| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,275,075 | (T)6→5 | coding (897/1095 nt) | yejB → | putative oligopeptide ABC transporter membrane subunit YejB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,275,070 | 0 | T | . | 96.5% | 335.6 / 6.5 | 86 | coding (892/1095 nt) | yejB | putative oligopeptide ABC transporter membrane subunit YejB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base . (42/41); total (44/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
ATGAAGTGCGCAAGCAATACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTG > NC_000913/2274936‑2275204 | atgaAGTGCGCAAGCAATACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGACTGCCGGTTTTCAGGGGACGTTGATCAGCATGttttta > 1:463149/1‑139 (MQ=255) gTGCGCAAGCAATACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGGCGGTTATCATCATG‑TTTTTACCGGc > 1:576414/1‑140 (MQ=255) tGCGCAAGCAATACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCt > 2:215566/1‑140 (MQ=255) cgcAAGCAATACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCg > 1:172598/1‑140 (MQ=255) cgcAAGCAATACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCg > 1:78862/1‑140 (MQ=255) caagcaaTACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCgct > 1:972860/1‑140 (MQ=255) caagcaaTACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCgct > 2:336885/1‑140 (MQ=255) aagcaaTACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCgctg < 1:215566/140‑1 (MQ=255) aCGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCCGCAAG‑TGTTTACCGGCTCGCTGCTGATTg > 1:544880/1‑140 (MQ=255) aCGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTg < 2:82551/140‑1 (MQ=255) gtggtgACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAg < 2:1009858/140‑1 (MQ=255) gtgACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTCTCAGCAT‑TTTTTTAGCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTg > 1:527099/1‑140 (MQ=255) gtgACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTg > 1:160361/1‑140 (MQ=255) gtgACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTg > 1:1154948/1‑140 (MQ=255) gtgACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTg > 1:176755/1‑140 (MQ=255) tgACCGCGCGTGCGACAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGa < 1:520360/140‑1 (MQ=255) gACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGAt > 1:796050/1‑140 (MQ=255) ccGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGa < 1:1176233/128‑1 (MQ=255) ccGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGa > 2:1176233/1‑128 (MQ=255) ccGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTGTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGt > 1:629433/1‑140 (MQ=255) gcgcgTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCTTG‑TTTTTCCCGGCTGGCTGCTCATTGAGGTGATGttt > 1:507863/1‑140 (MQ=255) gcgcgTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCGTGTTTTTT‑CCGACTGGCTGCTGATTGAGGTGATGttt > 1:450850/1‑140 (MQ=255) gcgcgTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATAATCTCTGGCAACATGTGATCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGttt < 2:512190/140‑1 (MQ=255) cgcgTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGtttt > 2:327452/1‑140 (MQ=255) cgcgTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGGGATGtttt > 2:61337/1‑140 (MQ=255) cgcgTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGAATG‑CTTTGACCGGCTCGCTGCGGATTGAGGTGATGtttt > 2:472700/1‑140 (MQ=255) gcgTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTc > 2:209790/1‑140 (MQ=255) cgTGCGAAAGGGGTAAGGGAAACAAATATTCCCTGGAAATATGTGTTCGGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCa < 2:629433/140‑1 (MQ=255) tGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACt > 1:227727/1‑140 (MQ=255) cGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCa < 2:861887/140‑1 (MQ=255) cGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCa > 1:1154391/1‑140 (MQ=255) gggTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTc < 1:923474/140‑1 (MQ=255) aGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGc > 2:827849/1‑140 (MQ=255) gAAAAAAATATTCTCTGGAAACCTGTGTTCCACAACGCCTTGCTGCTGCTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTa < 2:576414/140‑1 (MQ=255) gAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTa < 1:111192/140‑1 (MQ=255) gAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTa < 1:827849/140‑1 (MQ=255) aaaaaTATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTg > 1:1181797/1‑140 (MQ=255) aaaaaTATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTg > 1:1175149/1‑140 (MQ=255) atTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTCCTGATTGAGGTGCTGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTAc > 2:678745/1‑140 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1:1371348/1‑140 (MQ=255) gtTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTcgcg < 1:336885/140‑1 (MQ=255) ttCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTcgcgc > 1:926145/1‑140 (MQ=255) ttCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGATCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTcgcgc > 1:800808/1‑140 (MQ=255) ccGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGa > 2:862283/1‑140 (MQ=255) ccGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGa < 2:78862/140‑1 (MQ=255) ccGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTCTTCCGGCTACGTTTATAAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGa < 2:527099/140‑1 (MQ=255) ccGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTCCCGTTTTTCCGTCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGa < 1:502027/140‑1 (MQ=255) cGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGa > 1:1277851/1‑139 (MQ=255) cGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGa < 2:1277851/139‑1 (MQ=255) gCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGAtt < 2:176755/140‑1 (MQ=255) gCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGAtt < 2:1175149/140‑1 (MQ=255) cAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTa < 2:796050/140‑1 (MQ=255) cAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCCACCAAGCGACCGTCTCGCGCGATTa > 1:673414/1‑140 (MQ=255) aCGCCATGCTGCTGGTGTTTGCTGGTTTTCCGGCGTCGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATc < 2:463149/140‑1 (MQ=255) aCGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATc < 2:865506/140‑1 (MQ=255) ccATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGa < 2:799069/132‑1 (MQ=255) ccATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGa > 1:799069/1‑132 (MQ=255) aTGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGATGTTCATCGGCATG‑TTTGTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTa < 2:507863/140‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTa < 1:209790/140‑1 (MQ=255) tgctgcTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGGAGCAACGGTCTCGTGCGATTATCCTGTaa > 1:413471/1‑140 (MQ=255) tgctgcTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGa < 1:1158875/129‑1 (MQ=255) tgctgcTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGa > 2:1158875/1‑129 (MQ=255) tgctgcTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTaa > 2:344077/1‑140 (MQ=255) gctgctGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAAt < 2:160361/140‑1 (MQ=255) ctgGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGttt > 2:335292/1‑140 (MQ=255) ctgGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGttt > 1:1081039/1‑140 (MQ=255) ctgGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGttt < 1:983895/140‑1 (MQ=255) ggTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTgg > 2:1056024/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGATCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTgg < 2:800808/140‑1 (MQ=255) gTGATTGCCGGTTTTGCGGCGATGTTTATGAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGt < 1:599658/140‑1 (MQ=255) gTGATTGCCGGTTTTCCTGCGAGGTTTATCACCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGt < 2:673414/140‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTAcc < 1:335292/140‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTAcc < 2:1181797/140‑1 (MQ=255) ttGCCGGTTTTCCGGCGGCGTTCATCAGCAT‑TTTTGTACTGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCt < 2:433190/140‑1 (MQ=255) ttGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCt < 2:1154948/140‑1 (MQ=255) tGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGACTACGAAGCGACTGTCCCGCGCGATTATCCAGTAATGTTTGGTACCtt > 2:599658/1‑140 (MQ=255) ccGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGt < 2:227727/140‑1 (MQ=255) ccGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACAGTCTCGCGCGAGTATCCTGTAGTGTTTGGTACCTTGt > 1:410761/1‑140 (MQ=255) cGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGta < 2:1081039/140‑1 (MQ=255) gTTTATCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCCGATTGAGTTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGAt < 2:544880/140‑1 (MQ=255) tCAGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGcc < 1:1056024/140‑1 (MQ=255) aGCATG‑TTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCctg < 1:862283/140‑1 (MQ=255) | ATGAAGTGCGCAAGCAATACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTG > NC_000913/2274936‑2275204 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |