| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,612,522 | (G)5→6 | coding (658/1050 nt) | yhhT → | putative transporter YhhT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,612,517 | 1 | . | G | 96.0% | 356.8 / 4.7 | 101 | coding (653/1050 nt) | yhhT | putative transporter YhhT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/3); new base G (52/45); total (53/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
ATGCGTTTTGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑T‑G‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATT > NC_000913/3612378‑3612650 | tGCGTTTTGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑T‑g > 2:415336/1‑140 (MQ=255) tGCGTTTTGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑T‑g > 1:1047328/1‑140 (MQ=255) tttGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑T‑g‑g‑gggg > 2:1718201/1‑139 (MQ=255) tttGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACACGTGTCATGGTCTGGATGGGGCCGGAGCTGA‑T‑g‑g‑gggg > 1:690773/1‑139 (MQ=255) ttGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑T‑g‑g‑ggggt < 2:1047328/140‑3 (MQ=255) ttGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑T‑g‑g‑ggggt < 1:1695481/140‑3 (MQ=255) ttGCGCTGAATAATCAACAGATACATATCCCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑T‑g‑g‑ggggt < 1:932731/140‑3 (MQ=255) taatCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTgcg < 1:415336/140‑1 (MQ=255) taatCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTgcg < 1:1223514/140‑1 (MQ=255) taatCCACAGATTCACAACGCGCGATTACACCGCGTACTTAAAGGCGTGTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGTAGTTTgcg < 2:699217/140‑1 (MQ=255) cacaGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGAt < 1:232774/140‑1 (MQ=255) aGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTgcg < 2:1393404/132‑1 (MQ=255) aGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTgcg > 1:1393404/1‑132 (MQ=255) aGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTgcg < 1:1856421/132‑1 (MQ=255) aGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTgcg > 2:1856421/1‑132 (MQ=255) aGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGAtgtg > 2:447290/1‑140 (MQ=255) aGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑T‑g‑g‑ggggtg < 2:14603/123‑4 (MQ=255) aGATTCACATCGCGGGATAACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGATGAGG‑G‑G‑GGGTGCCGTTTGCGCTGAtgtg > 1:548541/1‑140 (MQ=255) aTTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTggg < 1:1672482/140‑1 (MQ=255) aTTCACATCGCGGGACTACACCACGTACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTggg < 1:875055/140‑1 (MQ=255) aTTCACAGCGCGGGATCGCCGCGCGCACTTGAAAGAGTTCCGCACTATGTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTGTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTggg < 2:921348/140‑1 (MQ=255) tCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCAGGCTGGGGGTGGCGTTTA‑TGG‑G‑GGGGGCAGCTTGCGCTGATGTGGGCa > 2:875055/1‑140 (MQ=255) cacaTCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAg < 2:1740839/140‑1 (MQ=255) aTCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGGTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGTTGATGTGGGCAGTAc > 1:684622/1‑140 (MQ=255) cgGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGc > 2:1360594/1‑140 (MQ=255) cgcACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGTTGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAAc > 1:685077/1‑140 (MQ=255) cgcACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGttttt < 2:1433394/133‑1 (MQ=255) cgcACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGttttt > 1:1433394/1‑133 (MQ=255) cgcACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAAc > 2:1332211/1‑140 (MQ=255) cgcACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAAc > 1:1690365/1‑140 (MQ=255) cgcACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAAc > 1:1596697/1‑140 (MQ=255) cgcACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAAc > 2:56024/1‑140 (MQ=255) cgcACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTGTGCGCTGATGTTGGTAGTACTGGCGTTTTTGCTCAAc > 1:628561/1‑140 (MQ=255) aCTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTAc < 2:1596697/140‑1 (MQ=255) aCTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTAc < 1:1332211/140‑1 (MQ=255) tAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTg < 1:1705096/140‑1 (MQ=255) aaGGCGTTTCGCACTCTCTTGCCTTTAAGCCGCTACTTAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGcc < 1:516850/140‑1 (MQ=255) cGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCgg < 1:56024/140‑1 (MQ=255) cGCACTATCTTGCATCGAAGACCCTCCTCCGTTTATGCACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCgg < 1:519839/140‑1 (MQ=255) cTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGcgcg > 1:1887758/1‑140 (MQ=255) tGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGACGCGGTAAtt > 1:1223405/1‑140 (MQ=255) tGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCT‑GGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGGGCAGTTTGCGCTGGTGTGGGCCGTACTGGCGGTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATAACGGCGGGGGAAttt > 2:179427/1‑140 (MQ=255) aTTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTcc > 2:1398939/1‑140 (MQ=255) aaGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTaa < 1:1413570/131‑1 (MQ=255) aaGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTccgccg > 2:1033929/1‑140 (MQ=255) aaGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTccgccg > 1:301346/1‑140 (MQ=255) aaGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTccgccg > 1:232887/1‑140 (MQ=255) aaGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTccgccg > 2:354484/1‑140 (MQ=255) aaGACGCTACTCAGTTTATGGACAAGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTaa > 2:1413570/1‑131 (MQ=255) gACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTc > 1:1566371/1‑133 (MQ=255) gACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTc < 2:1566371/133‑1 (MQ=255) gACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTa > 1:101296/1‑140 (MQ=255) gACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCACTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTa > 2:1235944/1‑140 (MQ=255) cGCTACTCAGTTTATGGACAGGGGTCATCCTCTGGCTTGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTAcc < 1:580824/140‑1 (MQ=255) gCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCg > 1:407226/1‑140 (MQ=255) gCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTCTTGCTCAAGTACGTGCGCAATATCGGCGCGTTAATTTCCGCCGTACCg > 2:649098/1‑140 (MQ=255) tACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGcc < 2:301346/140‑1 (MQ=255) tACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGACTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTccgcc > 2:1840477/1‑132 (MQ=255) tACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGACTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTccgcc < 1:1840477/132‑1 (MQ=255) tCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATGGGCTCGATAATTTCCGCCGTACCGCCAAt > 1:661396/1‑140 (MQ=255) tCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAAt < 1:1033929/140‑1 (MQ=255) gTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGAt < 2:101296/140‑1 (MQ=255) tttATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCaa < 1:1728518/135‑1 (MQ=255) tttATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCaa > 2:1728518/1‑135 (MQ=255) tttAGGGCCAGGT‑TTATCGGCCGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTc < 1:179427/140‑1 (MQ=255) aTGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGGAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAg > 2:43256/1‑140 (MQ=255) aTGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAg > 2:947369/1‑140 (MQ=255) aTGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGAGGTAATTTACGCCTTACCGCCAATGATTCAg > 2:550819/1‑140 (MQ=255) aTGGACAGGTGTCATCGCCTGGTTGGGGCTGTGGCTGATT‑G‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAg < 2:661396/140‑1 (MQ=255) ggACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGt > 1:255860/1‑140 (MQ=255) ggACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCAGCGCGGTAATTACCGCCGTACTGCCAATGATTCAGGt > 1:801236/1‑140 (MQ=255) 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2:1586381/140‑1 (MQ=255) ggTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCTCGGAAATGTCCGCCGTCCCGCAAATGATTCAGGtgctgc > 2:638976/1‑140 (MQ=255) ggTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCa > 2:1489141/1‑124 (MQ=255) ggTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCa < 1:1489141/124‑1 (MQ=255) ggTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGtgctgc > 1:1742135/1‑140 (MQ=255) ggTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGtgctgc > 2:9378/1‑140 (MQ=255) ggTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGtgctgc > 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ctggctggGGCTGGATCTGA‑T‑GAG‑GAGTGCAGTTTGCCCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGgt < 1:891545/140‑1 (MQ=255) ctggctggGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGtgctg < 1:83362/128‑1 (MQ=255) ctggctggGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGtgctg > 2:83362/1‑128 (MQ=255) tggctggGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGtg > 1:1060471/1‑124 (MQ=255) tggctggGGCTGGAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGtg < 2:1060471/124‑1 (MQ=255) gctggggctggAGCTGA‑TGG‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGtt < 1:947369/140‑1 (MQ=255) 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2:1887758/140‑2 (MQ=255) | ATGCGTTTTGCGCTGAATAATCCACAGATTCACATCGCGGGATTACACCGCGCACTTAAAGGCGTTTCGCACTATCTTGCATTGAAGACGCTACTCAGTTTATGGACAGGTGTCATCGTCTGGCTGGGGCTGGAGCTGA‑T‑G‑G‑GGGTGCAGTTTGCGCTGATGTGGGCAGTACTGGCGTTTTTGCTCAACTACGTGCCCAATATCGGCGCGGTAATTTCCGCCGTACCGCCAATGATTCAGGTGCTGCTGTTTAATGGTGTTTACGAATGTATT > NC_000913/3612378‑3612650 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |