| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,449,311 | C→T | L114L (CTG→CTA) | ppa ← | inorganic pyrophosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,449,311 | 0 | C | T | 98.4% | 209.7 / NA | 61 | L114L (CTG→CTA) | ppa | inorganic pyrophosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (38/22); minor base A (0/1); total (38/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGTTTTCCCAACCTTCAACTTTCACCCACTTGCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTCAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCG > NC_000913/4449178‑4449447 | cGTTTTCCCAACCTTCAACTTTCACCCACTTGCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTg < 2:811156/140‑1 (MQ=255)cGTTTTCCCAACCTTCAACTTTCACCCACTTGCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTg < 2:152723/140‑1 (MQ=255) ttCCCAACCTTCAACTTTCACCCACTTGCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAAGGTGATCGTATTCTATGCTTAGCTTGCtgt > 1:304252/1‑140 (MQ=255) aCCTTCAACTTTCACCCACTTGCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGaa > 1:212417/1‑140 (MQ=255) aCTTTCACCCACTTGCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAAc < 2:855608/140‑1 (MQ=255) tCACCCACTTGCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGt > 1:12941/1‑140 (MQ=255) cACTTGCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGc < 1:635394/140‑1 (MQ=255) aCTTGCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCa > 1:636543/1‑140 (MQ=255) gCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCtt > 1:186111/1‑140 (MQ=255) ttttCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCAcc > 1:676611/1‑140 (MQ=255) tttCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCg > 1:206876/1‑140 (MQ=255) ttCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCgg > 2:857782/1‑140 (MQ=255) tGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTc > 1:479619/1‑140 (MQ=255) tGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTACTGTGCGGAACCGCAAACAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTc > 2:285597/1‑140 (MQ=255) gCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTc > 2:97965/1‑140 (MQ=255) cTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCa > 2:726322/1‑140 (MQ=255) tCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAg < 2:206876/140‑1 (MQ=255) gaagaaGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGaa > 1:789453/1‑140 (MQ=255) aagaagTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAAc < 1:857782/140‑1 (MQ=255) agaagTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACg > 2:529554/1‑140 (MQ=255) gTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCaa > 1:205400/1‑140 (MQ=255) tGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAAc > 2:763239/1‑140 (MQ=255) tGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAAc < 2:212417/140‑1 (MQ=255) aGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCg > 2:442375/1‑140 (MQ=255) cGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGa < 1:529554/140‑1 (MQ=255) cGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGa < 1:187507/140‑1 (MQ=255) cGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGa < 2:479619/140‑1 (MQ=255) tttGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACgg > 2:815160/1‑140 (MQ=255) tGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCa < 1:726322/140‑1 (MQ=255) tGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGACTTCGTCTGTCGTTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCa > 1:278957/1‑140 (MQ=255) cAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAAccc > 1:789939/1‑140 (MQ=255) tCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAg < 2:115067/127‑1 (MQ=255) tCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAg < 2:789939/140‑1 (MQ=255) tCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAg < 1:815160/140‑1 (MQ=255) tCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAg > 2:683826/1‑140 (MQ=255) tCGTTAACGTCTTTAATGCGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAg > 1:115067/1‑127 (MQ=255) tCGTTAACGTCTTTAATCTGGTCGGATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGTCTTCGACGGTCAGTTTCAGAAGGCCAAGCCCACGGCAAAGGATACCAGAACCCCGCTGCAg > 2:424074/1‑140 (MQ=255) cGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGc < 1:442375/140‑1 (MQ=255) aCGTCTTTAATGTGATAATATTCTTTGCTTCCCATGCTGAGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTa < 2:417319/140‑1 (MQ=255) gTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACg < 1:786725/140‑1 (MQ=255) tCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGATGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACgg > 1:287121/1‑140 (MQ=255) cTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGa < 2:676611/140‑1 (MQ=255) tttAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAg > 1:188492/1‑140 (MQ=255) tttAATGTGATCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAg > 1:19213/1‑140 (MQ=255) gtCGTATTCTTTGCTAAGCTTGTTGAGCGTAGCCGCATCCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGACAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCa < 1:385835/139‑1 (MQ=255) aTCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGGACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCa > 1:461202/1‑140 (MQ=255) aTCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGCTCAAAGAGCCCGGCTGAAGCGTGTACGGAGTTGGGACCa > 2:320799/1‑140 (MQ=255) aTCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACTCGGTTGAAGCGGGCACGGAGTTGGGACCa > 1:391178/1‑140 (MQ=255) aTCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCa > 1:642786/1‑140 (MQ=255) aTCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCa > 1:595340/1‑140 (MQ=255) aTCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCa > 1:519229/1‑140 (MQ=255) aTCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCa > 2:86088/1‑140 (MQ=255) tCGTATTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAg > 2:509523/1‑140 (MQ=255) aTTCTTTGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACg < 1:86088/140‑1 (MQ=255) tttGCTTAGCTTGCTGTACGGATCCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCaa < 2:304252/140‑1 (MQ=255) ttGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAAc < 2:186111/140‑1 (MQ=255) tGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAGCCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAAcc > 2:849292/1‑140 (MQ=255) tGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAAcc > 2:186249/1‑140 (MQ=255) tGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAAcc > 2:342652/1‑140 (MQ=255) tGCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAAcc > 2:83068/1‑140 (MQ=255) gCTTAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCg < 2:595340/140‑1 (MQ=255) | CGTTTTCCCAACCTTCAACTTTCACCCACTTGCCTTTTTCGAGGTCTTTGTAGTGCTCGAAGAAGTGAGCGATTTGCGCTTTCAGCAGTTCAGGCAGATCGTTAACGTCTTTAATGTGATCGTATTCTTTGCTCAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCG > NC_000913/4449178‑4449447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |