| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 814,014 | C→T | V163V (GTC→GTT) | uvrB → | excision nuclease subunit B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 814,014 | 0 | C | T | 97.6% | 131.8 / ‑4.0 | 41 | V163V (GTC→GTT) | uvrB | excision nuclease subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (20/20); total (20/21) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.87e-01 | |||||||||||
ATTGAGCAGATGCGTTTGTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTCGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCGGCAGAATCGGATG > NC_000913/813880‑814150 | atTGAGCAGATGCGTTTGTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTAt < 1:102993/140‑1 (MQ=255)atTGAGCAGATGCGTTTGTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTAt < 2:614367/140‑1 (MQ=255) tGAGCAGATGCGTTTGTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGa < 1:797152/140‑1 (MQ=255) cAGATGCGTTTGTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATGTCAAGATGATGCTCGATCTCATGGTTGGTATGATTAt > 1:423572/1‑140 (MQ=255) cAGATGCGTTTGTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTAt > 2:464043/1‑140 (MQ=255) gATGCGTTTGTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCg > 1:760223/1‑140 (MQ=255) gATGCGTTTGTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCg > 1:568088/1‑140 (MQ=255) gCGTTTGTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATc > 1:457432/1‑140 (MQ=255) cGTTTGTCCGCCACCAAAGCGACGCTGGAGCCGCGCGATCTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCa < 2:252259/140‑1 (MQ=255) gTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTCGGTATGATTATCGATCAgcgcg < 1:818563/140‑1 (MQ=255) ccGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGcgcgcg > 2:700936/1‑140 (MQ=255) caccaAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTc > 1:555333/1‑140 (MQ=255) aaGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTgcgc > 2:522232/1‑140 (MQ=255) gCTGGAGCGGCGTGATGTGCTTTTGTTGGAGTCTGTTCCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTgg < 1:252769/140‑1 (MQ=255) gAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGa > 2:466844/1‑140 (MQ=255) cgTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAg > 1:713887/1‑135 (MQ=255) cgTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAg < 2:713887/135‑1 (MQ=255) gTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCaa < 1:545984/140‑1 (MQ=255) tGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAAt < 1:522232/140‑1 (MQ=255) aTGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATAc < 2:555333/140‑1 (MQ=255) tgtggttgtggtGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACg < 2:735874/140‑1 (MQ=255) tgtggttgtggtGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACg < 2:760223/140‑1 (MQ=255) gttgtggtGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCACGATTCTTCGCTGAGTGGCGGCGCTGCAATACGCTCg > 1:403445/1‑140 (MQ=255) gtggCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTa < 1:435503/136‑1 (MQ=255) gtggCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTa > 2:435503/1‑136 (MQ=255) gtggCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGa < 1:466844/140‑1 (MQ=255) tttCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCCCAAGATGAGGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTc < 2:286587/140‑1 (MQ=255) gcgATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCg > 1:54570/1‑140 (MQ=255) aTTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAg > 1:175958/1‑140 (MQ=255) tttATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAgg < 2:175958/140‑1 (MQ=255) atatCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTga < 2:457432/140‑1 (MQ=255) tatCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTgat > 2:828276/1‑140 (MQ=255) tatCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTgat > 2:176467/1‑140 (MQ=255) tgCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCg > 1:85765/1‑140 (MQ=255) tgCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCg > 1:774928/1‑140 (MQ=255) tgCTCCATCTCACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGCGATAGATATCTTcccc > 2:648194/1‑139 (MQ=255) aTCTCACGATTGGTATTATTATTGATCAGCTGGGGCTTCCGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCGGCAGaa < 2:403445/140‑1 (MQ=255) cACGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCCCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTATTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCGGCAGAATCgg > 2:72168/1‑140 (MQ=255) aCGGTTGGTATGATTATCGATCGGCTCGCGATTCTGCTCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCGGCAGAATCGGa < 1:364139/140‑1 (MQ=255) aCGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCGGCAGAATCGGa < 2:688271/140‑1 (MQ=255) aCGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCGGCAGAATCGGa < 1:828276/140‑1 (MQ=255) aCGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCGGCAGAATCGGa < 1:700936/140‑1 (MQ=255) aCGGTTGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCGGCAGAATCGGa < 1:176467/140‑1 (MQ=255) ggttggtATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGTGGTGCAATGCGCTCGTAATGATCAAGCTTTCCACCGTGGTACTTTCCGCCTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCGGCAGAATCGGATg < 2:568088/140‑1 (MQ=255) | ATTGAGCAGATGCGTTTGTCCGCCACCAAAGCGATGCTGGAGCGGCGTGATGTGGTTGTGGTGGCGTCTGTTTCCGCGATTTATGGTCTGGGCGATCCTGATTTATATCTCAAGATGATGCTCCATCTCACGGTCGGTATGATTATCGATCAGCGCGCGATTCTGCGCCGACTGGCGGAGCTGCAATACGCTCGTAATGATCAAGCATTCCAGCGTGGTACTTTCCGCGTTCGTGGCGAGGTGATAGATATCTTCCCGGCAGAATCGGATG > NC_000913/813880‑814150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |