| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,012,958 | T→C | intergenic (‑142/‑95) | metR ← / → metE | DNA‑binding transcriptional dual regulator MetR/cobalamin‑independent homocysteine transmethylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,012,958 | 0 | T | C | 98.7% | 258.4 / NA | 74 | intergenic (‑142/‑95) | metR/metE | DNA‑binding transcriptional dual regulator MetR/cobalamin‑independent homocysteine transmethylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (34/39); minor base G (1/0); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGACAATATTGAATCACACCCTCGGT > NC_000913/4012823‑4013079 | ccTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCact < 2:574137/140‑1 (MQ=255) cTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCCGCGTTTCTCCACCCCGGCCactt < 1:600061/140‑1 (MQ=255) ttCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCactta < 1:164147/140‑1 (MQ=255) cACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTTGCTACGCTTCTCCACCCCGGCCacttact > 1:334446/1‑140 (MQ=255) cGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAGTTTATGGTGCGTCGGCAGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGt > 2:292395/1‑140 (MQ=255) cGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGt > 2:775035/1‑140 (MQ=255) cGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGt > 2:457364/1‑140 (MQ=255) cGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGCCCACTTACTTCAGt > 2:700294/1‑140 (MQ=255) cGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTACGTTGACTCCGTTTCTACACCAAGGCCACTAACTTCAGt > 2:389198/1‑140 (MQ=255) ggCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTa > 2:770787/1‑140 (MQ=255) gCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTGGGCTGCGGTTCGCCGCCCCGGGCACTTACTTCAGTaa > 1:212622/1‑140 (MQ=255) gCATGAATAATTTGCGCTTGAGCAATATACAATAAGCGCTAATTATGGGTGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTaa < 2:334446/140‑1 (MQ=255) cATGAATAATTTGCGTTTGAGGTATTTACTGTAACCGTCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAg < 1:256884/140‑1 (MQ=255) atTTGCGCTTGAGGAATTTACAGTAACCGCCTATTATGGCTGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCggg < 2:305992/140‑1 (MQ=255) atTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCggg < 1:457364/140‑1 (MQ=255) tttGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCgggg < 2:593258/140‑1 (MQ=255) cgcTTGAGGAATATACAGTACCCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGa > 1:666887/1‑140 (MQ=255) cgcTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGa > 2:800102/1‑140 (MQ=255) cTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAAt > 2:469769/1‑140 (MQ=255) tAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTcc > 2:551553/1‑140 (MQ=255) tAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTcc > 1:770426/1‑140 (MQ=255) aCCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCt > 1:695295/1‑140 (MQ=255) ccGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTa > 1:806748/1‑140 (MQ=255) ccGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTa > 1:164484/1‑140 (MQ=255) ccGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTa > 1:450496/1‑140 (MQ=255) cGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTaa < 2:770426/140‑1 (MQ=255) cGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTaa > 2:622925/1‑140 (MQ=255) aaTTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTc > 1:357690/1‑140 (MQ=255) gttATGGATGTGTAAACATCTGCACCGCTGAAATCCTACGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCa < 1:401059/139‑1 (MQ=255) ttATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCt < 1:415966/132‑1 (MQ=255) ttATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCt > 2:415966/1‑132 (MQ=255) ttATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCaa < 1:551553/140‑1 (MQ=255) tATGGATGTGTAAACATCTGGAGGGGTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCaaa < 1:292395/140‑1 (MQ=255) tATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCaaa < 2:164484/140‑1 (MQ=255) ggATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATc > 2:706895/1‑140 (MQ=255) aTGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCa < 1:71290/140‑1 (MQ=255) tgtgTAAACATCTGGTCGGCTACAAGCCTGCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTATCCCCCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCAt < 1:389198/140‑1 (MQ=255) tgtgTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCAt < 2:357690/140‑1 (MQ=255) tgtAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTAGCCGCCATCCCTAAATTCAAAATCCATAg > 1:369695/1‑140 (MQ=255) tAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCAt < 2:465509/136‑1 (MQ=255) tAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCAt > 1:465509/1‑136 (MQ=255) tAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGa > 1:517794/1‑140 (MQ=255) tAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCACGGGGATGCATAAAGTTTCCGCCTTGCCTAAATTCAAAAACCATAggc > 2:401059/1‑139 (MQ=255) aaCATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCa < 1:656980/133‑1 (MQ=255) aaCATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGAtt < 2:666887/140‑1 (MQ=255) aaCATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGAtt < 1:706895/140‑1 (MQ=255) aaCATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGAtt < 1:770787/140‑1 (MQ=255) aaCATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTACCCTAAATTCAAAATCCa > 2:656980/1‑133 (MQ=255) aaCATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCCGGGATGAATAAAGTTGACGCCTTCCATAAAATCAAAATCCATAGGAtt > 2:223012/1‑140 (MQ=255) aCATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGAttt < 1:775035/140‑1 (MQ=255) aTCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTAc < 2:450496/140‑1 (MQ=255) tCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTCAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACCTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCa < 2:337998/129‑1 (MQ=255) tCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACCTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCa > 1:337998/1‑129 (MQ=255) cTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCAt > 2:52343/1‑129 (MQ=255) cTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCAt < 1:52343/129‑1 (MQ=255) cTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACat < 2:806748/140‑1 (MQ=255) cTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACat < 1:469769/140‑1 (MQ=255) tGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACata > 1:470685/1‑140 (MQ=255) tGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACata > 1:128057/1‑140 (MQ=255) ggACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACatat > 1:2971/1‑140 (MQ=255) gACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGATTAAACTTGGCGCTTTCACTAAATTCGAAATACATAGGATTTACAtata > 2:214088/1‑140 (MQ=255) tAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTaga < 2:4420/140‑1 (MQ=255) tAAAATCCTTCGTCTATTAAATATACGGTTCGTTGGCCGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTaga < 1:223012/140‑1 (MQ=255) tCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGaaaa < 2:695295/140‑1 (MQ=255) tttAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGAc < 2:517794/140‑1 (MQ=255) aaTTTATGGTGCGTTGGCTGCGGTTCTCCACCCTGTCCAATTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGACAata < 2:369695/140‑1 (MQ=255) tttATGGTGCGTTGGCTCCGTTCCTCCACCCCGGCAACTTACTTCAGTCAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGACAATAtt < 2:212622/140‑1 (MQ=255) tATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGAc < 2:499853/132‑1 (MQ=255) tATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGAc > 1:499853/1‑132 (MQ=255) ggTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGACAATATTGAATc > 1:736992/1‑140 (MQ=255) gTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGACAATATTGAATca < 1:622925/140‑1 (MQ=255) tGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGACAATATTGAATcac < 2:470685/140‑1 (MQ=255) tGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGACAATATTGAATcac < 2:736992/140‑1 (MQ=255) tGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGACAATATTGAATcac > 1:520479/1‑140 (MQ=255) tGCGTTTCTCCACCCCGGCCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGACAATATTGAATCACACCCTCGGt < 1:700294/140‑1 (MQ=255) | CCTTCACTTCGGCATGAATAATTTGCGCTTGAGGAATATACAGTAACCGCCAATTATGGATGTGTAAACATCTGGACGGCTAAAATCCTTCGTCTTTTAAATTTATGGTGCGTTGGCTGCGTTTCTCCACCCCGGTCACTTACTTCAGTAAGCTCCCGGGGATGAATAAACTTGCCGCCTTCCCTAAATTCAAAATCCATAGGATTTACATATAATTAGAGGAAGAAAAAATGACAATATTGAATCACACCCTCGGT > NC_000913/4012823‑4013079 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |