Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 791,005 | G→A | H9Y (CAT→TAT) | galT ← | galactose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 791,005 | 0 | G | A | 96.7% | 87.3 / NA | 30 | H9Y (CAT→TAT) | galT | galactose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (14/15); minor base C (1/0); total (15/15) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GAGGAAGCAATCTGGATCGTGCGCAGGTAACACCTGTTTGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATGATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGATGGCGTGACTGCCAGTGCCAGGTGTCCTGCGCCATTTCATCGAGTGTGCGCGTTACGCGCCAGTTCAGTTC > NC_000913/790868‑791131 | gagGAAGCAATCTGGATCGTGCGCAGGTAACACCTGTTTGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCTATTGCCCCGTGAGCGGTTTGTAGCGGCGATGTGgataat > 2:319991/1‑140 (MQ=255) gCAATCTGGATCGTGCGCAGGTAACACCTGTTTGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACgg < 1:736573/140‑1 (MQ=255) ggATCGTGCGCAGGTTACACCTGTTTGGCTGGCGTTTGCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTaaa < 1:252494/140‑1 (MQ=255) ggATCGTGCGCAGGTAACACCTGTTTGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTaaa > 2:662639/1‑140 (MQ=255) tGCGCAGGTAACACCTGTTTGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGt > 2:621648/1‑140 (MQ=255) tGCGCAGGTAACACCTGTTTGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTAGTAGCGGCGATGTGGAGAATCCACGGGATTAAATTGCGt > 2:229566/1‑140 (MQ=255) gcgcAGGTAACACCTGTTTGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTAAGCGGGTTTTAGCGGCGATGTGGATCATCAACGGGATTAAATTGCGTc > 2:252494/1‑140 (MQ=255) acCTGTTTGGCTGGCGTTTCCTCCGTCCCCTGCCAGGTGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTcc < 1:188075/140‑1 (MQ=255) tttGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGTGATGTGGAGAATTAACGGGATTAAACTGCGTCATGGTCGTTCCTTAAt > 2:269286/1‑140 (MQ=255) tttGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAAt > 2:589268/1‑140 (MQ=255) tttGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAAt > 1:534415/1‑140 (MQ=255) tttGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGAGGGGGTTATTCAACGGGTTAAAATGGCGCAGTGGCCGTCCCTTAAt > 1:688636/1‑140 (MQ=255) ggctggcGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCgg > 1:512366/1‑140 (MQ=255) gtgggGTTTCCTGCGCCCCCTGGCCGGGGCGGTTTAGGGGGGGGGGGGAAACCAGGATTCCTTTCCCGGGTGA‑CGGGTTGTTGGGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGa < 2:688636/139‑1 (MQ=255) ctggcGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGa < 2:512366/140‑1 (MQ=255) ccTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCtgt > 2:577382/1‑140 (MQ=255) gcgcCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAGCCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGa < 1:662639/140‑1 (MQ=255) gcgcCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGa < 1:621648/140‑1 (MQ=255) cTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGATGGCGTGACtgccagtgcc > 1:172380/1‑140 (MQ=255) ttAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGGCGTTCCTTAATCGGGAGATCCCTGTTGATGGCGTGACtgccagtgcca > 2:215461/1‑140 (MQ=255) gtgAAACCA‑GAATCCATTGCCCTGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGATGGCGTGACTGCCAGTGCCAGGTGTCCTGCGcc < 1:269286/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gCGGGTTGTAGCGGCGAGGTGGATAATCAACAGGATTAATTTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGATGGCGTGACTGCCAGTGCCAGGTGTCCTGCGCCATTTCATCGAGTGTGCGCGTTACgcgc < 2:270983/140‑1 (MQ=255) gCGGGTTGTAGCGGCAATGTGGTTACTCATCGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGATGGCGTGACTGCCAGTGCCAGGTGTCCTGCGCCATTTCATCGAGTGTGCGCGTTACgcgc < 1:229566/140‑1 (MQ=255) gggTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGATGGCGTGACTGCCAGTGCCAGGTGTCCTGTGCCATTTCATCGAGTGTGCGCGTTACGCGCca > 1:116957/1‑140 (MQ=255) ggTTGTAGCGGCGATGTGGATAATCTACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGATGGCGTGACTGCCAGTGCCAGGTGTCCTGCGCCATTTCATCGAGTGTGCGCGTTACGCGCcag < 1:319991/140‑1 (MQ=255) cggcgATGTGGATAATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGATGGCGTGACTGCCAGTGCCAGGAGTCCTGCGGCATCTCATCGAGTGTGCGCGTAACGCGCCagttcagttc > 2:245164/1‑140 (MQ=255) | GAGGAAGCAATCTGGATCGTGCGCAGGTAACACCTGTTTGGCTGGCGTTTCCTGCGCCCCCTGCCAGGGGCGCTTAGCGCGGTGCGGTGAAACCA‑GAATCCATTGCCCGGTGAGCGGGTTGTAGCGGCGATGTGGATGATCAACGGGATTAAATTGCGTCATGGTCGTTCCTTAATCGGGATATCCCTGTGGATGGCGTGACTGCCAGTGCCAGGTGTCCTGCGCCATTTCATCGAGTGTGCGCGTTACGCGCCAGTTCAGTTC > NC_000913/790868‑791131 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |