Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,060,561 | A→G | H270R (CAC→CGC) | argP → | DNA‑binding transcriptional dual regulator ArgP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,060,561 | 0 | A | G | 98.4% | 221.6 / NA | 64 | H270R (CAC→CGC) | argP | DNA‑binding transcriptional dual regulator ArgP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (32/31); minor base T (0/1); total (32/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCGTTCGTACAACTTGCTCGCCAGGGCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCACCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGCACATATCAGGCGTTGTCCTCACTTC > NC_000913/3060428‑3060694 | gCGTTCGTACAACTTGCTCGCCAGGGCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCtt < 1:494029/140‑1 (MQ=255) ttCGTACAACTTGCTCGCCAGGGCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGc > 1:709840/1‑140 (MQ=255) ttCGTACAACTTGCTCGCCAGGGCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGc > 1:35327/1‑140 (MQ=255) ttCGTACAACTTGCTCGCCAGGGCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGc > 2:370886/1‑140 (MQ=255) ttCGTACAACTTGCTCGCCAGGGCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGc > 2:521946/1‑140 (MQ=255) cGTACAACTTGCTCGCCAGGGCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACAACGAATACTCTACAGGCGCCGCTTTGCTc > 1:254041/1‑140 (MQ=255) cAACTTGCTCGCCAGGGCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGa < 1:411355/140‑1 (MQ=255) cTTGCTCGCCAGGGCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAATGACGGATGCTCGACGGGCGCCACTTTGCTCCTGAAAg > 1:205452/1‑140 (MQ=255) ggCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTATTGGAGCCGCTTTGCTCCCGAAAGCCGCATGATGCg > 2:246880/1‑140 (MQ=255) caccTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAg > 1:716504/1‑140 (MQ=255) tATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATg < 1:403867/140‑1 (MQ=255) aTGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGc > 1:252633/1‑140 (MQ=255) tCCCGCACCTGCAAATCGAGAATGACCTGCCCAGCGGCGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTa < 1:191524/140‑1 (MQ=255) cccGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTAc < 1:561116/140‑1 (MQ=255) cGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTTACTGATGCGTTACTc > 1:476365/1‑140 (MQ=255) cGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTc > 1:699730/1‑140 (MQ=255) cGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTc > 2:635598/1‑140 (MQ=255) cACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGa > 2:114635/1‑140 (MQ=255) cACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTCTGCTCCTGGAAGACGCGTGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGa > 2:295684/1‑140 (MQ=255) aCCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGAt < 2:637528/140‑1 (MQ=255) ccTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAACGCCTCATAATGCGTAAAGTCATTGATGCGTAACTCGAtt > 2:343791/1‑140 (MQ=255) ccTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGAtt > 1:713692/1‑140 (MQ=255) gCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAAGTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATg < 2:252633/140‑1 (MQ=255) gCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATg > 2:491370/1‑140 (MQ=255) gCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATg > 2:118139/1‑140 (MQ=255) cAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATg < 2:100555/124‑1 (MQ=255) cAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATg > 1:100555/1‑124 (MQ=255) cAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATgg > 2:56240/1‑140 (MQ=255) cGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTCTTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTcaca < 2:301463/140‑1 (MQ=255) agaAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGTCGCATGATTCGTTAAGTCACTGATGAGTTAGTCGATTATGGTCACaaa > 2:213175/1‑140 (MQ=255) aaGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTATAGTCACTAATGGGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTc > 1:351087/1‑140 (MQ=255) agagCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTcc < 2:35327/140‑1 (MQ=255) agagCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTcc < 1:114635/140‑1 (MQ=255) agagCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTcc < 1:491370/140‑1 (MQ=255) tGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTCACGCCTGGGCTCTTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGt < 1:343791/140‑1 (MQ=255) tGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGt < 1:56240/140‑1 (MQ=255) ggCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTc > 1:135453/1‑140 (MQ=255) cAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACACGAATACGGTCACCAAGTCCTTCGTCAgg > 1:259037/1‑140 (MQ=255) ggTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTTACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTa < 2:476365/140‑1 (MQ=255) tGAACTGATTGACTTAATGCCTAGGCTATTTAAACTACGCATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAAt < 2:205452/140‑1 (MQ=255) aaCTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATcc > 2:411944/1‑140 (MQ=255) aaCTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACACGATTATGGTCACAGAGTCCTTCGTCAGGATTAATcc > 1:223302/1‑140 (MQ=255) cTGATTGACTTAACGCTAGGGCTATTTCAACGACGCATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCAt < 2:332677/140‑1 (MQ=255) aTTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAATTCACTGGTGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCaa > 2:30669/1‑140 (MQ=255) aTTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCATTCGTCCGGATTAATCCATCaa > 1:332677/1‑140 (MQ=255) gACTTAACGCCTGGGCTCTTTCCACGACGGAAGCTATACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAaata < 2:231884/140‑1 (MQ=255) aCTTAACGCCTGGGCTATTTCAGCGGCGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAaataa < 1:246880/140‑1 (MQ=255) cTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAaataat > 1:504885/1‑140 (MQ=255) aaCGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGcc < 2:709840/140‑1 (MQ=255) cGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTg > 1:403439/1‑140 (MQ=255) cGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTg > 2:614380/1‑140 (MQ=255) gCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGa < 1:447855/140‑1 (MQ=255) gCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGa < 1:583054/140‑1 (MQ=255) gggCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGc < 1:411944/140‑1 (MQ=255) ggCTATTTTAACGACGCTTGCTCTACTGGCTACTCGTTGCTCCTGAAAACCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGca < 2:351087/140‑1 (MQ=255) ggCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGca < 2:558974/140‑1 (MQ=255) tttCAACGACGGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGCACatat < 2:135453/140‑1 (MQ=255) cgacgGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGCACATATCAGGCg < 1:521946/140‑1 (MQ=255) cgacgGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGCACATATCAGGCg < 1:118139/140‑1 (MQ=255) cgacgGATGCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGCACATATCAGGCg > 1:607075/1‑140 (MQ=255) gATGCTCTACTGGCGCCGCTTTCCTCCAGAAGGCCGCATTATGCGTAATGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGCACATATCAGGCGTTGTc < 2:254041/140‑1 (MQ=255) aTGCTCTACTGGCGCTGCTTTGTTCGTGACAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGCACATATCAGGCGTTGTcc < 1:295684/140‑1 (MQ=255) gCTCTACTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGCACATATCAGGCGTTGTCCTc < 1:714077/140‑1 (MQ=255) aCTGGCGCCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGAATATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGCACATATCAGGCGTTGTCCTCActtc < 1:370886/140‑1 (MQ=255) | GCGTTCGTACAACTTGCTCGCCAGGGCACCACCTGCTGTATGATCCCGCACCTGCAAATCGAGAAAGAGCTGGCCAGCGGTGAACTGATTGACTTAACGCCTGGGCTATTTCAACGACGGATGCTCTACTGGCACCGCTTTGCTCCTGAAAGCCGCATGATGCGTAAAGTCACTGATGCGTTACTCGATTATGGTCACAAAGTCCTTCGTCAGGATTAATCCATCAAATAATGCCTGATAGCACATATCAGGCGTTGTCCTCACTTC > NC_000913/3060428‑3060694 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |