New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3802195 | 68 (1.550) | 3 (0.070) | 3/272 | 3.9 | 4.3% | coding (864/1020 nt) | waaO | UDP‑D‑glucose:(glucosyl)LPS alpha‑1,3‑glucosyltransferase |
? | NC_000913 | 3802199 = | 68 (1.580) | coding (860/1020 nt) | waaO | UDP‑D‑glucose:(glucosyl)LPS alpha‑1,3‑glucosyltransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACT > NC_000913/3802056‑3802334 | cAATAAAATAAAAAAGATAGTTCCTAAATCCCTTTCGATCTCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGcc < 2:208310/140‑1 (MQ=255) aataaaaAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATa < 2:538900/140‑1 (MQ=255) aaaaaaGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAg < 2:377546/140‑1 (MQ=255) aaaaGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGc > 2:133183/1‑140 (MQ=255) aGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTtg < 2:648034/140‑1 (MQ=255) aGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGAt > 2:655213/1‑140 (MQ=255) gTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATa < 1:517337/140‑1 (MQ=255) gTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATa < 2:661921/140‑1 (MQ=255) gTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATa < 1:655213/140‑1 (MQ=255) gTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATa < 2:577511/140‑1 (MQ=255) gTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATa < 2:116347/140‑1 (MQ=255) cTTTTAGATATCTATGCGTTTTAAGCATATGTTTTTCGCCATATCTTACTTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATcc < 2:218463/140‑1 (MQ=255) ttttAGATATCTATGTTTTTTAAGCCTATCTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATccc < 1:217858/140‑1 (MQ=255) tttAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATGTTTTGCCGCCATAAAGGCTTGGGATACAGGATAATCCCa > 2:217858/1‑140 (MQ=255) tAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAgg < 2:669440/140‑1 (MQ=255) gCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGc < 1:675570/140‑1 (MQ=255) cTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGcc < 1:595712/140‑1 (MQ=255) cTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGcc < 2:709330/140‑1 (MQ=255) tttttAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGACTCCATAAAGGCGTCTACTACAGGAGAATCGAAGGCCCAATCATGCCa > 2:354463/1‑140 (MQ=255) ttAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCAtac < 1:559279/135‑3 (MQ=255) ttAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCAtac > 2:559279/1‑133 (MQ=255) ttAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAggg > 1:451458/1‑140 (MQ=255) aaGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCt > 1:384949/1‑140 (MQ=255) tatGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCttggtt > 1:716201/1‑140 (MQ=255) tGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCttggttgg > 2:175516/1‑140 (MQ=255) tGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCttggttgg > 1:449687/1‑140 (MQ=255) ggTTTTGCGCTATATATTAATTTATCGCTCTTGTTCGTTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCttggttgg < 1:308978/139‑1 (MQ=255) ttttGCGCTATATCTTTGTTGATTGCTATTGTTCGTTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGcc < 2:344429/140‑1 (MQ=255) ttttGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGcc < 1:133183/140‑1 (MQ=255) tGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGa > 2:528888/1‑140 (MQ=255) tGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTG‑‑‑CCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGatat > 1:508135/1‑140 (MQ=255) gcgcTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGat > 2:512585/1‑140 (MQ=255) tataTCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATaa > 2:58018/1‑140 (MQ=255) tataTCTTAATTGATCGCTATTCTTAGGTCTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATaa < 1:261999/140‑1 (MQ=255) tatCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCGGGCTCAATCATGCCAGCGCTTAGTTGGCCCGATATAAtc > 2:308978/1‑139 (MQ=255) tatCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCGGGCTCAAACATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATg > 2:267734/1‑140 (MQ=255) tatCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATg < 2:449687/140‑1 (MQ=255) tttAATTGATTGCTACTGTTCGGTTGCAGTAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGAt < 1:354463/139‑1 (MQ=255) cTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGAt < 2:714841/140‑1 (MQ=255) aaTTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATaaa < 2:612933/140‑1 (MQ=255) gattgCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATCCCAGGGCTTGGTTGTCCCGATTTAATGGATAAAAATa > 1:316957/1‑140 (MQ=255) gattgCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTG‑‑‑CCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTa < 2:508135/140‑1 (MQ=255) ttgCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGt > 2:177383/1‑140 (MQ=255) ttgCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGt > 1:435928/1‑140 (MQ=255) ttgCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGt > 2:400153/1‑140 (MQ=255) tgCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTa < 2:451458/140‑1 (MQ=255) aTTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGt < 1:58018/140‑1 (MQ=255) gTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTgg < 2:459788/140‑1 (MQ=255) cGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTa < 1:512585/140‑1 (MQ=255) ggTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCTTGGAGAAGCATGTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTAc < 1:267734/140‑1 (MQ=255) ggTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTAc < 1:565492/140‑1 (MQ=255) ggTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTAc < 2:396989/140‑1 (MQ=255) tttCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTg > 1:398327/1‑140 (MQ=255) tCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGt < 2:734551/129‑1 (MQ=255) tCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGt > 1:734551/1‑129 (MQ=255) cGCCGTATTCTTCCATGTCGAAGCATTTTTTGCCTACATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATaa < 2:300299/140‑1 (MQ=255) gCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATaaa > 1:546138/1‑140 (MQ=255) cGTATTCTTCCATGGCGGAGCATTTTTTGCCTCGAGAAAGGCTTGTGACACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGc < 2:316957/140‑1 (MQ=255) cGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGc < 2:546138/140‑1 (MQ=255) cGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGc < 2:703468/140‑1 (MQ=255) ttcCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGctttcttt > 1:98526/1‑140 (MQ=255) ttcCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGctttcttt > 2:101102/1‑140 (MQ=255) ccATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTtata < 1:658655/127‑1 (MQ=255) ccATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTtata > 2:658655/1‑127 (MQ=255) ccATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGa < 1:466505/140‑1 (MQ=255) ggCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTg < 1:400153/140‑1 (MQ=255) gCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTCTAAAGCTTTGTTTGAGTTGATAAtt > 1:309037/1‑140 (MQ=255) tttttGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAg < 1:601038/140‑1 (MQ=255) ccTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAAc < 1:528888/140‑1 (MQ=255) ccTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAAc < 2:435928/140‑1 (MQ=255) cTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACt < 1:101102/140‑1 (MQ=255) | CAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACT > NC_000913/3802056‑3802334 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |