| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,947,931 | A→G | V74A (GTG→GCG) | yebC ← | putative transcriptional regulator YebC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,947,931 | 0 | A | G | 98.8% | 282.3 / NA | 82 | V74A (GTG→GCG) | yebC | putative transcriptional regulator YebC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (40/41); minor base T (0/1); total (40/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACG > NC_000913/1947794‑1948064 | aTTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCcgca > 1:1430224/1‑140 (MQ=255) tttGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCgcac < 1:849674/140‑1 (MQ=255) aCTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGtt < 2:1405358/140‑1 (MQ=255) aCTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGtt > 1:1405358/1‑140 (MQ=255) cAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAgt < 2:1409919/140‑1 (MQ=255) aGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAgtg > 2:806548/1‑140 (MQ=255) cAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAgtgtg > 2:1447117/1‑140 (MQ=255) cAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAgtgtg > 2:1478547/1‑140 (MQ=255) acggtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTc < 2:1074662/140‑1 (MQ=255) cggtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCTTCATCATCACCGCCGGTTCCACGTGCAATTGTGCGGTTCAGTGTGTCa > 2:756669/1‑140 (MQ=255) cggtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCa > 2:1386648/1‑140 (MQ=255) cggtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCa > 2:307510/1‑140 (MQ=255) ggtacggtTGCGGTTTGCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCAc < 1:1483398/140‑1 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACg > 2:300533/1‑140 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACg > 2:160628/1‑140 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACg > 2:359562/1‑140 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACg > 2:95342/1‑140 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACg > 1:1494749/1‑140 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACg > 1:1103343/1‑140 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACg > 1:1193638/1‑140 (MQ=255) gtacggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACg > 2:840864/1‑140 (MQ=255) gttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:51958/140‑1 (MQ=255) gttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:1368466/140‑1 (MQ=255) gttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 1:1117792/140‑1 (MQ=255) gttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:1145889/140‑1 (MQ=255) gttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 1:756669/140‑1 (MQ=255) gttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:210906/140‑1 (MQ=255) gttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 1:300533/140‑1 (MQ=255) gttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:336478/140‑1 (MQ=255) gttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 1:1478547/140‑1 (MQ=255) gttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTCCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 2:1506536/140‑1 (MQ=255) gttgcggctgTCGGACAGACATTCAATCATTATTGCCGTGCCCGCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCa < 1:949370/140‑1 (MQ=255) ttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCAt < 2:146012/140‑1 (MQ=255) gcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCAtgt > 1:1474921/1‑140 (MQ=255) cggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCAtgtt > 1:1203750/1‑140 (MQ=255) gttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCAtgttgt > 1:316364/1‑140 (MQ=255) ttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATgttgtt < 1:1386648/140‑1 (MQ=255) agTCAGACAGACATTCACTCATCATTGCCGTCCCGTCAGCACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTa < 2:426036/139‑1 (MQ=255) gTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAg > 2:206415/1‑140 (MQ=255) gTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAg > 1:1183169/1‑140 (MQ=255) tCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCTTCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGa < 2:879486/140‑1 (MQ=255) tCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGa < 2:1474921/140‑1 (MQ=255) tCAGACAGACATTCAATCATGAGTGCCGTGCAGCCTGGAACGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGa < 2:468880/140‑1 (MQ=255) cagacagaCATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGAc < 2:314643/140‑1 (MQ=255) cagacagaCATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGAc < 1:206415/140‑1 (MQ=255) agacagacATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACa < 2:1203750/140‑1 (MQ=255) gacaTTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCt < 1:212227/140‑1 (MQ=255) ttCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTGAGTGTGTGACGGGTAATGTTGTTAGACAGTGCtttct > 1:426036/1‑138 (MQ=255) gATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCAccgccg > 2:1102881/1‑140 (MQ=255) gATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCAccgccg < 1:307510/140‑1 (MQ=255) aTTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACcgccgc > 1:1064306/1‑140 (MQ=255) aTTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACcgccgc > 2:811738/1‑140 (MQ=255) gccgtgccgCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCcgcacg < 1:1510661/140‑1 (MQ=255) gccgtgccgCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCcgcacg < 2:1494749/140‑1 (MQ=255) ccgccAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGAcg < 2:1425234/140‑1 (MQ=255) ccgccAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGAcg > 1:276047/1‑140 (MQ=255) aGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGt > 1:1386180/1‑140 (MQ=255) cGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGATAGTTCTTGATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCg > 2:635091/1‑140 (MQ=255) tAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTc < 1:95342/140‑1 (MQ=255) cGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCGCGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCg > 2:1503025/1‑140 (MQ=255) cGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCg > 1:387515/1‑140 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2:639359/1‑140 (MQ=255) tttCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCTACCGCCGCACGCAGACTCGGGTTAGAGTCCGGATCGCCACCGCCCAGc > 2:594107/1‑140 (MQ=255) cATGTTTGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAg < 1:806548/140‑1 (MQ=255) ttGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCcgcg < 1:1234795/140‑1 (MQ=255) ttGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCcgcg > 2:796593/1‑140 (MQ=255) ttGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCcgcg > 2:177085/1‑140 (MQ=255) ttGCATCATCATCACCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCcgcg < 2:1193638/140‑1 (MQ=255) tcatcatcaCCGCCCTCACCACTTGCAATTGCGCGGTCCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTAc < 1:423479/140‑1 (MQ=255) tcatcatcaCCGCCCGCGCCACCTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTAc < 2:641187/140‑1 (MQ=255) tcatcatcaCCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCCCCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTAc < 2:378748/140‑1 (MQ=255) tcatcatcaCCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTAc < 2:387515/140‑1 (MQ=255) tcatcatcaCCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTAc > 1:1210628/1‑140 (MQ=255) tcatcaCCGCCCGCAGCACGTGTAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAg < 1:635091/140‑1 (MQ=255) tcatcaCCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAg > 1:1514145/1‑140 (MQ=255) catcaCCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTGCGGATCGGCACTGCGCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGc > 1:402266/1‑140 (MQ=255) catcaCCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGc > 2:788215/1‑140 (MQ=255) caCCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCa < 1:993721/140‑1 (MQ=255) aCCGCCCGCACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGCTCGCCACCGCCTAGCTTAGCCACGGTTACCAGCTCAc > 1:718751/1‑140 (MQ=255) ccgcccgcACCACGTGCAATTGGGCTGTTAAGTGTGTTACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACg < 1:639359/140‑1 (MQ=255) | ATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGGTTAGCGTCCGGATCGCCACCGCCCAGCTTAGCCGCGGTTACCAGCTCACG > NC_000913/1947794‑1948064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |