| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 60,693 | A→G | F858L (TTT→CTT) | rapA ← | RNA polymerase‑binding ATPase and RNAP recycling factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 60,693 | 0 | A | G | 98.2% | 191.9 / NA | 57 | F858L (TTT→CTT) | rapA | RNA polymerase‑binding ATPase and RNAP recycling factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (19/37); minor base C (0/1); total (19/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AATCAATGCACGGGCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAACTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGTTCCACCAACAGCGT > NC_000913/60556‑60828 | aatcaatGCACGGGCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGct < 1:151865/140‑1 (MQ=255) caatGCACGGGCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTa < 2:1573013/140‑1 (MQ=255) tGCACGGGCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACGGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGAGTTCAAGCTCTACCt > 1:509097/1‑140 (MQ=255) tGCACGGGCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGGTTCAAGCTCTACCt > 1:1243759/1‑140 (MQ=255) gCACGGGCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTg < 2:34035/140‑1 (MQ=255) taCGGGCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTgc > 1:1681791/2‑140 (MQ=255) cACGGGCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGGTTCCAGCTCTACCTgc > 2:1252279/1‑140 (MQ=255) aCGGGCAGATTTCTCAATCTGCGCTTCACCCAGTTGATGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTgcg < 1:694107/140‑1 (MQ=255) ggCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCC‑GTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGGTTCAAGCTCTACCTGcgccgc > 1:145217/1‑140 (MQ=255) gCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAAGTTTCAAGCTCTACCTGcgccgc > 2:1658498/1‑140 (MQ=255) aGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGC‑GGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑g < 1:1554447/140‑1 (MQ=255) aTTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑gg < 1:352239/140‑1 (MQ=255) cGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGTTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTCCCTGCGCCGCCA‑GGtggttg < 2:387564/140‑1 (MQ=255) cGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTATAGGATTCAAGCTGTACCGGCGCCGCCA‑GGttgttg > 2:728195/1‑140 (MQ=255) cGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGttgttg > 2:1679455/1‑140 (MQ=255) gATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGc < 2:1853521/140‑1 (MQ=255) aTCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGcc > 2:1585541/1‑140 (MQ=255) tGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGtt > 2:1739497/1‑140 (MQ=255) cgcTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTCTCAAGCTCTACGTGGGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGtttt > 1:569967/1‑140 (MQ=255) cgcTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAAGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGtttt > 2:1119438/1‑140 (MQ=255) cgcTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGATAAAGGATTCAAGCCCTACCTCCGCCGCCC‑AGTTGTTTCCGtttt > 2:386177/1‑140 (MQ=255) tCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATc < 1:1739497/140‑1 (MQ=255) gagacaggTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATc < 1:1368399/133‑1 (MQ=255) aCCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGGTCTACCTGCGCGGCGA‑GGTTGATGCCGTTTTTATCca > 1:566950/1‑140 (MQ=255) aCCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCca > 1:173641/1‑140 (MQ=255) aCCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCca < 2:1681791/140‑1 (MQ=255) cccAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCcag < 2:1449793/140‑1 (MQ=255) cAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCcagca < 1:164388/140‑1 (MQ=255) cAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCCGCTGCACGGCGGTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCcagca < 1:858104/140‑1 (MQ=255) gTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCagcagc < 1:1585541/140‑1 (MQ=255) aGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCg < 2:418281/140‑1 (MQ=255) gCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCgg > 2:1254356/1‑140 (MQ=255) gCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGGTTCAAGCTCTTTCTGCGCCGCCA‑GGGTGTTGGCGTTTTTTTTTCTCAAGATACGTACCgg > 2:241563/1‑140 (MQ=255) gCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGCTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGGTGTTGCCGTTTTTATCCCGCAGCATACGTAcccg > 2:1094251/1‑138 (MQ=255) gCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAAGGTTCAAGCTCTAGCTGCGCCGCCA‑GCGTGGTGCCGGTTATTTCCCGCAGCATACGCACCgg > 2:740684/1‑140 (MQ=255) gCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGCGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGGTTCAATCTCTACCTTCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGGTTTTATTCCGCAGCATAcccgtctc > 2:1368399/1‑133 (MQ=255) tGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGGTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCATTTGTTTTCAGCATCATACGTACCGGCgg > 1:777913/1‑139 (MQ=255) aaCATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCg < 1:1679455/140‑1 (MQ=255) tCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTCCCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTgg < 2:84123/140‑1 (MQ=255) tCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTgg < 2:173641/140‑1 (MQ=255) ctgctgCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGGTTCAAGCTCTACCCGCGCCGCCG‑GGGTGTTTGCGTTTTTATCCAGCAGGATACCTACCGGCGTCGGTGGCa > 2:717952/1‑140 (MQ=255) cGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGGTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATATGTAGCGGCGTCGGAGGCAGGAAGCGGTTg > 1:496187/1‑140 (MQ=255) cGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAAGGTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGGCGGTGGCAGGAAGCGGTTg > 1:1328732/1‑140 (MQ=255) gTTAACCAGTTTGCTCCCGGTGCGAGGGTGAACCGCGGTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGa < 1:919213/140‑1 (MQ=255) ttAACCAGTTTGCTGCCGGTGTTACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAg < 2:674766/140‑1 (MQ=255) ccAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGc < 1:45791/140‑1 (MQ=255) ccAGTTTGCTGCCGGTGCGACGGTTAACCGCGTTAAGCTTGCGGTTAATGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGc < 2:566950/140‑1 (MQ=255) ccAGTTTGCTGCCGGGGTGACGTTTCACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGc < 1:728195/140‑1 (MQ=255) tttGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTTAAGGCTTAAAGACCTTTCTTCCCCGCCACGGTTTTTG‑CGGTTTTATTCAGCAGCAAACCCACCGGCGTCGGGGGCAAGAAGCGGTTGAACTGCaaac > 2:1579133/1‑138 (MQ=255) tttGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACt > 2:1581838/1‑140 (MQ=255) tttGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGGTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGGTTTTATCCTGCAGCATAGGTATCGGAGTCGGGGGCAGGAGGCGGGTGAGCTGCAAcc > 2:677525/1‑139 (MQ=255) tttGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGG‑TTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGGTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTg > 1:138710/1‑140 (MQ=255) gcCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCg < 2:939911/140‑1 (MQ=255) ccGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAAGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGGTGTTGCCGGTTTTTTCCAGCAGCATACGTACCGTCGTCGGGGGCAGGAAGAGGTTTGGCTGCAAATGCTTCgg > 2:835343/1‑140 (MQ=255) ggTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGGTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCC‑GGGTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAg > 2:1444853/1‑140 (MQ=255) tgtgACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGcc < 2:129093/140‑1 (MQ=255) ttAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTTAAAGGTTCAAGCTCTACCTTCGCCGCCA‑GGGTGGTGCCGTTTTTTTTCAGCAGCATACGTACCGGCGGCGGTGGCAGGGAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCCGGGCttt > 2:466754/1‑139 (MQ=255) aaCCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGTTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCaa < 1:835343/140‑1 (MQ=255) aaCCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGGTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCaa > 2:34522/1‑140 (MQ=255) gTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGcc < 2:1221436/124‑1 (MQ=255) gTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGcc > 1:1221436/1‑124 (MQ=255) ttAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGGGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATa > 1:1036034/1‑140 (MQ=255) aaGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATaaa < 1:1579133/140‑1 (MQ=255) aGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAACCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAAt < 1:677525/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTAAAGGTTTTAAGCCCTACCTGCGCCGCCA‑GCTTGTTGCCCTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCa < 2:569967/140‑1 (MQ=255) ggCGGTTAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGt < 2:1097462/140‑1 (MQ=255) ttAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGTTccac < 1:386177/140‑1 (MQ=255) tAAAGGTTTCAAGCTCTTCCTGTGCCGCCA‑GGTTGGTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGTTccacc < 2:777913/140‑1 (MQ=255) tAAAGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGGGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTACGGAGCCAGGGATTAAACCACGTAAATCAGTTccacc > 1:528091/1‑140 (MQ=255) aaaGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGTTccacca < 1:1254356/140‑1 (MQ=255) aGGTTTCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGTTCCACCAAc < 1:241563/140‑1 (MQ=255) ttCAAGCTCTACCTGCGTCGCCG‑GGTTGTTGTCGTTTTTCTCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGTTCCACCAACAGCg < 2:496187/140‑1 (MQ=255) ttCAAGCTCTACCTGCGCCGCCG‑GGGTGTTGCCGTTTCTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGTTCCACCAACAGCg < 1:740684/140‑1 (MQ=255) ttCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGTTCCACCAACAGCg < 1:1581838/140‑1 (MQ=255) tCAAGCTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGTTCCACCAACAGCGt > 1:1221394/1‑140 (MQ=255) | AATCAATGCACGGGCAGATTTCTCGATCTGCGCTTCACCCAGTTGAAGGATAGCGTGAACATCCTGCTGCACGGCGTTAACCAGTTTGCTGCCGGTGTGACGGTTAACCGCGTTAAGCTGGCGGTTAAAGGTTTCAAACTCTACCTGCGCCGCCA‑GGTTGTTGCCGTTTTTATCCAGCAGCATACGTACCGGCGTCGGTGGCAGGAAGCGGTTGAGCTGCAACTGCTTCGGAGCCTGGGCTTCAACCACATAAATCAGTTCCACCAACAGCGT > NC_000913/60556‑60828 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |