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> 2:489291/1‑135 (MQ=255) taaCATTAGATATG‑AAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGCAATCATAACTAAAATTAGCGTAGAAGAGGGAATACCCATAACATTCAGTGTCCAAACCATg < 1:489291/135‑1 (MQ=255) taaCATTAGATATG‑AAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGCAATCATAACTAAAATTAGCGTAGAAGAGGGAATACCCATAACATTCAGTGTCCAAACCATGATTTc < 1:143253/140‑1 (MQ=255) aTTAGATATG‑AAAAAACGAAAGTGCTGAATGTCTAGTCATTGTTATCGTTAATCCTAAACCCGACAAGGCAATCATAACTAAAATTAGCGTAGAAGAGGGAATACCCATAACATTCAGTGTCCAAACCATGTTTTCAGAt < 2:371802/140‑1 (MQ=255) aTTAGATATG‑AAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGCAATCATAACTAAAATTAGCGTAGAAGAGGGAATACCCATAACATTCAGTGTCCAAACCATGTTTTCAGAt < 1:619686/140‑1 (MQ=255) aTTAGATATG‑AAAAAACAAAAGTGCTGAATGTCGAATCATTGTTATCGCTAATCCTAAACCCGACAAGGCAATCATAACTAAAATTAGCGTAGAAGAGGGAATACCCATAACATTCAGTGTCCAAACCATGTTTTCAGAt > 2:619686/1‑140 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |