| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 868,422 | (C)8→7 | coding (903/1872 nt) | gsiA → | glutathione ABC transporter ATP binding subunit GsiA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 868,415 | 0 | C | . | 98.9% | 349.9 / ‑0.3 | 88 | coding (896/1872 nt) | gsiA | glutathione ABC transporter ATP binding subunit GsiA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base . (43/43); minor base A (0/1); total (43/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCGTTGAGAAAGTC > NC_000913/868279‑868548 | gAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGcccc > 1:210041/1‑140 (MQ=255) aTTTTTCATTCACCGGAACATCCTTTCCCCCGTGCGCTTGTAGCTTGTGTTCCGCAACTTTGTGCGATGAAAGGGTTAGATTTACCCCCACGTTTCCCGTTGATATCCCTTGAACCTCCAACGGAACAAGcccccccatc < 2:1616762/140‑4 (MQ=255) aTTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGcccccccatc < 2:1064366/140‑4 (MQ=255) aTTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGcccccccatc < 1:18809/140‑4 (MQ=255) ttttCATGCACCGCACCATCCTCACTCCCCTGCGCTGCTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGa < 1:560411/140‑1 (MQ=255) tttCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAg < 2:1048706/140‑1 (MQ=255) tCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCa < 1:74109/140‑1 (MQ=255) cACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGaaaa > 2:403823/1‑140 (MQ=255) ccGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACg > 2:1137637/1‑140 (MQ=255) tCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGa < 1:1861199/140‑1 (MQ=255) ccTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGAt < 1:295615/140‑1 (MQ=255) ttACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGaaaa > 1:1166430/1‑127 (MQ=255) ttACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGaaaa < 2:1166430/127‑1 (MQ=255) ttACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATgg > 1:1852655/1‑140 (MQ=255) ttACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATgg > 2:1918297/1‑140 (MQ=255) ttACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATgg > 2:1409967/1‑140 (MQ=255) acacCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCg < 1:1918297/140‑1 (MQ=255) cccGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAAc < 1:1409967/140‑1 (MQ=255) ccGTGCGCTGTTAGCTGTTGTTGCGCAACTTAGTGTGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAAcc < 2:538278/140‑1 (MQ=255) ccGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAAcc > 1:1393410/1‑140 (MQ=255) gTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGgtggtg < 2:973254/127‑1 (MQ=255) gTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGgtggtg > 1:973254/1‑127 (MQ=255) gTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTg > 2:970255/1‑140 (MQ=255) gTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTg > 1:320509/1‑140 (MQ=255) gTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTg > 2:10350/1‑140 (MQ=255) gTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCCAAACAGG‑CCCCCCCATAGAGCAGAAAACGGCGGTGGATGGCGAACCTg > 2:741107/1‑140 (MQ=255) gTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTACCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTg > 2:1043228/1‑140 (MQ=255) tGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGTAACAGG‑CCTCCCGATCGAGCAGAAATCGGTGGTGGATGGCGAACCTGt > 2:491788/1‑140 (MQ=255) tGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGaa > 1:1131570/1‑135 (MQ=255) tGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGaa < 2:1131570/135‑1 (MQ=255) tGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGt > 1:448842/1‑140 (MQ=255) tGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGt > 1:1681224/1‑140 (MQ=255) cTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTa > 1:1751725/1‑140 (MQ=255) tGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTAc < 2:210041/140‑1 (MQ=255) gTTAGCTGCTGTTCCTCAACTTAGTCCGAGGAAAGGGCTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACg < 1:491788/140‑1 (MQ=255) gTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACg < 2:1852655/140‑1 (MQ=255) gTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACg < 1:160591/140‑1 (MQ=255) gTTAGCTGCTGTTCCCCAACTTCGTACGACGAAAGGGCTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACg < 1:513904/140‑1 (MQ=255) ttAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGa < 2:1681224/140‑1 (MQ=255) aGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACg > 2:1541753/1‑137 (MQ=255) aGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACg < 1:1541753/137‑1 (MQ=255) aGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGt < 2:1393410/140‑1 (MQ=255) ctgctgTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGc < 2:448842/140‑1 (MQ=255) gctgTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGt < 2:1837965/140‑1 (MQ=255) gacagccGCAACTTGCTGCGATCAACGGGGTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTa < 1:536027/135‑1 (MQ=255) tgTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTTAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTaa > 1:984372/1‑140 (MQ=255) tgTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTaa > 2:1561316/1‑140 (MQ=255) gTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAAt < 1:1119384/140‑1 (MQ=255) ccGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGATGGATGGCGAACGTGTTGTACGAGTGCGTAATCtt > 2:531116/1‑140 (MQ=255) cGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTg > 2:1273436/1‑140 (MQ=255) cAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTTAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTc < 2:984372/140‑1 (MQ=255) cAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTc > 2:1704062/1‑140 (MQ=255) acctGGTGCGATGAAACCGTTACATTATCCCGGGCCTTTTCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCAc < 2:871569/137‑1 (MQ=255) aCTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCAc < 1:970255/140‑1 (MQ=255) tGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCg > 2:1067694/1‑140 (MQ=255) gTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGAGAACCTGCTTTGCGCGTGCGTGATCTTGTCACCCGtt > 1:871569/1‑140 (MQ=255) tGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGttt > 2:79442/1‑140 (MQ=255) tGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGAGGTGGATGACGAACCTGTTTTACGAGTGCGCAATCTTGTCAccctgtc > 2:536027/1‑136 (MQ=255) aTGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACTTTTACCGTTGAGATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCt < 1:741107/140‑1 (MQ=255) tGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCtt > 1:380649/1‑140 (MQ=255) aGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTgcg < 1:79442/140‑1 (MQ=255) ggTTAGATTATCCCCTACGTTTACCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCa < 1:864004/140‑1 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1:1772005/1‑140 (MQ=255) tttCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGt < 2:320509/140‑1 (MQ=255) tttCCCGTTGATATCGCTTGAAAATGCAGTGAAACA‑GCCCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGt < 1:648334/140‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTa > 2:175600/1‑140 (MQ=255) ttCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTa > 1:1166975/1‑140 (MQ=255) ccGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAAcg < 2:1166975/140‑1 (MQ=255) ttGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCgg > 1:43856/1‑140 (MQ=255) tGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCggg < 2:1772005/140‑1 (MQ=255) tGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCggg < 1:1561316/140‑1 (MQ=255) cGCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTACGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGc > 2:1268644/1‑140 (MQ=255) gCTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCa < 1:1158325/140‑1 (MQ=255) cTTGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCAt > 1:1067824/1‑140 (MQ=255) ttGAACATCCAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATg < 1:1067694/140‑1 (MQ=255) aaCATCCAGCGAAACA‑GACCCCCCCATCGAGAATAAAACAGTGGTGGAGGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCg < 2:824561/140‑1 (MQ=255) ccAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCggg < 2:450620/123‑1 (MQ=255) ccAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCggg > 1:450620/1‑123 (MQ=255) cAGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGAGCAGCGGTCTGTCGAAACGCGTAACCCGGGACGTGCATGCCGTTgaga > 2:804580/1‑140 (MQ=255) aGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTATCGGGGGAAGTGCATGCCGTTGAGaa > 1:824561/1‑140 (MQ=255) aGCGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCGTTGAGaa > 2:307092/1‑140 (MQ=255) cGAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCGTTGAGAAAg > 2:1844888/1‑140 (MQ=255) gAAACAGG‑CCCCCCCTTCGAGCCGACAACAGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCGTTGAGAAAGt < 1:531116/140‑1 (MQ=255) gAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCGTTGAGAAAGt < 2:451419/140‑1 (MQ=255) gAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCGTTGAGAAAGt < 1:1137637/140‑1 (MQ=255) gAAACAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCGTTGAGAAAGt < 2:43856/140‑1 (MQ=255) aaaCAGG‑CCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCGTTGAGAAAGTc > 1:177907/1‑140 (MQ=255) | GAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGAGCAGAAAACGGTGGTGGATGGCGAACCTGTTTTACGAGTGCGTAATCTTGTCACCCGTTTCCCTTTGCGCAGCGGTTTGTTGAATCGCGTAACGCGGGAAGTGCATGCCGTTGAGAAAGTC > NC_000913/868279‑868548 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |