Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 735,498 | C→A | pseudogene (1279/1434 nt) | ybfO → | conserved protein, rhs‑like YbfO |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 735,498 | 0 | C | A | 100.0% | 199.8 / NA | 57 | pseudogene (1279/1434 nt) | ybfO | conserved protein, rhs‑like YbfO |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (26/31); total (26/31) |
CGACTACACACTGTATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGCCAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGCTAAGATGAAACAG > NC_000913/735374‑735626 | cGACTACATACTGTATTGTAGGTAGTGGGTCAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACt < 1:246230/133‑1 (MQ=255) acacTGTATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTac > 2:520421/1‑133 (MQ=255) acTGTATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTacca < 2:475070/133‑1 (MQ=255) acTGTATTCCAGGAAATGGGTAAAACCAAAACTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTacca < 1:213451/133‑1 (MQ=255) cTGTATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTCCCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTaccac < 2:588259/133‑1 (MQ=255) cTGTATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTaccac < 1:127229/133‑1 (MQ=255) cTGTATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTaccac < 1:459202/133‑1 (MQ=255) cTGTATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAACCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTaccac < 1:585342/133‑1 (MQ=255) tGTATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTaccacc > 2:589990/1‑133 (MQ=255) tATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTaccac < 1:137852/130‑1 (MQ=255) tATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTaccac > 2:137852/1‑130 (MQ=255) ttGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGa < 2:523667/133‑1 (MQ=255) gCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGata < 2:494820/133‑1 (MQ=255) cAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAAATGGACAAGAACCCACTTACCAACAGGatat > 1:306502/1‑133 (MQ=255) gtaaGTGGGCAAAACTAAATCTGACTTGGACGCCACAGGATAATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATAc < 2:312877/131‑1 (MQ=255) ggAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATAc > 2:120885/1‑133 (MQ=255) aaGTGGGTAAAACCACATCTGACTAGTATGCCGCAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACtt < 2:230569/133‑1 (MQ=255) aGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGATAACAACTTAATAACGACCAGGATATACTtg > 1:214005/1‑133 (MQ=255) aGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTtg > 1:332688/1‑133 (MQ=255) aGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTtg > 1:330040/1‑133 (MQ=255) aGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACAACCAGGATATACTtg > 2:205379/1‑133 (MQ=255) ggTAAAACTAAATCTAACCTGTCCGCCACAAGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCa < 1:231536/133‑1 (MQ=255) ggTAAAACCAAATCTTACTTGTACTCCAGAGGATGATTCCCGGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCa < 2:214005/133‑1 (MQ=255) aaaaCCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGaa < 1:97525/133‑1 (MQ=255) agaCCAAATGAGACTTGTACGCCTAAGGTTGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAAc < 2:306502/131‑1 (MQ=255) aaaCCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAAc < 2:448768/133‑1 (MQ=255) aaCCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAAcc > 1:369235/1‑133 (MQ=255) ccAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCt > 1:487330/1‑133 (MQ=255) aCTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCtatt < 2:81327/127‑1 (MQ=255) aCTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCtatt > 1:81327/1‑127 (MQ=255) aCTTGTACCCCACAGTATCATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTcc < 1:185463/133‑1 (MQ=255) aCGCCACAGGGTGATGCCCAGTATGCAGTGATGGATACAAAAACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACa < 2:272544/133‑1 (MQ=255) caGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGGAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATtaata > 2:401558/1‑133 (MQ=255) caGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATtaata > 2:322878/1‑133 (MQ=255) gatgatTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGTAGAACCCGATTTATTCACAGATATTAATAAAc > 2:168108/1‑133 (MQ=255) atTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGa < 2:369235/133‑1 (MQ=255) ttCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGAt > 2:136842/1‑133 (MQ=255) aGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGcc < 1:520421/133‑1 (MQ=255) tCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCa < 2:340217/133‑1 (MQ=255) aGGTATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAAca < 2:617516/133‑1 (MQ=255) ggatggatACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAAcagc < 2:330040/133‑1 (MQ=255) tggatACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAgg > 2:553832/1‑133 (MQ=255) gatACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTGATAAACCGGATAGGGCAGCAAGAGCAGGGa > 1:197077/1‑133 (MQ=255) gatACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGa > 2:511415/1‑133 (MQ=255) gatACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATACCCAGACAATAAGAAATCCGATGGGGCAGCAACAGCAGGGa > 2:177886/1‑133 (MQ=255) aGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTg > 2:149008/1‑133 (MQ=255) aGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTg > 1:394387/1‑133 (MQ=255) aGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGAGGGGCCAGGAACGGCTGGGATATATGATTTg > 1:170316/1‑133 (MQ=255) cAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTggg > 1:71439/1‑133 (MQ=255) aTTACCTGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAAt > 1:389679/1‑133 (MQ=255) tGCCACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGc < 1:322878/133‑1 (MQ=255) ccACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGCTa < 2:493381/133‑1 (MQ=255) ccACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGCTa < 1:511415/133‑1 (MQ=255) ccACAGACAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGCTa < 2:70770/133‑1 (MQ=255) aCAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGCTAAg < 2:489363/129‑1 (MQ=255) aCAAATTGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGCTAAg > 1:489363/1‑129 (MQ=255) ttGGACAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGCTAAGATGAAACag < 2:332688/133‑1 (MQ=255) | CGACTACACACTGTATTGCAGGAAGTGGGTAAAACCAAATCTGACTTGTACGCCACAGGATGATTCCCAGTATCCAGGGATGGATACAAAGACAGCAAGTGATTACCTGCCACAGACAAATTGGCCAACAACTCAATTACCACCAGGATATACTTGTGCAGAACCCTATTTATTCCCAGACATTAATAAACCCGATGGGCCAGCAACAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGCTAAGATGAAACAG > NC_000913/735374‑735626 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |