Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 442,297 | A→G | E250G (GAA→GGA) | thiI → | tRNA uridine 4‑sulfurtransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 442,297 | 0 | A | G | 99.2% | 487.1 / ‑3.8 | 131 | E250G (GAA→GGA) | thiI | tRNA uridine 4‑sulfurtransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (62/68); minor base C (1/0); total (63/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.48e-01 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CATTACTGCTTCTTTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGAAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAGCGCTCGGCCAGGTGTC > NC_000913/442161‑442429 | cATTACTGCTTCTTTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAAt > 2:953503/1‑140 (MQ=255) cATTACTGCTTCTTTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAAt > 2:184821/1‑140 (MQ=255) tGCTTCTTTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCga > 2:1074698/1‑140 (MQ=255) cttcttTACCCTCGGCGTCGCGACGCATGAGGTTGCCGTCCGTCAGGTTGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCgaga < 2:902304/140‑1 (MQ=255) cttcttTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCgaga < 2:75924/140‑1 (MQ=255) ttcttTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGaa > 1:1114968/1‑140 (MQ=255) tcttTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGaaa > 1:1070025/1‑140 (MQ=255) tcttTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGaaa < 2:1908864/140‑1 (MQ=255) tcttTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGaaa < 2:1085655/140‑1 (MQ=255) cttTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATAAATTTCGCACCAGTGGTCGGGGGAATTCTCGAGaaaa > 1:902304/1‑140 (MQ=255) ttAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGGGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAACATc > 1:82426/1‑140 (MQ=255) aaCCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATcga > 1:1308620/1‑140 (MQ=255) aCCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATcgac < 1:1074698/140‑1 (MQ=255) ccTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATcgacg < 1:1618913/140‑1 (MQ=255) cTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATcgacga > 2:1239530/1‑140 (MQ=255) tCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCgacgac < 1:1041627/140‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCgacgac > 1:1412286/1‑140 (MQ=255) cggcggCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACAGGTTGTCGGGGGCATTCGCGAGAAAATCGacgacg > 2:653665/1‑140 (MQ=255) ggcggcGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATcga < 1:1733783/134‑1 (MQ=255) ggcggcGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACgg > 2:1657014/1‑140 (MQ=255) ggcggcGCGGCGCATGAAATTGGCGGGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCATGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGCCTTCTCGAGAAAATCGACGACgg > 2:1760424/1‑140 (MQ=255) gcggcgcggcGCATGAAATTGGGGTGCGTCATGTGCCGCCTTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGt < 2:759058/140‑1 (MQ=255) gcggcgcggcGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGt < 1:1821748/140‑1 (MQ=255) gcggcgcggcGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGt < 2:103288/140‑1 (MQ=255) cgcggcgcATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGa > 2:1789201/1‑140 (MQ=255) cgcggcgcATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATATCGAACCGCTCGACGGAGGAATTCTTGAGAAAATCGACGACGGTCAGa > 2:574735/1‑140 (MQ=255) cggcgcATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATg > 1:1742265/1‑140 (MQ=255) cgcATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGc > 2:426722/1‑140 (MQ=255) gcATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCg < 1:1360229/140‑1 (MQ=255) gcATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCg < 2:1412286/140‑1 (MQ=255) gcATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCg < 1:953503/140‑1 (MQ=255) gcATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCg < 2:476548/140‑1 (MQ=255) gcATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCg < 2:1398703/140‑1 (MQ=255) aTGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGtt < 1:119745/140‑1 (MQ=255) gAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTAt > 2:253275/1‑140 (MQ=255) aTTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCGTTATCTGTCGAACCGCATTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCt < 2:584184/140‑1 (MQ=255) aTTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCt < 1:1105649/140‑1 (MQ=255) aTTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCt < 2:1676249/140‑1 (MQ=255) ttGGCGTGCGTCAGGTGGCGCAGTATCTGTGGACCCGCTCTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTc < 2:832291/140‑1 (MQ=255) tGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCa > 2:12118/1‑140 (MQ=255) ggCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCaa < 1:1256847/140‑1 (MQ=255) ggCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCaa < 2:1314357/140‑1 (MQ=255) ggCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCaa < 2:345701/140‑1 (MQ=255) ggCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCaa < 1:253275/140‑1 (MQ=255) ggCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCaa < 1:1892770/140‑1 (MQ=255) ggCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCaa < 1:1764541/140‑1 (MQ=255) cgtgcgtCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAAc < 1:342158/140‑1 (MQ=255) cgtgcgtCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAAc < 1:1032819/140‑1 (MQ=255) cgtgcgtCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAAc > 2:1106788/1‑140 (MQ=255) cgtgcgtCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAAc > 1:1667205/1‑140 (MQ=255) cgtCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCt > 1:1650031/1‑131 (MQ=255) cgtCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTat > 2:1404848/1‑140 (MQ=255) aGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTatgatg < 1:1789201/140‑1 (MQ=255) cgcATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGgtgcgt > 1:1222983/1‑140 (MQ=255) gcATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTGTTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCaa > 2:1120675/1‑123 (MQ=255) gcATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCaa < 1:1120675/123‑1 (MQ=255) cATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGgtgcgtgc < 2:1742265/140‑1 (MQ=255) cATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGgtgcgtgc < 1:1239530/140‑1 (MQ=255) cATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGgtgcgtgc < 2:1667205/140‑1 (MQ=255) cATTATCTGTGGAACCGCCTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGgtgcgtgc > 2:1294847/1‑140 (MQ=255) cATTATCTGTGGAACCGCCTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGgtgcgtgc < 1:1294847/140‑1 (MQ=255) agttATCTGTGGAACCACTTTGGCAGCTCCCCCAGAGTGCGTTTTGTCACTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGgtgcgtgc < 2:808183/138‑1 (MQ=255) tgGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTaa > 2:226379/1‑140 (MQ=255) ggAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGACGCATCTaaa > 2:978319/1‑140 (MQ=255) gAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGCATCATGGTGCGTGCCGCATCTAAAg > 1:871821/1‑140 (MQ=255) aCCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAAGGTATGAGGGTGCGAGCCGCATCTAAAgct > 1:808183/1‑138 (MQ=255) aCCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTg > 2:1585168/1‑140 (MQ=255) ccGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTgg < 1:396530/140‑1 (MQ=255) cGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGc > 2:1170164/1‑140 (MQ=255) gCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGcc < 1:128806/125‑1 (MQ=255) aGCTCCCACCGCGTGTGTTTTGGCGCTATGAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTa < 1:713492/140‑1 (MQ=255) aGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTa < 1:1404848/140‑1 (MQ=255) aGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTa < 1:426722/140‑1 (MQ=255) aGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTa < 2:1308620/140‑1 (MQ=255) cTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACg < 1:1585168/140‑1 (MQ=255) ccGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACgg > 2:968773/1‑135 (MQ=255) ccGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACgg < 1:968773/135‑1 (MQ=255) tgcgtTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTAc > 1:210949/1‑135 (MQ=255) tgcgtTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTAc < 2:210949/135‑1 (MQ=255) tgcgtTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGgcg > 2:230492/1‑140 (MQ=255) tgcgtTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGgcg > 1:1552892/1‑140 (MQ=255) tgcgtTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGgcg < 1:226379/140‑1 (MQ=255) tgcgtTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGACGCATCTTAAGAGGCTGAACGATACGGCGTACAGgcg > 1:872737/1‑140 (MQ=255) gcgtTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTACCGAATCAAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGgcgc > 2:653901/1‑140 (MQ=255) tATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCg > 2:208640/1‑140 (MQ=255) aTTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCAc < 1:1875807/134‑1 (MQ=255) aTTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCAc > 2:1875807/1‑134 (MQ=255) aTTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTC‑AACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCa < 1:1087187/132‑1 (MQ=255) ttAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGaa > 1:991565/1‑140 (MQ=255) aaTTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAgc < 2:72756/140‑1 (MQ=255) aaTTTCGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAgc > 1:1157107/1‑140 (MQ=255) cGAACCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAGCGCTCg < 2:183240/140‑1 (MQ=255) aaCCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAGCGCTCGGc < 1:264651/140‑1 (MQ=255) aaCCGGTCGTCGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAGCGCTCGGc < 2:1617111/140‑1 (MQ=255) ccGGTCGTCGGGGGAATCCTCGAGAAAATCTCCGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAGCGCTCGGCCa < 2:871821/140‑1 (MQ=255) gtcgtcGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTTAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAgcgc < 2:1594007/130‑1 (MQ=255) gtcgtcGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTTAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAgcgc > 1:1594007/1‑130 (MQ=255) gtcgtcGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGGACGTTACGACGTACAGTCGCTGGTCGCCGGGGAAGCGCTCGGCCAGgt > 2:532878/1‑140 (MQ=255) gtcgtcGGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGa < 2:1263064/125‑1 (MQ=255) gtcgGGGGAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAGCGCTCGGCCAGGTGTc < 1:1657014/140‑1 (MQ=255) | CATTACTGCTTCTTTAACCTCGGCGGCGCGGCGCATGAAATTGGCGTGCGTCAGGTGGCGCATTATCTGTGGAACCGCTTTGGCAGCTCCCACCGCGTGCGTTTTGTCGCTATTAATTTCGAACCGGTCGTCGGGGAAATTCTCGAGAAAATCGACGACGGTCAGATGGGCGTTATCCTCAAACGTATGATGGTGCGTGCCGCATCTAAAGTGGCTGAACGTTACGGCGTACAGGCGCTGGTCACCGGCGAAGCGCTCGGCCAGGTGTC > NC_000913/442161‑442429 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |