Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,334,604 | 0 | A | G | 99.5% | 669.2 / NA | 186 | C329C (TGT→TGC) | eptA | phosphoethanolamine transferase EptA |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
TCACCTTGCAGGTTATTGATGTACTCTTCAAGCCCGTGGAACAGCACTTCGTCATAGCATTCGCCGTTGATGCACTGATCAGGTAGATTCAGCGCGGTGACGTTCTGGTGAGGCACGCGGTCGCAGGCACCTTTACAGCCGCCATCGTTGTCATTCCACAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCACGGTACTGAA > NC_000913/4334470‑4334739 | tCACCTTGCAGGTTATTGATGTACTCTTCAAGCCCGTGGAACAGCACTTCGTCATAGCATTCGCCGTTGATGCACTGATCAGGTAGATTCAGCGCGGTGATGTTATGGCGAGGCACGGGGTCTCAGGCACCTTTGCAgcc > 2:474911/1‑140 (MQ=255) ttGCAGGTTATTGATGTGCTCTGCAAGCCCGTGGAACAGCACTTCGTCATAGCATTCGCCGTTGATGCACTGATCAGGTAGATTCAGCGCGGTGACGTTCTGGTGAGGCACGCGGTCGCAGGCACCTTTGCAGCCGCCAt < 2:507793/140‑1 (MQ=255) tGCAGGTTATTGATGTACTCTTCAAGCCCGTGGAACAGCACTTCGTCATAGCATTCGCCGTTGATGCACTGATCAGGTAGATTCAGCGCGGTGACGTTCTGGTGAGGCACGCGGTCGCAGGCACCTTTGCAGCCGCCATc > 1:514598/1‑140 (MQ=255) tGCAGGTTATTGATGTACTCTTCAAGCCCGTGGAACAGCACTTCGTCATAGCATTCGCCGTTGATGCACTGATCAGGTAGATTCAGCGCGGTGACGTTCTGGTGAGGCACGCGGTCGCAGGCACCTTTGCAGCCGCCATc > 2:310282/1‑140 (MQ=255) 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tCGCAGGCACCTTTGTAGCCGCAATTGTTATCATTCCTCAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCa < 1:583101/140‑1 (MQ=255) tCGCAGGCACCTTTGCATCCGCTATCGTTGTGATTCCACCGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCa < 2:571049/140‑1 (MQ=255) tCGCAGGCACCTTTGCAGCCGCCATCGTTGTCATTCCCCAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCa < 1:595251/140‑1 (MQ=255) tCGCAGGCACCTTTGCAGCCGCCATCGTTGTCATTCCACAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCa < 1:1433319/140‑1 (MQ=255) tCGCAGGCACCTTTGCAGCCGCCATCGTTGTCATTCCACAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCa < 1:1051041/140‑1 (MQ=255) tCGCAGGCACCTTTGCAGCCGCCATCGTTGTCATTCCACAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCa < 2:1540044/140‑1 (MQ=255) tCGCAGGCACCTTTGCAGCCGCCATCGTTGTCATTCCACAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCa < 2:381413/140‑1 (MQ=255) cGCAGGCACCTTTGCAGCCGCCATCGTTGTCATTCCACAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCAc < 1:887862/140‑1 (MQ=255) gCAGGCACCTTTGCAGCCGCCATCGTTGTCATTCCACAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCACg > 1:878899/1‑140 (MQ=255) cTTTGCAGCCGCCATCGTTGTCATTCCACAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATACACGGTACTGaa > 1:4050/1‑140 (MQ=255) | TCACCTTGCAGGTTATTGATGTACTCTTCAAGCCCGTGGAACAGCACTTCGTCATAGCATTCGCCGTTGATGCACTGATCAGGTAGATTCAGCGCGGTGACGTTCTGGTGAGGCACGCGGTCGCAGGCACCTTTACAGCCGCCATCGTTGTCATTCCACAGCACGTTGATGCCCGCTCGCTGAATGATATCCAGCACGCCTTCCTGGTGCTGTGCCAGCTCTTCTTTGTAGTGCTCACGCGGCATATCCGAGAACATGCACGGTACTGAA > NC_000913/4334470‑4334739 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |