Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 2,857,096 | Δ2,538 bp | coding (4‑2541/2562 nt) | mutS → | DNA mismatch repair protein MutS |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
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ggAACCGGACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacaggg > 1:1339951‑M1/1‑21 (MQ=255) aCCGGACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaa < 1:813686‑M1/140‑123 (MQ=255) ccGGACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaa > 2:1463352‑M1/1‑17 (MQ=255) gACATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaacc > 1:998128‑M1/1‑14 (MQ=255) cATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccat < 2:794004‑M1/140‑129 (MQ=255) cATAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccat < 1:78252‑M1/140‑129 (MQ=255) tAACCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatgc < 2:623549‑M1/140‑131 (MQ=255) aaCCCCATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatgcc > 2:1276691‑M1/1‑9 (MQ=255) ccccATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatgccat > 2:1227325‑M1/1‑7 (MQ=255) cATGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatgccatcta > 2:1318848‑M1/1‑4 (MQ=255) aTGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatgccatctac > 2:880518‑M1/1‑3 (MQ=255) tGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccctgtataataggaaagcttattttacagggtaaaaccatgccatctaca > 2:20535‑M1/1‑2 (MQ=255) tGcgcttgaagagcctggtgtaataacaattcccgatagtcttttgctatcgggaatattaacgacaactgacgaataaaataaaaacaccatgtataataggacagcatattttacggggtaaaaccatgccatctaca > 2:580009‑M1/1‑2 (MQ=255) | GGAACCAGCATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGAGTGCAATAGAAAATTTCGACGCCCATACGCCCATGATGCAGCAGTATCTCAGGCTGAAAGCCCAGCATCCCGAGATCCTGCTGTTTTACCGGATGGGTGATTTTTATGAACTGTTTTATGACGACGCAAAACGCGCG > NC_000913/2856956‑2857233 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |