| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,902,076 | (T)5→6 | coding (145/1617 nt) | bglH ← | carbohydrate‑specific outer membrane porin, cryptic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,902,071 | 1 | . | T | 92.1% | 246.6 / 11.2 | 77 | coding (150/1617 nt) | bglH | carbohydrate‑specific outer membrane porin, cryptic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/4); new base T (38/32); total (41/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTCATTTTTGACCAGTACAGCATCAGGTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑C‑T‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAGATGGCAGAGG > NC_000913/3901933‑3902198 | ttCATTTTTGACCAGTACAGCATCAGGTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑C‑t > 1:190068/1‑140 (MQ=255) cATTTTTGACCAGTACAGCATCAGGTTTTACGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑C‑t‑tt < 1:275116/140‑1 (MQ=255) tGACCAGTACAGCATCAGGTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑C‑t‑tttttgag < 1:175571/140‑5 (MQ=255) gACCAGTACAGCATCAGGTTTTTCGGCACTATTGGACGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑C‑t‑tttttgagt < 2:326181/140‑6 (MQ=255) tACAGCATCAGGTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTATTCTTCTGTTCGTCGTTATA‑CGT‑TTTT‑GAGTTCGCtt > 1:212227/1‑140 (MQ=255) cATCAGGTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATC‑C‑T‑TTTTAGAGTTCGCTTTGCGt > 1:364758/1‑140 (MQ=255) cATCAGGTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGt < 2:85268/140‑1 (MQ=255) cATCAGGTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGt > 2:491859/1‑140 (MQ=255) aTCAGGTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGtt > 2:86944/1‑140 (MQ=255) ggTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATACC‑T‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTtctc > 1:428144/1‑140 (MQ=255) ggTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTtctc > 1:457900/1‑140 (MQ=255) ggTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTtctc > 1:110741/1‑140 (MQ=255) ttttGCGGAACTACTGGTCGGGCACGGATTGCCGGCATAACCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCtt < 2:391203/140‑1 (MQ=255) tGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAAc > 1:484931/1‑140 (MQ=255) tGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAAc > 1:114867/1‑140 (MQ=255) gCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACg < 1:631045/140‑1 (MQ=255) gCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACg < 2:190068/140‑1 (MQ=255) ctGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCta > 1:496453/1‑140 (MQ=255) ctGGTCGGGAACGGATCGGCGGTATACCCTTTATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCta < 2:364758/140‑1 (MQ=255) tGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCtaa < 1:86944/140‑1 (MQ=255) cGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGc > 2:513242/1‑127 (MQ=255) cGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGc < 1:513242/127‑1 (MQ=255) ggAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTc > 1:693988/1‑140 (MQ=255) gAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCa > 1:67337/1‑140 (MQ=255) cGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAgg > 1:43654/1‑140 (MQ=255) gATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GGGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCg < 2:172895/140‑1 (MQ=255) gATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GGGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCg > 1:172895/1‑140 (MQ=255) gATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCg > 2:21214/1‑140 (MQ=255) gATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCg < 2:729950/140‑1 (MQ=255) gcATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCa < 2:67337/140‑1 (MQ=255) gcATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCa < 1:166555/140‑1 (MQ=255) cATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCAc > 2:138216/1‑140 (MQ=255) tGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATg < 2:449788/140‑1 (MQ=255) gATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGa > 1:773135/1‑140 (MQ=255) tCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATACC‑T‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGAtt < 2:428144/140‑1 (MQ=255) tCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGAtt < 1:21214/140‑1 (MQ=255) tCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGAtt < 2:773135/140‑1 (MQ=255) tCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGAtt < 2:484931/140‑1 (MQ=255) aTTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCa > 2:140878/1‑140 (MQ=255) ttCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAg > 2:623786/1‑140 (MQ=255) tCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTATCGCCTTTTTTAATAACACAAGGCGTTGTTCGACCGTTAATGATTCAGc > 2:329863/1‑140 (MQ=255) tCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGc > 2:572690/1‑140 (MQ=255) tCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGc > 1:729557/1‑140 (MQ=255) tCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGc > 2:606348/1‑140 (MQ=255) tCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGc > 1:36230/1‑140 (MQ=255) gTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGAtt < 1:62391/134‑1 (MQ=255) gTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGAtt > 2:62391/1‑134 (MQ=255) gCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAATGCGTTGTTCCAGCGTTAATGAGTCAGCCAATGATtgt > 1:269492/1‑140 (MQ=255) gCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATtgt > 1:686166/1‑140 (MQ=255) gCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATtgt > 1:442077/1‑140 (MQ=255) gCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATtgt < 2:36230/140‑1 (MQ=255) cGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGcc < 2:441093/127‑1 (MQ=255) cGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGcc > 1:441093/1‑127 (MQ=255) cGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGa < 2:514140/132‑1 (MQ=255) cGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGa > 1:514140/1‑132 (MQ=255) cGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAg > 1:1231/1‑140 (MQ=255) cGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGATGTTCCAGCGTTAAGGATTCAGCCAATGATTGTGCAg > 1:210988/1‑140 (MQ=255) aTTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGaa < 2:114867/140‑1 (MQ=255) aCCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCGGCCAATGATTGTGCAGAAAAgg > 1:324776/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGGGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTaa > 2:36526/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTaa > 2:723827/1‑140 (MQ=255) gCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACg < 1:712483/140‑1 (MQ=255) gggCGTATACTTTTTATTCTCTTCAGCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGt < 1:343860/139‑1 (MQ=255) ggCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTg < 1:140878/140‑1 (MQ=255) ggCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTg < 1:572690/140‑1 (MQ=255) cGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGcc < 2:457900/140‑1 (MQ=255) cGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGcc > 1:642229/1‑140 (MQ=255) ataCTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCAtt < 2:110741/140‑1 (MQ=255) aCTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATtaa < 2:442077/140‑1 (MQ=255) tttCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAg > 2:90553/1‑140 (MQ=255) tttCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAg > 2:103100/1‑140 (MQ=255) tttCTTCTCTTCATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAAGGATTCAGCCAATGATTATGCAGAAAGGGCTAACGGTGCCATtaataac > 2:343860/1‑139 (MQ=255) ttctcttcATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAGATgg < 1:138216/140‑1 (MQ=255) ttctcttcATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAGATgg < 1:674312/140‑1 (MQ=255) tctcttcATCTTTATA‑C‑T‑TTTTGGAGTTCTCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAGATGGc < 1:327188/140‑1 (MQ=255) tctcttcAACTTTATAGT‑T‑TTTT‑GAGTTCGCTTCGCGTTTCTCTTAACCCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAGATGGc < 2:404662/140‑1 (MQ=255) ctcttcATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAGATGGCa < 2:496453/140‑1 (MQ=255) ctcttcATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAGATGGCa < 1:90553/140‑1 (MQ=255) ctcttcATCTTTATA‑C‑TCTTTT‑CAGTTCGCTCTGCCTTTCTCTTAACGACTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAGATGGCa < 2:212227/140‑1 (MQ=255) tcttcATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGCGCAGAAAAGGCGAAGGGTGCCATTAATAAGATGGCag > 1:404662/1‑140 (MQ=255) tcATCTTTATA‑CTT‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAGATGGCAGAgg < 1:103100/140‑1 (MQ=255) | TTCATTTTTGACCAGTACAGCATCAGGTTTTGCGGCACTACTGGTCGGGAACGGATTGGCGGCATACCCTTGATCATTCGTACTTACGCTACGATTCACCGTCGCTGGCGTATACTTTTTCTTCTCTTCATCTTTATA‑C‑T‑TTTT‑GAGTTCGCTTTGCGTTTCTCTTAACGCCTTTTCTAATAACTCAAGGCGTTGTTCCACCGTTAATGATTCAGCCAATGATTGTGCAGAAAAGGCTAACGGTGCCATTAATAAGATGGCAGAGG > NC_000913/3901933‑3902198 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |