Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,744,442 | G→A | E39K (GAA→AAA) | yiaM → | 2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,744,442 | 0 | G | A | 99.1% | 395.5 / NA | 113 | E39K (GAA→AAA) | yiaM | 2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (61/51); minor base T (0/1); total (61/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTT > NC_000913/3744306‑3744576 | gacaTAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAAt > 2:1162109/1‑140 (MQ=255) acaTAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAAtt > 1:1110912/1‑140 (MQ=255) aTAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCAAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGt < 2:1251110/140‑1 (MQ=255) tAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTc < 2:356557/140‑1 (MQ=255) aGCCTCAAGGAATAGCTTTGAAAAAAATACTGGAATCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCa < 2:681582/140‑1 (MQ=255) aGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCa < 2:1486837/140‑1 (MQ=255) aGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCa < 2:813756/140‑1 (MQ=255) aGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCa < 1:967049/140‑1 (MQ=255) aGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCa < 1:929123/140‑1 (MQ=255) aGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCa < 2:199459/140‑1 (MQ=255) ccTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGGAGCGATAATGGCGATTCATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACg < 2:678080/140‑1 (MQ=255) ccTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACg < 1:1239308/140‑1 (MQ=255) ccTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAACACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACg < 1:651824/140‑1 (MQ=255) aaGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGttat > 1:1537369/1‑140 (MQ=255) aaGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGttat > 1:1210055/1‑140 (MQ=255) aGGAATAGCTTTGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGttatt > 2:1065146/1‑140 (MQ=255) aaTAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGttatttat < 2:1172469/140‑1 (MQ=255) aTAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTtatttatt < 2:1152774/140‑1 (MQ=255) tAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACTAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTtatttatt < 2:785638/139‑1 (MQ=255) tAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTtatttatt > 1:785638/1‑139 (MQ=255) tAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTatttattt > 1:1051330/1‑140 (MQ=255) aGCTATGAAAAAAATACTCGAACCAATACTGTCGATTAAGCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTg < 2:645386/140‑1 (MQ=255) gAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGt < 2:178399/140‑1 (MQ=255) aaaaaaaTACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGtt > 1:1078967/1‑140 (MQ=255) aaaaaaTACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTa < 2:1078967/140‑1 (MQ=255) aaaaaTACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTaa > 1:1023335/1‑140 (MQ=255) aaTACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTCGATAAATGGTCACGGTATTTAATTGTCTGGTTAACGt > 1:421894/1‑140 (MQ=255) aGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGgcg < 1:1162109/140‑1 (MQ=255) aGCAATACTGGCAATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGgcg < 2:1434776/140‑1 (MQ=255) gCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGgcgc > 2:765007/1‑140 (MQ=255) tACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTATCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGAtt > 2:1053431/1‑140 (MQ=255) aTTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTATCGTTTATTGCCGCGATTGTAGCttt > 1:700798/1‑140 (MQ=255) aTTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCttt < 2:144820/140‑1 (MQ=255) tAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTg < 1:1522857/131‑1 (MQ=255) tAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTa < 2:1051330/140‑1 (MQ=255) tAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTa > 1:1275208/1‑140 (MQ=255) tAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTa < 1:765007/140‑1 (MQ=255) tAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACATTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTa > 1:623727/1‑140 (MQ=255) aTCTCGCCGTACTTTCCTGTATAGTATTTATAAACTTTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATg < 2:528824/140‑1 (MQ=255) ctcGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATTAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGa < 1:525857/140‑1 (MQ=255) tcGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGAt > 1:942630/1‑140 (MQ=255) ttCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGcc > 1:1532712/1‑136 (MQ=255) ttCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGcc < 2:1532712/136‑1 (MQ=255) cTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATaa < 2:243323/129‑1 (MQ=255) cTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATaa > 1:243323/1‑129 (MQ=255) tattgtattTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTACGGTTTATTCGCGAGATCGTAGCTTTAATGGCTAACGCCCACGTTCAgg > 2:560900/1‑140 (MQ=255) attgtattTATAAACGTTATTTCAACATAGGGTTTTCGGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGt < 1:716586/140‑1 (MQ=255) attgtattTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGt > 2:135254/1‑140 (MQ=255) attgtattTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGt < 2:1509205/140‑1 (MQ=255) attgtattTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGt < 2:790/140‑1 (MQ=255) attgtattTATAAACAATATTTGAAGATATGGTGTACAGGCAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGt < 2:700798/140‑1 (MQ=255) ttgtattTATAAACATTCTTTTCAGATATGGCTTTAAGATAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTc < 2:421894/140‑1 (MQ=255) tgtattTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCa > 1:1329168/1‑140 (MQ=255) tattTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACg > 1:1029844/1‑129 (MQ=255) tattTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACg < 2:1029844/129‑1 (MQ=255) tattTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGAATGTAGCTGTTAGGGGTAACGCGCACGTTCAGGTCAcc > 1:492157/1‑140 (MQ=255) tattTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTCATTGGCGCTATTGTAGATTTTATGGATAACTGCCACGTTCAGGTCAcc > 2:661205/1‑140 (MQ=255) tattTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTCATTGGCGCGATTGTGGCTTTTATGGTTAACGACCACGTTCAGGTCAcc > 2:715037/1‑140 (MQ=255) attTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCt < 1:1065146/140‑1 (MQ=255) ataAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTATCTTTTATGGATCACGCCCACGATCAGGTCACCTTTCt > 1:399508/1‑140 (MQ=255) ataAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATGACGCCCACGGTCAGGTCACCTTTCt > 1:460882/1‑140 (MQ=255) ataAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCt > 1:1469526/1‑140 (MQ=255) ataAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCt > 2:137570/1‑140 (MQ=255) aaaCATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCtgg < 2:1329168/140‑1 (MQ=255) aaaCATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCtgg < 1:137519/140‑1 (MQ=255) aaaCATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCtgg > 1:203852/1‑140 (MQ=255) cATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTTGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCtggtgg > 1:1199327/1‑140 (MQ=255) cATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCtggtgg > 1:254498/1‑140 (MQ=255) cATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCtggtgg > 1:107473/1‑140 (MQ=255) cATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTCATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCtggtgg > 2:340963/1‑140 (MQ=255) ttattTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGgag < 2:1297859/140‑1 (MQ=255) ttattTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGgag < 2:1008697/140‑1 (MQ=255) ttttAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTCGCTTTTATTGATAACGCCCACGTTCTGGTCACCTTTCTGGTGGAGaaa > 2:613380/1‑140 (MQ=255) aGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACtctc < 1:135254/140‑1 (MQ=255) gATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTcc > 1:1362611/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCAGGTTCAGGTCACATTGCTGGTGGAGAAACTCTccccgc > 1:744250/1‑138 (MQ=255) tGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCg > 2:846124/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCg > 2:1057356/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGGCACCTTACTGGTGAAGAAACTCTCCCCCg > 1:624080/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGACACGTTTCTGGTGCAGAAACTCTCCCCCg > 1:658596/1‑140 (MQ=255) ttCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCGGGTCACCGTTCTGGGGGAGAAGCTCTCCCCCGCATgg > 1:416563/1‑140 (MQ=255) tCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGc > 1:31973/1‑140 (MQ=255) aGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAg > 1:1227776/1‑140 (MQ=255) aGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAg > 2:1366063/1‑140 (MQ=255) aGACAAGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGACACCTTTGTGGTGGAGAAACTATCCCCCGCATGGCAg > 1:624144/1‑140 (MQ=255) gACAGGCTTTTTATCTACTGATCAATGGTCTTGTTTTTTTTTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCCCCTTTCTGGTGGAGAAACTCT‑CCCCGCATGGCAGcg < 2:744250/140‑1 (MQ=255) aGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGcgacg > 1:1104005/1‑140 (MQ=255) aGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGcgacg > 1:1368481/1‑140 (MQ=255) aGCATTTTATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGcgacg > 2:1024175/1‑140 (MQ=255) ttttATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTc < 2:1537369/140‑1 (MQ=255) ttATCTGTTGATAAATTGTCACTTTATTTATCTGTCTGGATAACGTTTCTTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGc < 2:416563/140‑1 (MQ=255) ttATCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGc < 2:1104005/140‑1 (MQ=255) tATCTGTTGATAAATCGTCACGTTAATTACTTGTCTGATTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGct < 1:397824/140‑1 (MQ=255) aTCTGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGctc < 2:203852/140‑1 (MQ=255) tGTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGAAGAAACTCTCCCCCGCTTGGCGGCGACGAGTCGCTCTgg > 2:682008/1‑140 (MQ=255) gTTGATAATTTGTCACGTTATTTATTTGTCGTGGTGACGTTTATTGGCACGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGt < 2:751606/140‑1 (MQ=255) gTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGc > 1:1456367/1‑134 (MQ=255) gTTGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGc < 2:1456367/134‑1 (MQ=255) ttGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGtt > 1:127595/1‑140 (MQ=255) ttGATAAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGACAAAGTCTGCCCCGCATGGCAGGGACGAGTCGCTCTGGtt > 2:518189/1‑140 (MQ=255) | GACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTT > NC_000913/3744306‑3744576 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |