Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 786,717 | C→T | intergenic (+32/+126) | aroG → / ← gpmA | 3‑deoxy‑7‑phosphoheptulonate synthase, Phe‑sensitive/2,3‑bisphosphoglycerate‑dependent phosphoglycerate mutase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 786,717 | 0 | C | T | 100.0% | 124.9 / NA | 39 | intergenic (+32/+126) | aroG/gpmA | 3‑deoxy‑7‑phosphoheptulonate synthase, Phe‑sensitive/2,3‑bisphosphoglycerate‑dependent phosphoglycerate mutase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (18/21); total (18/21) |
ACGGTAAGAGCATCACCGATGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGCGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAGTCGGCTTTCTCATTTTAAACGAATGACGTTTACTTCG > NC_000913/786591‑786850 | aCGGTAAGAGCATCACCGATGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAAt < 1:632171/140‑1 (MQ=255) aCGGTAAGAGCATCACCGATGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAAt < 1:42528/140‑1 (MQ=255) aaGAGCATCACCGATGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATcacca < 2:566821/140‑1 (MQ=255) cACCGATGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATcacca < 2:180914/132‑1 (MQ=255) cACCGATGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATcacca > 1:180914/1‑132 (MQ=255) cACCGATGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGGGGTGTATCCGATGAATCCCCACACGCCTg > 1:561469/1‑140 (MQ=255) aCCGATGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGa > 1:56460/1‑140 (MQ=255) aTGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTGATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAg > 2:496787/1‑140 (MQ=255) aTGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAg < 2:809911/140‑1 (MQ=255) aTGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAg > 2:797154/1‑140 (MQ=255) aTGCCTGCATCGGCTGGGAAGACACCGATGCTCTGGTACTTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAg < 2:274748/140‑1 (MQ=255) cGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCg < 2:162519/140‑1 (MQ=255) aCCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCa > 2:173127/1‑139 (MQ=255) aCCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCa < 1:173127/139‑1 (MQ=255) gATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAAtgt > 2:651989/1‑140 (MQ=255) aTGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAAtgtg > 2:644991/1‑140 (MQ=255) aTGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAAtgtg < 2:796404/140‑1 (MQ=255) aTGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAAtgtg < 1:162898/140‑1 (MQ=255) aTGCTCTGGTACGTCAACTGGCTAATGCAGTAAGATCGCCTCGCGGGTTAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAAtgtg < 2:404273/140‑1 (MQ=255) tGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGc > 1:198634/1‑140 (MQ=255) tctGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTcc > 1:462491/1‑140 (MQ=255) tctGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTcc > 1:184968/1‑140 (MQ=255) aCGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGtt < 2:198634/140‑1 (MQ=255) aCTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGcaac > 1:123689/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGcaac > 1:160419/1‑140 (MQ=255) ggCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACaaa < 1:797154/140‑1 (MQ=255) gCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACaaaa > 1:640651/1‑140 (MQ=255) cAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGa < 2:68817/140‑1 (MQ=255) tAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTc > 2:504307/1‑140 (MQ=255) tAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTc > 2:105802/1‑140 (MQ=255) aaaGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCAc < 2:56460/140‑1 (MQ=255) cgTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAg > 1:629460/1‑140 (MQ=255) cgTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAg > 1:197279/1‑140 (MQ=255) tCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAGTc > 1:465040/1‑140 (MQ=255) gTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAGTCGGCttt < 1:651989/140‑1 (MQ=255) tAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAGTCGGCTTtc < 2:197279/140‑1 (MQ=255) aactGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAGTCGGCTTTCTCATTTTa < 2:490283/137‑1 (MQ=255) ggATGCGCCGTCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCGATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAGTCGGCTTTCTCATTTTAAACGAAt < 2:561469/140‑1 (MQ=255) tCAGAGTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAGTCGGCTTTCTCATTTTAAACGAATGACGTTTACt < 1:685118/140‑1 (MQ=255) gagTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCTGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAGTCGGCTTTCTCATTTTAAACGAATGACGTTTACTTCg < 1:504307/140‑1 (MQ=255) gagTGGTGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAGTCGGCTTTCTCATTTTAAACGAATGACGTTTACTTCg < 1:105802/140‑1 (MQ=255) | ACGGTAAGAGCATCACCGATGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAAGGTTTAATTGTCGGATGCGCCGTCAGAGTGGCGTATCCGATGAATCACCACAGGCCTGATAAGTCGCGCAGCGTCGCATCAGGCAATGTGCTCCATTGTTAGCAACAAAAAAGCCGACTCACTTGCAGTCGGCTTTCTCATTTTAAACGAATGACGTTTACTTCG > NC_000913/786591‑786850 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |