| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,894,463 | T→C | W195R (TGG→CGG) | yieE → | putative phosphopantetheinyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,894,463 | 0 | T | C | 98.9% | 308.6 / NA | 88 | W195R (TGG→CGG) | yieE | putative phosphopantetheinyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (42/44); total (44/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAGCGTGCTAAAACTAACCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGTGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGCCGGATGATGCGTTTTGCCCAACT > NC_000913/3894327‑3894599 | aaGCGTGCTAAAACTAACCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGt < 1:1506254/140‑1 (MQ=255) aGCGTGCTAAAACTAACCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTc > 1:248165/1‑140 (MQ=255) aGCGTGCTAAAACTAACCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTc > 2:1106690/1‑140 (MQ=255) aaCTAACCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTc < 1:1106690/140‑1 (MQ=255) aCCGGTGATGTTTTGAATGACGTTCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGcc < 1:550416/140‑1 (MQ=255) aCCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGATGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACACGGAAGAAGTGTTGATGCGGTGCGTGGCGGTCACGcc > 1:572562/1‑140 (MQ=255) aCCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGcc > 2:133872/1‑140 (MQ=255) aCCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGcc < 1:138003/140‑1 (MQ=255) aCCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGcc < 2:33606/140‑1 (MQ=255) aCCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACACGGAAGAAGTGCTGGTGCGGTACGTGGCGGTCACGcc > 1:654623/1‑140 (MQ=255) aCCGGTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGAGTTATGCGGCGCGGAACACGTGCTGCTGCGGTCCGTGGCGGTCACGcc > 2:445615/1‑140 (MQ=255) gTGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACg > 2:1430144/1‑140 (MQ=255) tGATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGa < 1:1430144/140‑1 (MQ=255) gATGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTAGTGTGGGCCGTGGGGGTCACGCCCACGAt > 1:409937/1‑140 (MQ=255) aTGTTTTGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGAtt < 2:990669/140‑1 (MQ=255) ttttGAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGaa < 1:1414757/140‑1 (MQ=255) gAATGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGc > 1:1341587/1‑140 (MQ=255) aaTGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAGGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCt < 1:301571/140‑1 (MQ=255) aaTGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCt > 2:1107890/1‑140 (MQ=255) aaTGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCt < 1:1464516/140‑1 (MQ=255) aaTGACGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCt < 1:1174610/140‑1 (MQ=255) aaTGACGATCCGCGCGACCTGCTGCTGCTGCTCATTGCCTGACGCCTGTAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCt < 2:409937/140‑1 (MQ=255) aaTGACGATCCGCGCAATCTGCCGCTGCTTCCCATTGTCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCt < 1:450684/140‑1 (MQ=255) tGACGATCCGCGCGATCGGCAGATGCTGCCCATTGCCGGCCGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCa < 2:670812/140‑1 (MQ=255) aCGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAgt < 1:993161/140‑1 (MQ=255) cGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAgtg > 2:656215/1‑140 (MQ=255) cGATCCGCGCGATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACATGCTGGTGGGGTGCGTAGCGGTCACTCCCAGGATTGAAAAGCTCAgtg > 2:443442/1‑140 (MQ=255) cgcgcgATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTgg > 2:913925/1‑140 (MQ=255) cgcgcgATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGGGGCGGTCGCGCCCATGATTGAGAAGCTCAGTGTCtcg > 1:670812/1‑138 (MQ=255) cgcgATCTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGa > 2:48658/1‑140 (MQ=255) cTGCAGCTGCTGCCCCTTGCCGCACCCCTCAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGa < 1:445615/140‑1 (MQ=255) cTGCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGa < 2:118050/140‑1 (MQ=255) gCAGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATg < 2:318703/140‑1 (MQ=255) gCAGCTGCTGCCCATGGCCGGAGGCTTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATg < 1:635278/140‑1 (MQ=255) aGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCt > 2:820975/1‑126 (MQ=255) aGCTGCTGCCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCt < 1:820975/126‑1 (MQ=255) gctgcCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAac < 1:913925/140‑1 (MQ=255) ctgcCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAaca > 1:1482753/1‑140 (MQ=255) ctgcCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGAGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAaca > 2:264322/1‑140 (MQ=255) ctgcCCATTGCCGGACCTCTGACATGTGCTCGTCTGAATTATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAaca < 2:697488/140‑1 (MQ=255) gcCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACg > 2:808567/1‑140 (MQ=255) gcCCATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGCCACGCCCACGATTGAAAAGATCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACg > 2:1162958/1‑140 (MQ=255) cccATTGCCGGACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACgg < 1:1220193/140‑1 (MQ=255) gACGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGc > 2:1487435/1‑140 (MQ=255) cGCCTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCGGGAAAAGCCt > 2:1355877/1‑140 (MQ=255) ccTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGc < 1:1107890/140‑1 (MQ=255) ccTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGc > 2:959806/1‑140 (MQ=255) ccTGAAATGTGCTCATGCAAATCATGTAGAAGCGTTATGTGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGc < 2:654623/140‑1 (MQ=255) cTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCt < 2:1157494/137‑1 (MQ=255) cTGAAATGTGCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCt > 1:1157494/1‑137 (MQ=255) gAAATGTGCTCATGTCAATCATATACAAGGGTTATGCCACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCgg < 1:712858/140‑1 (MQ=255) gtgCTCATGTAAATCATGTAGACGCATTAAGCGACGCCGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATAtt < 1:443442/140‑1 (MQ=255) tgCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTc > 1:304295/1‑140 (MQ=255) tgCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTc > 2:939544/1‑140 (MQ=255) gCTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCCGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTcc > 1:1041243/1‑139 (MQ=255) cTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTGTGGGAGTTAGATGGGAAACACGGCTGGAAACACCTGCCGTATATTcac > 2:712858/1‑140 (MQ=255) cTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGc < 2:1123158/125‑1 (MQ=255) cTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGc > 1:1123158/1‑125 (MQ=255) cTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTcac > 2:1343941/1‑140 (MQ=255) cTCATGTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTcac > 2:1296722/1‑140 (MQ=255) gTAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCcg < 1:1448813/140‑1 (MQ=255) gTAAAGCATGTAGAAGCCTTATACGACGCGGTAGAAGTGCTTGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCACTGTCTGGGAGTTAGAGGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCcg < 2:572562/140‑1 (MQ=255) tAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCcgc < 1:1487435/140‑1 (MQ=255) tAAATCATGTAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCAGGATAATCCTGCCTGATATTCACAGCcgc > 1:725341/1‑140 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tAGAAGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAAt > 2:322105/1‑140 (MQ=255) aaGCGTTATGCGACGCGTAAGACGTGCTGGTTCGGTCCGTGGCGGTCAAGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCt < 2:513840/140‑1 (MQ=255) aGCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTa > 2:1304927/1‑140 (MQ=255) gCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTAc < 1:1102331/140‑1 (MQ=255) gCGTTATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTAc < 2:1482753/140‑1 (MQ=255) tATGCGACGCGGAAGACGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGc > 2:939974/1‑140 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1:1304927/140‑1 (MQ=255) cGTGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGCCGGATGATGCGTTTTg < 1:264322/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGCCGGATGATGCGTTTTGcc < 2:1341587/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGCCGGATGATGCGTTTTGcc < 2:1099759/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGCCGGATGATGCGTTTTGcc < 1:808567/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGCCGGATGATGCGTTTTGcc < 1:1433591/140‑1 (MQ=255) cTGGTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGCCGGATGATGCGTTTTGCCCa > 2:1212534/1‑140 (MQ=255) ggTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGCCGGATGATGCGTTTTGcc < 2:1413358/136‑1 (MQ=255) ggTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGCCGGATGATGCGTTTTGcc > 1:1413358/1‑136 (MQ=255) ggTGCGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGACGGATGGTGCGTTTTGCCCAAc > 1:634979/1‑140 (MQ=255) gtgcGGTCCGTGGCGGTCACGCCCACGATTGAAAAGCTCAGTGTCTGGGAGTTAGATGGCAAACACGGCTGGAAAAGCCTGCCGGATATTCACAGCCGCGCCAACAATCCTACCAGCCGGATGATGCGTTTTGCCCAAct < 2:304295/140‑1 (MQ=255) | 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |