Predicted mutation
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RA	NC_000913	237,222	A→G	intergenic (+215/‑113)	aspV → / → yafT	tRNA‑Asp/lipoprotein YafT

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*	NC_000913	237,222	0	A	G	100.0%	152.9 / NA	43	intergenic (+215/‑113)	aspV/yafT	tRNA‑Asp/lipoprotein YafT
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (18/25);  total (18/25)

TTACTCTGGCGTAGGTGCGTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAATGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACAGGCGAGGGAGTGTCCAATTATGAATTCAAAAAAGCTTTG  >  NC_000913/237103‑237354                                                                                                                        |                                                                                                                                     ttACTCTGGCGTAGGTGCGTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGAttt                                                                                                                  >  2:448869/1‑140 (MQ=255)        ggCGTAGGTGCGTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTttgtttgt                                                                                                           <  1:39882/140‑1 (MQ=255)        ggCGTAGGTGCGTGATTCTCGCATGTTGTCTCATTCATTTAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTttgtttgt                                                                                                           <  2:321744/140‑1 (MQ=255)          cGTAGGTGCGTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGtta                                                                                                         <  2:454710/140‑1 (MQ=255)              ggTGCGTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTtattat                                                                                                     >  1:505002/1‑140 (MQ=255)              ggTGCGTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTtattat                                                                                                     >  2:442439/1‑140 (MQ=255)                tGCGTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTAttt                                                                                                   <  2:115514/140‑1 (MQ=255)                   gTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAg                                                                                                >  2:722588/1‑140 (MQ=255)                   gTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAg                                                                                                >  1:615439/1‑140 (MQ=255)                   gTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAg                                                                                                >  1:751850/1‑140 (MQ=255)                    tGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGt                                                                                               <  1:722588/140‑1 (MQ=255)                    tGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGt                                                                                               <  2:178671/140‑1 (MQ=255)                    tGATTCTCGCTTGTTGTCTCATCCACTAACATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGt                                                                                               <  1:396885/140‑1 (MQ=255)                        tctcGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAgg                                                                                           <  2:505002/140‑1 (MQ=255)                         ctcGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAATTGAGTGTAGATTTCAAGTTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGt                                                                                          >  2:257299/1‑140 (MQ=255)                          tcGCTTGTTGTCTCATTTATTAGAATTCAATTATGATATGGAACCATTTAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGta                                                                                         <  2:298145/140‑1 (MQ=255)                          tcGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGta                                                                                         <  2:751850/140‑1 (MQ=255)                                 ttgtCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGa                                                                                             >  2:547189/1‑129 (MQ=255)                                 ttgtCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGa                                                                                             <  1:547189/129‑1 (MQ=255)                                    tctcATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTaga                                                                               <  1:514028/140‑1 (MQ=255)                                     ctcATTCATTAAAATGCAATAAGGACATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTagag                                                                              <  1:257299/140‑1 (MQ=255)                                             ttAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTAt                                                                      <  1:603964/140‑1 (MQ=255)                                              tAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATc                                                                     <  1:448869/140‑1 (MQ=255)                                              tAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTGATTATTTCAGTCAGGAATATAGTTAGAGTCCGTTATc                                                                     >  1:343538/1‑140 (MQ=255)                                                    tCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCt                                                               <  1:498383/140‑1 (MQ=255)                                                          atGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAatat                                                         <  2:737636/140‑1 (MQ=255)                                                              tatCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTa                                                     <  1:442439/140‑1 (MQ=255)                                                                tCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAAt                                                   >  2:75025/1‑140 (MQ=255)                                                                   aaCCATTCAGCTTAAATATATTGCTAGAGAAAAAAGTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCAt                                                <  2:343538/140‑1 (MQ=255)                                                                     ccATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGGTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTaa                                                             >  1:613751/1‑125 (MQ=255)                                                                     ccATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGGTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTaa                                                             <  2:613751/125‑1 (MQ=255)                                                                      cATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCt                                                               <  1:533309/122‑1 (MQ=255)                                                                      cATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCt                                                               >  2:533309/1‑122 (MQ=255)                                                                       aTTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATg                                            >  2:419189/1‑140 (MQ=255)                                                                                                  tAAATTTATATTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACAGGCGAGGGAGTGTCCAATTATGaa                 >  1:783652/1‑140 (MQ=255)                                                                                                          tatTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACAGGTGAGGGATTGTCCAATTATGAATTCaaaaa         >  1:358864/1‑140 (MQ=255)                                                                                                          tatTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACAGGCGAGGGAGTGTCCAATTATGAATTCaaaaa         >  1:160545/1‑140 (MQ=255)                                                                                                          tatTGATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACAGGCGAGGGAGTGTCCAATTATGAATTCaaaaa         >  2:690739/1‑140 (MQ=255)                                                                                                              gATTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACAGGCGAGGGAGTGTCCAATTATGAATTCAAAAAAGCt     <  2:490352/140‑1 (MQ=255)                                                                                                               aTTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACTGGCGAGGTAGTGTCTAATTATAAATTCAAAAAAGCtt    >  1:305503/1‑140 (MQ=255)                                                                                                               aTTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACAGGCGAGGGAGTGTCCAATTATGAATTCAAAAAAGCtt    <  2:783652/140‑1 (MQ=255)                                                                                                               aTTAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACAGGCGAGGGAGTGTCCAATTATGAATTCAAAAAAGCtt    <  1:75025/140‑1 (MQ=255)                                                                                                                 tAAATGAGTGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACAGGCGAGGGAGTGTCCAATTATGAATTCAAAAAAGCTttg  <  2:160545/140‑1 (MQ=255)                                                                                                                        |                                                                                                                                     TTACTCTGGCGTAGGTGCGTGATTCTCGCTTGTTGTCTCATTCATTAAAATTCAATAATGATATCGAACCATTCAGCTTAAATATATTTCTAGAGAATAAATTTATATTGATTAAATGAATGTATATTTCAAATTGATTTTGTTTGTTATTATTTAAGTGAGGTATATAATTAGAGTCCGTTATCAATGCTAAATATTCTAATCATTATGACAGGCGAGGGAGTGTCCAATTATGAATTCAAAAAAGCTTTG  >  NC_000913/237103‑237354

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑