| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,742,580 | (C)5→6 | intergenic (+19/+21) | cfa → / ← ribC | cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase/riboflavin synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,742,575 | 1 | . | C | 91.7% | 270.6 / 15.5 | 84 | intergenic (+14/+26) | cfa/ribC | cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase/riboflavin synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/3); new base C (39/38); total (43/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGCTTTAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CG‑C‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGTTGACGCGT > NC_000913/1742436‑1742709 | cGCTTTAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑Cg > 2:836334/1‑140 (MQ=255)cGCTTTAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑Cg > 1:1107074/1‑140 (MQ=255)cGCTTTAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑Cg > 2:27842/1‑140 (MQ=255) gCTTTAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CG‑c > 1:1046878/1‑140 (MQ=255) tttAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CG‑c‑cc > 2:1325928/1‑140 (MQ=255) tAAACGAATGTTTACGTATTATCTGCATGCCTGTGCACGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CG‑c‑cc‑c‑c < 1:649523/140‑1 (MQ=255) tGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCgg > 2:1055042/1‑140 (MQ=255) tGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCgg > 1:151701/1‑140 (MQ=255) ttACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCggggg < 2:1198638/140‑1 (MQ=255) tACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCCCTAAAGGCTATTGTATCCC‑C‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGc > 2:669629/1‑140 (MQ=255) attatCTGAATGCCTTTGCAGGTGCGTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGAttt < 1:669629/140‑1 (MQ=255) attatCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGAttt < 1:388251/140‑1 (MQ=255) attatCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGAttt < 2:1046878/140‑1 (MQ=255) tatCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCa > 1:1093954/1‑140 (MQ=255) tatCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCa > 2:886118/1‑140 (MQ=255) atCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTTTAT‑CG‑CTCC‑C‑C‑TCGCCGGGGGCGATTTTAg > 2:1100598/1‑140 (MQ=255) atCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGCGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCCCCGGGGGCGATTTCAg > 2:197635/1‑140 (MQ=255) aaTGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAg < 1:1247188/140‑1 (MQ=255) aaTGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAg > 1:333210/1‑140 (MQ=255) aaTGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCCATTATGT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TTTCCGTGGGCGATTTCAGATCAg > 2:726565/1‑140 (MQ=255) aaTGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCACTAAAGGCGATTTTAT‑TGCC‑CC‑C‑C‑TTTCCGAGGGCGATTTCAGATCAg > 2:478065/1‑140 (MQ=255) aTGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAgg < 1:1275280/140‑1 (MQ=255) aTGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAgg > 2:1275280/1‑140 (MQ=255) gCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑CCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCt > 2:132869/1‑140 (MQ=255) ccTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCtt < 1:1015507/140‑1 (MQ=255) ccTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCtt > 2:1221771/1‑140 (MQ=255) ccTGTGCAGGTGCTTGCCGCGCTCGTGATCTTCAGCTATGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCtt < 1:466307/140‑1 (MQ=255) tgtgCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCt < 2:378663/140‑1 (MQ=255) tgtgCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCt > 2:48363/1‑140 (MQ=255) gtgCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCtg > 1:962575/1‑140 (MQ=255) gtgCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCtg > 1:1469900/1‑140 (MQ=255) gCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCtgtg < 1:1055042/140‑1 (MQ=255) cAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGa > 2:905085/1‑126 (MQ=255) cAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGa < 1:905085/126‑1 (MQ=255) cAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGc < 2:1310208/140‑1 (MQ=255) cAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGc < 1:886118/140‑1 (MQ=255) gTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCTGGGGCGATTTCAGATCAGGGTTCTGTGCCtt > 2:811429/1‑139 (MQ=255) gTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTg > 1:872882/1‑140 (MQ=255) gTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CG‑C‑CCAC‑C‑TATCCAGGGGCGATCTCAGTTCAGGCTTCTGTGCCTg > 2:466307/1‑140 (MQ=255) tGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTgg > 2:1505701/1‑140 (MQ=255) 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aGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGca < 1:1221771/140‑1 (MQ=255) tCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca < 2:213781/139‑1 (MQ=255) tCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcaca > 1:213781/1‑139 (MQ=255) tgtTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGtt < 1:1527313/140‑1 (MQ=255) tgtTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGtt > 2:1527313/1‑140 (MQ=255) tgtTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGACTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CG‑C‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTTTGTGCCTGGTTGATTCGTGGCATTTTCTCGCGCCGCCAGCACACGTTc > 2:614396/1‑140 (MQ=255) ttCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcac < 2:340588/133‑1 (MQ=255) ttCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGcac > 1:340588/1‑133 (MQ=255) tctcACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTa < 1:27842/140‑1 (MQ=255) tctcACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTa < 1:1008098/140‑1 (MQ=255) tctcACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTa < 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ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGa > 2:75153/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGa > 2:1449152/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGa > 1:841496/1‑140 (MQ=255) ggCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGa > 2:1526417/1‑140 (MQ=255) gCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAg > 1:865450/1‑140 (MQ=255) ccTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGt < 1:841972/140‑1 (MQ=255) ccTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGt > 1:799028/1‑140 (MQ=255) ccTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGt > 1:1109110/1‑140 (MQ=255) ccTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGt > 1:122065/1‑140 (MQ=255) gTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGa < 1:75153/140‑1 (MQ=255) tGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGAt < 1:1526417/140‑1 (MQ=255) tGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAA‑CG‑C‑CC‑CTC‑TCTCCGCGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGAt < 1:478065/140‑1 (MQ=255) tGGCTCGCCAAAGGCTTATCTAG‑CG‑C‑CC‑C‑CATCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGAt < 2:708979/140‑1 (MQ=255) gCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCg > 1:382333/1‑140 (MQ=255) gCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGAttt < 2:1093954/140‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGAttt < 2:1500285/140‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGAttt < 2:865450/140‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCTATTCTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGACTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGAttt < 2:122065/140‑1 (MQ=255) tAAAGGCTATTCTAT‑TG‑C‑CC‑C‑CTTCACCGTGGGCGATGTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCa < 1:489832/140‑1 (MQ=255) ggCTATTCTAT‑CG‑C‑CC‑C‑C‑TCTCCGGTGGCTATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGtt < 1:614396/140‑1 (MQ=255) cTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGTTGAcgcg > 1:148818/1‑140 (MQ=255) cTAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGTTGAcgcg < 2:872882/140‑1 (MQ=255) tAT‑CGCC‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCAATGCCTGAATTTCTGCATCGATCTCAATGTTGAcgcgg > 1:549941/1‑139 (MQ=255) | CGCTTTAAACGAATGTTTACCTATTATCTGAATGCCTGTGCAGGTGCTTTCCGCGCCCGTGATATTCAGCTCTGGCAGGTCGTGTTCTCACGCGGTGTTGAAAACGGCCTTCGAGTGGCTCGCTAAAGGCTATTCTAT‑CG‑C‑CC‑C‑C‑TCTCCGGGGGCGATTTCAGATCAGGCTTCTGTGCCTGGTTGATTCATGGCATTTTCTCGTGCCGCCAGCACACGTTCTACCGTATCTACCACTGCCTGAGTTTGTGGATCGATTTCAATGTTGACGCGT > NC_000913/1742436‑1742709 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |