| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,701,625 | A→G | T355A (ACG→GCG) | yhjV → | putative transporter YhjV |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,701,625 | 0 | A | G | 98.8% | 281.6 / NA | 81 | T355A (ACG→GCG) | yhjV | putative transporter YhjV |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (35/45); minor base T (0/1); total (35/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGCATTCTTTGGCATTTATCTCGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTACGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCG > NC_000913/3701489‑3701760 | cGCATTCTTTGGCATTTATCTCGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGt > 1:611756/1‑140 (MQ=255)cGCATTCTTTGGCATTTATCTCGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGt > 1:750463/1‑140 (MQ=255) aTTCTTTGGCATTTATCTCGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGa > 1:109085/1‑140 (MQ=255) aTTCTTTGGCATTTATCTCGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGa > 2:72439/1‑140 (MQ=255) aTTCTTTGGCATTTATCTCGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGa > 2:708319/1‑140 (MQ=255) aTTCTTTGGCATTTATCTCGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGa > 2:604314/1‑140 (MQ=255) tttATCTCGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGTCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGgtt > 2:685644/1‑140 (MQ=255) ctcGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGgtttcgtt < 2:750463/140‑1 (MQ=255) ctcGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGgtttcgtt < 2:716445/140‑1 (MQ=255) ctcGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGgtttcgtt < 1:604314/140‑1 (MQ=255) ttCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCgtgt < 2:659778/140‑1 (MQ=255) ttCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCgtgt > 2:15897/1‑140 (MQ=255) ccACGAGGCCATTAAAGGCATTGTTTTCATTCTGTTACGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTAt < 1:358524/140‑1 (MQ=255) ccACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTAt < 1:513392/140‑1 (MQ=255) ccACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTAt < 2:548048/140‑1 (MQ=255) ccACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCAGCGCTTTTGTCGTCATAGCGTTGACGATTTAGGTTTCGTTTCGTGTAt > 2:261175/1‑140 (MQ=255) cACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATc > 2:50072/1‑140 (MQ=255) aGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTg < 2:825837/140‑1 (MQ=255) ggCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGc < 1:81434/140‑1 (MQ=255) gCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCt > 2:563601/1‑140 (MQ=255) aTTAAAGGCATTATTCTCAATCGGTTAAGCCTAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGgt < 2:309838/140‑1 (MQ=255) tAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGgtgt > 2:194689/1‑140 (MQ=255) ggCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCtt > 1:494204/1‑140 (MQ=255) gCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCttt > 2:542842/1‑140 (MQ=255) gCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTGGGGGTTCGTTTCTTGTAGCGGTGCTGGTGTTCttt > 2:250957/1‑140 (MQ=255) cATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGTCGATGTGGGTTTGGTTTCGAGTATCGTTGCTGGTGTTCTTTc > 1:225462/1‑140 (MQ=255) cATTATTCTCAATCTATTAAGCTGAATTAATGATACCTAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTc < 1:393418/140‑1 (MQ=255) tattCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGt > 2:498112/1‑140 (MQ=255) tattCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGt > 2:196109/1‑140 (MQ=255) ctcAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTggg < 1:106269/140‑1 (MQ=255) ctcAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTggg < 2:611756/140‑1 (MQ=255) tcAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGa < 1:194689/140‑1 (MQ=255) tcAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGa < 1:50072/140‑1 (MQ=255) cAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGaa > 2:624744/1‑140 (MQ=255) aaTCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAg > 2:805031/1‑140 (MQ=255) aaTCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAg > 1:520420/1‑140 (MQ=255) aTCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGc < 2:472315/140‑1 (MQ=255) tCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGcc < 2:109085/140‑1 (MQ=255) tCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGcc > 2:126130/1‑140 (MQ=255) tGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCg < 1:685644/140‑1 (MQ=255) tGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCg < 1:72439/140‑1 (MQ=255) tGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCg < 1:281118/140‑1 (MQ=255) tGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCg < 2:5982/140‑1 (MQ=255) tGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCACTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCg < 1:575898/140‑1 (MQ=255) tGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATGAACGCACACGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCg < 2:282287/140‑1 (MQ=255) tGTTAAGCCGAATTAGTGATACGAACAAACTTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCg < 1:261175/140‑1 (MQ=255) gTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGt > 2:55495/1‑140 (MQ=255) ttAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGtt < 2:520420/140‑1 (MQ=255) ttAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTCTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGtt > 1:282287/1‑140 (MQ=255) ttAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACGCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGtt > 2:523513/1‑140 (MQ=255) aGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTtata < 1:533578/140‑1 (MQ=255) aGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTtata < 1:447917/140‑1 (MQ=255) aGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTtata < 1:580237/140‑1 (MQ=255) gCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTTTCGGTGCCGGTGTTCTCTCAGTTGGGAAGCCCGTTatat > 2:281118/1‑140 (MQ=255) ccGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATg > 1:810430/1‑140 (MQ=255) cGAGTTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATgg < 1:123510/140‑1 (MQ=255) cGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGCTGCTGGTGTTCGTTAAGTTGGCAAGCCCGTTATATgg > 1:274621/1‑140 (MQ=255) aaTTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGtt < 2:377443/132‑1 (MQ=255) aaTTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGtt > 1:377443/1‑132 (MQ=255) aaTTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTa < 1:55495/140‑1 (MQ=255) gATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTc < 1:708319/140‑1 (MQ=255) ccAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGc < 1:196109/140‑1 (MQ=255) gAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTc < 2:438118/132‑1 (MQ=255) gAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTc > 1:438118/1‑132 (MQ=255) cACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTc < 1:126130/140‑1 (MQ=255) cACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTc < 1:805031/140‑1 (MQ=255) cACGCGTGCTGACTCAGGCGATATGAGCTTTTATCGTTATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTc < 1:385821/140‑1 (MQ=255) gcgTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTg < 1:624744/140‑1 (MQ=255) gcgTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTg < 1:542842/140‑1 (MQ=255) gcgTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTg < 1:563601/140‑1 (MQ=255) tGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGCAGCCCGTTCTATAGCAAGGTGTCGTGCCTCGATCCGTTTTTCCTGATc > 2:385821/1‑140 (MQ=255) cTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGATTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCta > 2:7654/1‑140 (MQ=255) gACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCtata < 1:498112/140‑1 (MQ=255) tGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTc > 1:150800/1‑140 (MQ=255) tGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTc > 1:422913/1‑140 (MQ=255) ggCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCg > 1:644020/1‑140 (MQ=255) ggCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCg > 2:763360/1‑140 (MQ=255) ggCGATCTGCGCTTTCATCGTCTTTTCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCg < 1:250957/140‑1 (MQ=255) gagacagcTTTTATCGTAATTGAGTTGACGACTTGGGTTCCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGcaca < 2:312249/134‑1 (MQ=255) gTCATTGCGTTGACGATTTGGGATTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTcg < 1:7654/140‑1 (MQ=255) cATTGCGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTcgcg < 1:15897/140‑1 (MQ=255) cATTGCGTTGACGATATGGGTTTCGTTTCCTGTATCGATGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTcgcg < 1:257328/140‑1 (MQ=255) | CGCATTCTTTGGCATTTATCTCGGTTTCCACGAGGCCATTAAAGGCATTATTCTCAATCTGTTAAGCCGAATTATTGATACCAAGAAAATTAACTCACGCGTGCTGACTCTGGCGATCTGCGCTTTTATCGTCATTACGTTGACGATTTGGGTTTCGTTTCGTGTATCGGTGCTGGTGTTCTTTCAGTTGGGAAGCCCGTTATATGGTATTGTGTCGTGCCTCATTCCGTTTTTCCTGATCTATAAAGTCGCACAACTGGAAAAACTTCGCG > NC_000913/3701489‑3701760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |