Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,465,960 | T→C | C140R (TGT→CGT) | gspO → | Type II secretion system prepilin peptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,465,960 | 0 | T | C | 98.7% | 253.0 / NA | 74 | C140R (TGT→CGT) | gspO | Type II secretion system prepilin peptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (36/37); total (36/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATTTTCGCACTCAGCTCCTGCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTG > NC_000913/3465823‑3466095 | aTTTTCGCACTCAGCTCCTGCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGgcgt > 1:778274/1‑140 (MQ=255) tttCGCACTCAGCTCCTGCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATTCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTCACGGCGCGGTAACGGGCTATGGGGTGCTGTGgcgtgt > 1:547456/1‑140 (MQ=255) tttCGCACTCAGCTCCTGCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTATTTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGgcgtgt > 1:938578/1‑140 (MQ=255) tttCGCACTCAGCTCCTGCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGgcgtgt > 2:1115435/1‑140 (MQ=255) tCGCACTCAGCTCCTGCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGttt > 1:1434660/1‑140 (MQ=255) cTCAGCTCCTGCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTgg < 2:1230268/140‑1 (MQ=255) tCAGCTCCTGCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTggg > 2:955072/1‑140 (MQ=255) aGCTCCTGCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGc < 2:1429563/140‑1 (MQ=255) cTCCTGCCCGACAAAGTCACCTTACCGCTACTCTGGCGTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGt < 1:544598/140‑1 (MQ=255) gCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGATCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGt < 1:647461/140‑1 (MQ=255) cGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAg > 2:325228/1‑140 (MQ=255) cGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACCGGGGCGTCTGGGTAg > 1:607681/1‑140 (MQ=255) aCAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGtt > 2:1088591/1‑140 (MQ=255) aCAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGGTAGtt > 1:1464177/1‑140 (MQ=255) aaCTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGt < 2:1434660/140‑1 (MQ=255) aaCTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGGGCTGTGGCGTGATTCCTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGt > 1:568040/1‑140 (MQ=255) cTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTca < 1:325228/140‑1 (MQ=255) cTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAag < 2:72030/140‑1 (MQ=255) cGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTTTTTAATTCTCAGTATGGATTAATTGTTTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGa < 2:547456/140‑1 (MQ=255) tgctCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTg > 1:65134/1‑140 (MQ=255) ctctGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAag < 2:167932/130‑1 (MQ=255) ctctGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAag > 1:167932/1‑130 (MQ=255) ctGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCt < 1:140921/140‑1 (MQ=255) gcttggcttgGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACg < 1:955072/140‑1 (MQ=255) gcttggTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTGTGGTTGGGTTGTCACACAGAGGGATTGGGCAACGGTGAt > 2:687163/1‑140 (MQ=255) ggTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCa < 2:962804/140‑1 (MQ=255) gTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACgg > 1:48403/1‑131 (MQ=255) gTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACgg < 2:48403/131‑1 (MQ=255) tAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCGGGTTAGTTTGTCACAAGGAGGGATTGGGCTAAGGTGATTTCAAGCTAc > 2:670479/1‑140 (MQ=255) cgcAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGcc > 2:1327661/1‑140 (MQ=255) gcAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCg > 1:764412/1‑140 (MQ=255) aGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCt > 1:1404749/1‑140 (MQ=255) tATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGc < 1:1421111/140‑1 (MQ=255) aTGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCa < 1:329962/140‑1 (MQ=255) aTGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCa < 1:1088591/140‑1 (MQ=255) aTTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGgcg < 2:51393/140‑1 (MQ=255) ttAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGgcgc < 2:346710/140‑1 (MQ=255) ttGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGATGGATTGGGGTACGGTGATTTCAAGCAACTGGCCGCTGCAGGCGCATgg > 2:513884/1‑140 (MQ=255) ttGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTCCGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATgg > 1:577254/1‑140 (MQ=255) ttGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATgg > 2:1510726/1‑140 (MQ=255) ttGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATgg > 2:157547/1‑140 (MQ=255) ttGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATgg > 2:1086486/1‑140 (MQ=255) ttGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATgg > 2:108355/1‑140 (MQ=255) ttGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCAACTGGCCGCTGCAGGCGCATgg > 2:672955/1‑140 (MQ=255) ttGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGGCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTGCGGGGATGTCATGCGACTGGCTGCTGCAGGCGCATgg > 1:501313/1‑140 (MQ=255) ttGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCCGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGgcgc > 2:265717/1‑136 (MQ=255) ttGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCCGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGgcgc < 1:265717/136‑1 (MQ=255) gATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGgtg > 1:1330409/1‑140 (MQ=255) tttACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGtgtg > 1:96171/1‑140 (MQ=255) tttACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGtgtg > 2:866185/1‑140 (MQ=255) tttACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGtgtg > 2:1156195/1‑140 (MQ=255) tttACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGCGATTTCAGGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGtgtg > 1:585790/1‑140 (MQ=255) ttACATGATGCGGTTTAGGGCAAGGTAGCGGTCTATGGGTTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGtgg < 2:536404/140‑1 (MQ=255) ttACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGtgg > 1:1218192/1‑140 (MQ=255) gatgCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCa > 1:155281/1‑140 (MQ=255) tgCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGgcg > 2:1462344/1‑122 (MQ=255) tgCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGgcg < 1:1462344/122‑1 (MQ=255) tgCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCaaa > 2:1474058/1‑140 (MQ=255) tgCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCaaa > 1:1449517/1‑140 (MQ=255) tgCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCaaa > 1:785824/1‑140 (MQ=255) cGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGAGGCGTGTTTACTAGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACg < 2:620008/140‑1 (MQ=255) gTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGtt < 1:1086486/140‑1 (MQ=255) gTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGtt < 1:866185/140‑1 (MQ=255) tACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGcc < 1:670479/140‑1 (MQ=255) tACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGcc < 1:672955/140‑1 (MQ=255) tACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGcc < 1:1115435/140‑1 (MQ=255) cGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCaa < 1:1510726/140‑1 (MQ=255) cgcgGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTGCTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGa < 2:577254/140‑1 (MQ=255) gTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAct < 2:764412/140‑1 (MQ=255) gCGGGCTATGGGGTGCTCTGGCCTGTTTACTTGGGCGTCTGGTTAGTTGGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATActgct < 2:585790/140‑1 (MQ=255) gggCTATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGa < 2:1404749/140‑1 (MQ=255) tATGGGGTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGc < 2:938578/140‑1 (MQ=255) gggTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCg < 2:155281/140‑1 (MQ=255) gTGCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCt < 1:1420679/140‑1 (MQ=255) gCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTgg > 2:1107571/1‑140 (MQ=255) gCTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTgg < 1:1107571/140‑1 (MQ=255) cTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTggg < 1:1474058/140‑1 (MQ=255) cTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTggg < 1:108355/140‑1 (MQ=255) cTGTGGCGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATAGGGTGGCTAGCAAACGCTGCCAATGCTACTGCTGATTGCCTCGCTggg > 2:534297/1‑140 (MQ=255) gtggcgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTg < 1:1327661/140‑1 (MQ=255) | ATTTTCGCACTCAGCTCCTGCCCGACAAACTCACCTTACCGCTGCTCTGGCTTGGCTTGGTATTTAATGCGCAGTATGGATTAATTGATTTACATGATGCGGTTTACGGCGCGGTAGCGGGCTATGGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTG > NC_000913/3465823‑3466095 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |