACGACCTGCCCGCGGAGTTCCAcccc > 1:255794/1‑140 (MQ=255) tACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCt > 2:580865/1‑140 (MQ=255) tACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCt > 1:447646/1‑140 (MQ=255) tACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTACCCGCGGATTTCCACCCCTGGGCt > 2:335815/1‑140 (MQ=255) aacGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCg > 1:13657/1‑140 (MQ=255) cgcgcgTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGAt > 2:476176/1‑140 (MQ=255) cgcgcgTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGAt < 2:631618/140‑1 (MQ=255) gcgcgTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATa > 2:347898/1‑140 (MQ=255) gcgcgTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATACCTCCTCGCCGGCGACGTGCTCGCAGAGTTCCAGCCCGGGGCTACCGCTCCCGATa > 2:189435/1‑140 (MQ=255) gcgcgTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATACCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGCGTTACAGCCCGGGGCTACCGCTCCCGATa > 1:267391/1‑140 (MQ=255) gcgTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACg > 1:431583/1‑140 (MQ=255) cgTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGc > 1:65411/1‑140 (MQ=255) cgTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGc < 2:623161/140‑1 (MQ=255) gatgaGAAATAGCGCGCCATGTTAATAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCaa < 2:517969/140‑1 (MQ=255) gatgaGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCaa < 1:524766/140‑1 (MQ=255) atgaGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAAt < 2:65411/140‑1 (MQ=255) atgaGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAAt < 1:133879/140‑1 (MQ=255) atgaGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCCGCCCGCGGGGTTCCACCCCGGGGCTACCGCCCCCGATACGCTGCCAAt > 2:220608/1‑140 (MQ=255) atgaGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAACGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAAt < 1:607946/140‑1 (MQ=255) gaAATAGCGCGCCATTTTAACAATGAAAACGACACATCAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGt < 1:220608/140‑1 (MQ=255) gaAATAGCGCGCCATGTCAACAATGCAAACGACACTTAACGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATACCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGt < 2:267391/140‑1 (MQ=255) aaaTAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGtt < 1:610242/140‑1 (MQ=255) aaTAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGGGGAGTTCCACCCTGGGTCTACCGCTGCCGAAACGCTGCCAATCAGTTa > 2:189658/1‑140 (MQ=255) tAGCGCGCCATGTTAACAATGCAATCGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAac > 2:446391/1‑140 (MQ=255) tAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAac > 2:474801/1‑140 (MQ=255) tAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAac > 2:349853/1‑140 (MQ=255) tAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAac > 1:608116/1‑140 (MQ=255) gcgcgcCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCC‑GGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACAcc < 1:522585/140‑1 (MQ=255) cgcCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAg > 1:513816/1‑140 (MQ=255) cgcCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAg > 2:546128/1‑140 (MQ=255) aCAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGgaga < 1:333194/140‑1 (MQ=255) aTGCAAACGACACATAAAGCCCTAAATAATGCGACTGTGATTATCATGTCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAAc < 2:228543/140‑1 (MQ=255) aTGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAAAGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAAc < 1:244918/140‑1 (MQ=255) cAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGc > 1:574358/1‑140 (MQ=255) cGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCCGCCTATCCGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCtttt > 2:243603/1‑140 (MQ=255) caTAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTgtggt < 2:606353/140‑1 (MQ=255) aaaGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGAc < 2:662166/140‑1 (MQ=255) aaaGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGAc < 2:611622/140‑1 (MQ=255) aaGCCCAAAATAATGCGACGGTCCTCATCCTACCTCCACCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGAcc < 1:189435/140‑1 (MQ=255) gCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCaa > 1:628249/1‑140 (MQ=255) gCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCaa > 2:43515/1‑140 (MQ=255) taatGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAg < 1:156348/140‑1 (MQ=255) taatGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAg < 2:522671/140‑1 (MQ=255) taatGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAg < 2:465335/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTTCTTATCGTGCCGCCCCCCCGTCGACCTGACCGCGGAGCTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 2:255794/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTGCTTATCTTGCCTCCTCCCCGACGAACTGTCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 2:210373/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 2:513816/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 2:133931/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 2:13657/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 1:411063/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 1:476176/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 1:580865/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 2:447646/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTGCTTATCATGCCACCTCCCCGCCGACCTGGCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 2:257065/140‑1 (MQ=255) atGCGACGGTGCTTACCATGCCCCCACCCAGGCGACCCGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCg < 1:189658/140‑1 (MQ=255) tGCGACGGTGCTTATGATGCCTACTCCCCTGCGACCTCCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCgg < 1:226929/140‑1 (MQ=255) tGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCgg > 2:596504/1‑140 (MQ=255) tGCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCgg > 2:640982/1‑140 (MQ=255) gCGACGGTGCTTATCGTGCCTCTTCGCCGGCGACCTGGCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGc < 1:243603/140‑1 (MQ=255) gCGACGGTGCTTATCCTGCCTCCTCTCCGACGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGc < 1:248772/140‑1 (MQ=255) gCGACGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGc < 2:574358/140‑1 (MQ=255) aCGGTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGctct < 1:546128/140‑1 (MQ=255) cGGCGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCta > 1:612773/1‑140 (MQ=255) ggTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCtat > 2:22680/1‑140 (MQ=255) ggTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCtat < 1:59991/140‑1 (MQ=255) gTGCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCtata < 2:51417/140‑1 (MQ=255) gCTTATCATGCCTCCTTTCCGGCAACCTGCATGAGAAGTTCCACCCCGTGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCTataga < 2:322486/140‑1 (MQ=255) gCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCCCCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCTataga < 1:650671/140‑1 (MQ=255) gCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCTataga < 2:431583/140‑1 (MQ=255) gCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCTataga < 1:488208/140‑1 (MQ=255) gCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCTataga < 2:342343/140‑1 (MQ=255) gCTTATCATGCCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCTataga < 2:22552/140‑1 (MQ=255) | CAACATATTGATAGAGCAATGGATCGCAGTTACGCAGTACCACTAACAACGCGCGTAGTGATGAGAAATAGCGCGCCATGTTAACAATGCAAACGACACATAAAGCCCAAAATAATGCGACGGTGCTTATCATACCTCCTCCCCGGCGACCTGCCCGCGGAGTTCCACCCCGGGGCTACCGCTCCCGATACGCTGCCAATCAGTTAACACCAGGTCCTGGAGAAACCGCTTTTGTGGTGACCAACATACGAGCGGCTCTATAGA > NC_000913/3639588‑3639851 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |