| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,180,672 | (CTG)4→3 | coding (113‑115/366 nt) | rplL → | 50S ribosomal subunit protein L12 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4180662 | 4180664 | 3 | 148 [0] | [0] 148 | rplL | 50S ribosomal subunit protein L12 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4180665 = | 0 (0.000) | 142 (1.360) | 67/256 | 0.2 | 100% | coding (106/366 nt) | rplL | 50S ribosomal subunit protein L12 |
| ? | NC_000913 | = 4180661 | 0 (0.000) | coding (102/366 nt) | rplL | 50S ribosomal subunit protein L12 | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
ATAAACTTATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCTGGGT > NC_000913/4180527‑4180799 | ataAACTTATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgc > 1:1892135‑M2/1‑135 (MQ=255) aCTTATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgct > 1:262795‑M2/1‑131 (MQ=255) aCTTATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgct > 1:1347724‑M2/1‑131 (MQ=255) aCTTATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctg < 2:1669224‑M2/135‑5 (MQ=255) aTTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCCATGGAAGCAAAGTTCGGTGTTACCgctgctgctgtag < 1:869349‑M2/140‑14 (MQ=255) atatTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtag < 2:1551849‑M2/140‑20 (MQ=255) aGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctg < 1:949905‑M2/140‑26 (MQ=255) gAACAATTTAAATGTCTGTCACCAAAGATCAAATCGTTGTAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggc > 2:830209‑M2/1‑113 (MQ=255) gAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggc < 2:1296474‑M2/140‑28 (MQ=255) gAACAATTTAAATGTATATCACCAAAGATTAAATCATCGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggc > 1:931145‑M2/1‑113 (MQ=255) aaCAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcc > 1:1387130‑M2/1‑112 (MQ=255) aTTTAAATGTCTATCACAAAAGCTCAAATCACTGACGCATTTGCAGCTCTGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggt > 2:613427‑M2/1‑108 (MQ=255) tttAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggc > 2:1350580‑M2/1‑107 (MQ=255) aaTGTCTATCACTAAAGGTCAATTCATTGAAGCAGCTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaag > 2:765652‑M2/1‑103 (MQ=255) aaTGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaag > 2:1118503‑M2/1‑103 (MQ=255) aTGTCTATTACTAAAGTACAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTTTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagc > 2:869349‑M2/1‑102 (MQ=255) aTGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggtccggttgaagc < 1:1240651‑M2/140‑39 (MQ=255) aTGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagc < 1:1455018‑M2/140‑39 (MQ=255) tCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtggctctagctgctgtcccggttgaagctgc < 1:514675‑M2/140‑42 (MQ=255) tCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtggctatagctgctgtcccggttgaagctgc < 1:915768‑M2/140‑42 (MQ=255) tCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctg < 1:949403‑M2/139‑41 (MQ=255) tCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctg > 2:949403‑M2/1‑99 (MQ=255) tCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgatgcagctgtagctgtaactgcaggcccggttgaagctgc < 2:735476‑M2/140‑42 (MQ=255) cTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgatggcccggttgaagctgct > 1:262688‑M2/1‑98 (MQ=255) cTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGCAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgct > 1:1364488‑M2/1‑98 (MQ=255) tATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctg < 2:1296318‑M2/140‑44 (MQ=255) tATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctg < 2:413316‑M2/140‑44 (MQ=255) tATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctg < 1:105515‑M2/140‑44 (MQ=255) tATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggt < 1:164395‑M2/129‑33 (MQ=255) tATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggccc > 2:1653103‑M2/1‑97 (MQ=255) tATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggccc < 1:1653103‑M2/126‑30 (MQ=255) aaGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaa < 2:1756297‑M2/140‑52 (MQ=255) cAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactga < 2:1498157‑M2/140‑57 (MQ=255) aTCATTGATGCAGTTGCCGCTATGTCTGTAATGTAGGTTGTAGAACTGCTCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaatt > 2:915768‑M2/1‑81 (MQ=255) aTCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaatt < 2:1420530‑M2/140‑60 (MQ=255) aTCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaact < 2:1634254‑M2/135‑55 (MQ=255) aTCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagatgctgtcacggttgaagctgctgaagaaaaaactgaatt < 2:809099‑M2/140‑60 (MQ=255) aTCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgaagctgtagatgctggcgcggttgaaactgctgaagaaaaaactgaatt < 2:770082‑M2/140‑60 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacg < 1:1563158‑M2/140‑65 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacg > 1:1498157‑M2/1‑76 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacg < 2:1449135‑M2/140‑65 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacg > 2:1563158‑M2/1‑76 (MQ=255) tGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacg > 1:413316‑M2/1‑76 (MQ=255) aaGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgta > 1:1420530‑M2/1‑74 (MQ=255) cAGTTGCAGCTATGTCTGTAATTGACGTTGTTGAAGTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaatt > 2:803676‑M2/1‑71 (MQ=255) cAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaatt > 2:1835708‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattct < 2:1511974‑M2/140‑72 (MQ=255) gTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattct < 2:1039786‑M2/140‑72 (MQ=255) gCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaa > 2:1886071‑M2/1‑66 (MQ=255) aGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaag > 1:1296318‑M2/1‑64 (MQ=255) tGTCTGTAATGGACGTTGTAGATCTGATCTCTGCAATGGGAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggc > 2:738544‑M2/1‑59 (MQ=255) tGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgct > 2:283935‑M2/1‑59 (MQ=255) tGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgct < 2:1534875‑M2/140‑82 (MQ=255) gTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctg < 2:54229‑M2/140‑83 (MQ=255) 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2:1630830‑M2/132‑100 (MQ=255) aTCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagcggctggcgctaacaaagttgctgttatcaa < 1:719383‑M2/140‑108 (MQ=255) aTCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaactctgacagctgctggcactaatcaagttgccgttatcaa < 2:853083‑M2/140‑108 (MQ=255) aTCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggatgaagctgctgacgaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaa < 2:1575428‑M2/140‑108 (MQ=255) ctGCAATGGAAGAAACATTCGGGGTATCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagca > 1:802453‑M2/1‑29 (MQ=255) tGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcag < 2:361344‑M2/140‑113 (MQ=255) cAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagta > 1:54229‑M2/1‑26 (MQ=255) tGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaaggtgctgttatcaaagcagtacgt < 1:1699658‑M2/140‑118 (MQ=255) tGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctcgcggtaacaaagttgctcttatcaaagcagtacgt < 2:655405‑M2/140‑118 (MQ=255) gaagaaAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtgg < 2:1362186‑M2/140‑120 (MQ=255) gaagaaAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtgg < 2:1785204‑M2/140‑120 (MQ=255) gaagaaAAATTCGGTGTTTCCgctgctgcagtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtgg > 1:809099‑M2/1‑21 (MQ=255) gaaAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtggcgc < 1:1075705‑M2/140‑123 (MQ=255) gaaAAATTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtgg > 2:1719237‑M2/1‑18 (MQ=255) aaaaTTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtggcgcaa > 1:1551849‑M2/1‑16 (MQ=255) aaaaTTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtggcgcaa > 1:416100‑M2/1‑16 (MQ=255) aaaTTCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtggcgcaac > 2:949905‑M2/1‑15 (MQ=255) ttCGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtggcgcaactgg > 1:1362186‑M2/1‑12 (MQ=255) cGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaatgttgctgttatcaaagcagtacgtggcgcaactggcc < 1:627745‑M2/140‑131 (MQ=255) cGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtggcgcaactggcc > 1:361344‑M2/1‑10 (MQ=255) cGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtggcgcaactggcc > 1:430423‑M2/1‑10 (MQ=255) cGGTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtggcgcaactggcc > 2:1699658‑M2/1‑10 (MQ=255) ggTGTTTCCgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaagcagtacgtggcgcaactggcct > 1:343111‑M2/1‑9 (MQ=255) ccgctgctgctgtagctgtagctgctggcccggttgaagctgctgaagaaaaaactgaattcgacgtaattctgaaagctgctggcgctaacaaagttgctgttatcaaaccagtacatggcgctactggcctgggtctg < 1:872722‑M2/140‑139 (MQ=255) | ATAAACTTATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTAATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTGTAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGCTAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCTGGGT > NC_000913/4180527‑4180799 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |