| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,002,463 | A→G | F113L (TTC→CTC) | yigF ← | DUF2628 domain‑containing protein YigF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,002,463 | 0 | A | G | 98.9% | 321.2 / ‑5.3 | 91 | F113L (TTC→CTC) | yigF | DUF2628 domain‑containing protein YigF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (47/43); total (47/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
CTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGAC > NC_000913/4002326‑4002598 | cTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGcc > 2:36719/1‑140 (MQ=255)cTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGcc > 1:1376598/1‑140 (MQ=255) tCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGATAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCACGTATTTAACCCTCTTACATCTTTCTCATAGAGCCa > 2:696805/1‑140 (MQ=255) tCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCAAGGTATTAAACACTGTTACCTATTTCTCATAGAGCCa > 1:646961/1‑140 (MQ=255) gcgGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCAtt < 1:956255/140‑1 (MQ=255) ccGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTaa < 2:1376598/140‑1 (MQ=255) gTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACa < 1:36719/140‑1 (MQ=255) gTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACa > 2:828021/1‑140 (MQ=255) tATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAg > 2:849933/1‑140 (MQ=255) cTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCaa > 2:768147/1‑140 (MQ=255) gTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACa < 1:334312/140‑1 (MQ=255) ttAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGgc > 1:167854/1‑140 (MQ=255) tAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGgct > 1:1160016/1‑140 (MQ=255) tAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGgct > 1:914787/1‑140 (MQ=255) tAAGCGGAAGAACTAGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGgct > 2:967109/1‑140 (MQ=255) aGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAAc < 2:1185993/125‑1 (MQ=255) aGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAAc > 1:1185993/1‑125 (MQ=255) aGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGgctgc > 2:879281/1‑140 (MQ=255) aGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCCGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGgctgc > 2:823143/1‑140 (MQ=255) ggAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTAc > 2:175651/1‑140 (MQ=255) aagaaCTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGGCATTTGTTCGTATTAACAGCAACATAGGCTGCTACgg > 1:495994/1‑140 (MQ=255) agaaCTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGc < 1:879281/140‑1 (MQ=255) ggTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTcc < 1:988035/140‑1 (MQ=255) ttGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCa < 1:828021/140‑1 (MQ=255) tGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAg < 1:801008/140‑1 (MQ=255) gTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGa < 1:1040227/140‑1 (MQ=255) aaaaaaCGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAAt > 1:268092/1‑140 (MQ=255) agCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACGCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCa < 2:766231/140‑1 (MQ=255) cGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAAt > 2:1349094/1‑140 (MQ=255) cGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAAt < 1:1169758/140‑1 (MQ=255) ttAGTCTGGCTAAGCCACCTGTCATTCAAAGTCTCCAGGCATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCa < 2:495994/140‑1 (MQ=255) gTCTGGCTAAGCCACCTGGTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACca > 2:1302646/1‑140 (MQ=255) tCTGGCTAAGCCACCTGTTATTTAAAGGCTCTAGGAATTCAACCCTTTCACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACcaa < 2:405105/140‑1 (MQ=255) tCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCTCAGTATATTAACGACAATTAGTGCACcaa > 1:405105/1‑140 (MQ=255) tGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCATGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACcaaca < 2:646961/140‑1 (MQ=255) tGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTACTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACcaaca < 1:768147/140‑1 (MQ=255) gCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACCTAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACaaa > 2:212810/1‑140 (MQ=255) gCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCATTTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACaaa > 1:296393/1‑140 (MQ=255) gCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACaaa > 1:822480/1‑140 (MQ=255) gCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACaaa > 2:1135593/1‑140 (MQ=255) cTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAAt < 2:167854/140‑1 (MQ=255) aaGCCACCTGTTATTGAAAGGCACCTGGTATTTAACCTTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATag < 1:604715/140‑1 (MQ=255) gCCTCCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACcaa < 2:99081/131‑1 (MQ=255) gCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACcaa > 1:99081/1‑131 (MQ=255) gCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACaaa > 1:669887/1‑135 (MQ=255) gCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACaaa < 2:669887/135‑1 (MQ=255) ccACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCATTTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAgaga < 2:296393/140‑1 (MQ=255) cTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACcaa > 2:303926/1‑126 (MQ=255) cTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACcaa < 1:303926/126‑1 (MQ=255) cTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGa > 1:1195956/1‑140 (MQ=255) ttATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATa < 1:1014401/140‑1 (MQ=255) ttATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATa < 2:1450798/140‑1 (MQ=255) ttATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATa < 2:1195956/140‑1 (MQ=255) ttATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATa < 2:268092/140‑1 (MQ=255) tATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATAc < 2:822480/140‑1 (MQ=255) aTTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATAcc < 2:1240214/140‑1 (MQ=255) ttCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCa < 1:1349094/140‑1 (MQ=255) aGGCTCCAGGTATTTATCCCTTGTACCTCTTCCGCCTAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTaa < 2:696989/140‑1 (MQ=255) aGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAGTAGAGATAGAATACCAAGTaa < 1:849933/140‑1 (MQ=255) aGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATa > 1:1126497/1‑132 (MQ=255) aGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATa < 2:1126497/132‑1 (MQ=255) aGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTaa < 1:3305/140‑1 (MQ=255) aGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTaa > 1:834943/1‑140 (MQ=255) aGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTaa < 1:1309442/140‑1 (MQ=255) ggCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAAt < 2:834943/140‑1 (MQ=255) ggCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAAt > 2:1341090/1‑140 (MQ=255) ggCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAAt < 1:823143/140‑1 (MQ=255) gCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATAcc > 2:1278363/1‑132 (MQ=255) gCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATAcc < 1:1278363/132‑1 (MQ=255) gCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATa > 2:307107/1‑140 (MQ=255) tCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGa < 1:1135593/140‑1 (MQ=255) ccAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGAGCACCAAAAAACAGGGATAGAATACCAAGTAATAGaa > 1:696989/1‑140 (MQ=255) tttAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCa < 2:122634/123‑1 (MQ=255) tttAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCa > 1:122634/1‑123 (MQ=255) ttAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAAtt > 2:1184671/1‑140 (MQ=255) tAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCACCAAGTAGTGATAGAATACCAATAAATAGAACTATAATTg > 2:724717/1‑140 (MQ=255) tAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTg > 2:122487/1‑140 (MQ=255) tttACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCtttttt > 2:219994/1‑140 (MQ=255) tttACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCtttttt > 2:1185646/1‑140 (MQ=255) tttACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAAATAGAATGCCATGTGATAGAAATATAATTGCtttttt > 1:633880/1‑140 (MQ=255) ttACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGGTAGAATATCAATTATTAGAACTATAATTGCTTTTTTc > 1:461059/1‑140 (MQ=255) ttACCTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTc > 2:42023/1‑140 (MQ=255) ccTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCAt < 1:175651/140‑1 (MQ=255) ccTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCAt < 1:307107/140‑1 (MQ=255) ccTCTTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCAt < 1:42023/140‑1 (MQ=255) ccTCTTTCTCATAGAGCCATTTATTAGTGTTAACAGCCACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCAt < 1:724717/140‑1 (MQ=255) ctTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCAt > 1:1482367/1‑137 (MQ=255) ctTTCTCATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCAt < 2:1482367/137‑1 (MQ=255) tctcATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAAcccc > 2:823703/1‑140 (MQ=255) tctcATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAAcccc > 1:1404038/1‑140 (MQ=255) ctcATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCtt < 1:1548127/125‑1 (MQ=255) ctcATAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCtt > 2:1548127/1‑125 (MQ=255) tAGAGCCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGAc > 1:954022/1‑140 (MQ=255) | CTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGAATACCAAGTAATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGAC > NC_000913/4002326‑4002598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |