| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,434,347 | A→G | A20A (GCT→GCC) | ynaM ← | Rac prophage; protein YnaM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,434,347 | 0 | A | G | 98.8% | 188.7 / NA | 82 | A20A (GCT→GCC) | ynaM | Rac prophage; protein YnaM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (31/50); minor base T (0/1); total (31/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGAT > NC_000913/1434245‑1434483 | tattGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAg > 1:647729/1‑140 (MQ=14)tattGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAg > 1:823756/1‑140 (MQ=14)tattGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAg > 2:503761/1‑140 (MQ=14) attGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGt < 2:570954/140‑1 (MQ=14) gATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGTATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGAt < 1:864933/140‑1 (MQ=17) gATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGAt < 2:822958/140‑1 (MQ=18) aTTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGAt < 1:553036/139‑1 (MQ=18) aTTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGAt > 2:553036/1‑139 (MQ=17) tttCATTGCGATATTTTATGTCTGACTCATGATATGTCGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTAt < 1:299664/140‑1 (MQ=11) tCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTTGGGCATGACTAAAACTGCTGAATATTATAAGGAGCGAAGTGATTATCa > 2:384567/1‑140 (MQ=255) ttGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGTCAATCCCTAATTTTATTAGGGTATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTa < 2:850641/140‑1 (MQ=12) ttGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTa > 1:776406/1‑140 (MQ=17) ttGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTa < 1:79859/140‑1 (MQ=18) tGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTAt < 1:725887/140‑1 (MQ=18) tGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTAt < 1:775173/140‑1 (MQ=17) gCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATg < 2:438441/140‑1 (MQ=18) gCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATg < 1:824372/140‑1 (MQ=18) gCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATg < 1:384567/140‑1 (MQ=18) gCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATg < 1:375037/140‑1 (MQ=18) gCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATg < 2:780684/140‑1 (MQ=17) gCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATg < 2:776406/140‑1 (MQ=18) gCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATg < 1:158578/140‑1 (MQ=17) cGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGc < 2:1069/140‑1 (MQ=14) tATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCata < 2:823756/140‑1 (MQ=17) tGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCAtata > 1:816670/1‑140 (MQ=17) tGATTCAGGATATGTTGCCTTAAACATCGGTTTTGTCTGAGTTATTGGGTATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCt < 2:279688/140‑1 (MQ=11) tGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCt < 2:629416/140‑1 (MQ=17) tGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCt < 1:480575/140‑1 (MQ=17) tGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATACCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGATCATATAGCCt < 2:484364/140‑1 (MQ=12) tGATTCAGGATATGTTGACTTACACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATTAGGAGCGAAGTGATTAACAGTATGCTGTTCATATAGCCt > 2:335521/1‑140 (MQ=255) gATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCt < 1:126105/139‑1 (MQ=18) gATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCt > 2:126105/1‑139 (MQ=17) gATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTc > 2:476558/1‑140 (MQ=17) aTTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCg > 2:23856/1‑140 (MQ=17) aTTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTCATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCg < 2:560484/140‑1 (MQ=18) tatGTTGACTTATACGTCGGTTTTGACTGGGTTATTGTATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTa < 1:362166/140‑1 (MQ=255) tatGTTGACTTATACATGGGTTATGTCTGGGGTATTGGACATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTa < 2:260371/140‑1 (MQ=11) tatGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTa < 2:599227/140‑1 (MQ=18) tatGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTa < 1:23856/140‑1 (MQ=18) tatGTTGACTTATACATCGGTTATGTCTGGTCTATCGGACATGCCAATACCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCTAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTa < 2:252033/140‑1 (MQ=11) tGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 1:492614/140‑1 (MQ=18) tGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 2:647729/140‑1 (MQ=17) tGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 2:17337/140‑1 (MQ=18) tGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 1:514648/140‑1 (MQ=18) tGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCGGGGTTATTGGACATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 1:290450/140‑1 (MQ=12) acaggACTTATACATCGGTTTTCTCAGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 1:249159/136‑1 (MQ=255) gTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGTGCGAAGTGCTTAGCAGTATGCTGTTGATATTGCCTCGAATTAGTAAtg > 2:362166/1‑140 (MQ=11) tGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtgtg < 1:688102/140‑1 (MQ=18) tGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGCTTATTGGATATACCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtgtg < 1:224296/140‑1 (MQ=255) aCTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGtt < 1:495900/140‑1 (MQ=18) aCTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGtt > 2:638404/1‑140 (MQ=17) aCTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGtt < 1:606017/140‑1 (MQ=17) aCTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGtt < 1:381249/140‑1 (MQ=18) cTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTta > 1:580019/1‑140 (MQ=14) ataCATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTAGGCTGTTCTTATTGCGTCGAATAAGTAATGTGTtatat > 1:412149/1‑140 (MQ=11) cATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATg > 2:87385/1‑140 (MQ=14) cGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATTAGTATGCTTTTCGTTTTGCCTCGAATTAGTAGTGTGTTATATATGata > 2:390373/1‑140 (MQ=11) cGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTa > 2:701118/1‑123 (MQ=14) cGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTa < 1:701118/123‑1 (MQ=21) cGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtgtg < 2:120536/128‑1 (MQ=21) cGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtgtg > 1:120536/1‑128 (MQ=14) cGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGata > 1:679490/1‑140 (MQ=14) cGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATAAGTATGCTGTTCTTATAGCCTCGAATTAGTTATGTGTTatatatctgt > 2:249159/1‑136 (MQ=11) gTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtgtg > 1:50893/1‑126 (MQ=17) gTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtgtg < 2:50893/126‑1 (MQ=17) gTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt > 2:465192/1‑123 (MQ=17) gTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 1:465192/123‑1 (MQ=17) gTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtata > 1:741991/1‑131 (MQ=17) gTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtata < 2:741991/131‑1 (MQ=18) tCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGAc < 2:514347/140‑1 (MQ=17) ggTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAtt > 2:99708/1‑140 (MQ=14) ggTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAtt > 1:95474/1‑140 (MQ=14) ggTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCCAATTAGTTATGGGTAATATATAATATAGTTGACAAtt > 1:296808/1‑140 (MQ=11) cAATCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGtt > 2:542230/1‑140 (MQ=25) tCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCtt > 2:108703/1‑140 (MQ=25) tCCCTAATTTTATTAGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGCAATGTGTTTTATATGAAATAGTTGAAAATTCTTATCCTGGGTGTTCtt > 2:309057/1‑140 (MQ=11) ttttATTAGGGCATGACCAAAACTGCTGAATTTGAGAAGTAGCGAAGTTATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTc < 2:225170/140‑1 (MQ=11) tttATTAGTGCATGACTAAAAATGCTGAATGAGCTTAGGAGCGAAGTGGTTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCg < 2:412149/140‑1 (MQ=11) tttATTAGGGCATGAATAAAAATGCGGAAAATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCg < 1:390373/140‑1 (MQ=255) tattaGGGCATGACTAACAATGCTGAATATGATAATGAGTGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTa < 2:296808/140‑1 (MQ=255) tattaGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTa < 2:95474/140‑1 (MQ=25) attaGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAg > 1:144831/1‑140 (MQ=25) taGGGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGAt < 1:542230/140‑1 (MQ=25) | TATTGATTTTCATTGCGATATTGTATGTCTGATTCAGGATATGTTGACTTATACATCGGTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGAT > NC_000913/1434245‑1434483 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |