| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,646,935 | 0 | A | G | 98.2% | 391.2 / ‑2.8 | 112 | intergenic (+198/+239) | flxA/ydfW | Qin prophage; protein FlxA/Qin prophage; uncharacterized protein YdfW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (58/52); total (59/53) | |||||||||||
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Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
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> 2:433349/1‑140 (MQ=255) cccATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGcc < 1:1256188/140‑1 (MQ=255) cccATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGcc < 2:874171/140‑1 (MQ=255) aTTATGAATTGCAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAgactgact < 2:1124525/140‑1 (MQ=255) ttATGAATTGCAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCg > 1:864763/1‑127 (MQ=255) ttATGAATTGCAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTc > 1:1173830/1‑140 (MQ=255) ttATGAATTGCAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCGCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCg < 2:864763/127‑1 (MQ=255) gAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAgcg < 1:238138/140‑1 (MQ=255) aaTTGCAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAgcgc > 2:1075959/1‑140 (MQ=255) tGCAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAGCGCGtt > 2:160881/1‑140 (MQ=255) gCAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAGCGCGttt < 2:1215392/140‑1 (MQ=255) cAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAGCGCGTTTc > 1:1369667/1‑140 (MQ=255) cAACTATTTCTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAGCGCGTTTc > 1:1075280/1‑140 (MQ=255) cTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAGCGCGTTTCTGGCATATc < 1:324525/140‑1 (MQ=255) cTGTGGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAGCGCGTTTCTGGCATATc < 1:1075959/140‑1 (MQ=255) | ATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAGCGCGTTTCTGGCATATC > NC_000913/1646802‑1647070 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |