| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,585,687 | A→G | Y359H (TAT→CAT) | hsdR ← | type I restriction enzyme EcoKI endonuclease component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,585,687 | 0 | A | G | 99.0% | 331.4 / NA | 96 | Y359H (TAT→CAT) | hsdR | type I restriction enzyme EcoKI endonuclease component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (42/53); minor base C (1/0); total (43/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGGGTATCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTCGATATTGTTACGTTT > NC_000913/4585550‑4585822 | gCGGGTATCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGct > 1:1312560/1‑140 (MQ=255) cGGGTATCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGctc < 1:1075355/140‑1 (MQ=255) cGGGTATCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGctc < 2:975007/140‑1 (MQ=255) gTATCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTAGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTgg > 2:1275052/1‑140 (MQ=255) tATCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGc > 1:1009348/1‑140 (MQ=255) aTCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCa < 1:1279517/140‑1 (MQ=255) aTCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGCTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCa < 1:790938/140‑1 (MQ=255) tCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCAc > 1:1478625/1‑140 (MQ=255) tCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCAc > 1:1445601/1‑140 (MQ=255) cacgcacgTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCa < 1:1265749/138‑1 (MQ=255) cacgcacgTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCa > 2:1265749/1‑138 (MQ=255) cacgcacgTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACt < 1:1320491/140‑1 (MQ=255) cacgcacgTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACt < 2:1445601/140‑1 (MQ=255) cgTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACt > 1:269412/1‑134 (MQ=255) cgTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACt < 2:269412/134‑1 (MQ=255) gTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCGGCTAGTTTCATGCACTGGCACTGCTTCAt > 1:644559/1‑140 (MQ=255) gTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCAt > 1:810829/1‑140 (MQ=255) gTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCAt > 1:1010047/1‑140 (MQ=255) gTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTCTGCCGCTGGTGTACCGGCAGCTGGTCTCATCCTCTGGCACTGCTTCAt > 2:713841/1‑140 (MQ=255) cgcgATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGc > 2:49259/1‑140 (MQ=255) cgcgATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGc > 1:313910/1‑140 (MQ=255) cgcgATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGc < 2:988205/140‑1 (MQ=255) cgcgATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGc > 1:107732/1‑140 (MQ=255) ccAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCAt < 1:1230804/140‑1 (MQ=255) cAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGGTGGTTTCATGCGCTGGCACTGATTCATGCACTTCATc > 1:482908/1‑140 (MQ=255) gATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCg > 1:89323/1‑140 (MQ=255) gATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCg > 1:945220/1‑140 (MQ=255) gATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCg > 1:677261/1‑140 (MQ=255) gATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGCCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGCCCTGCCAGCTGGGTGCCGGCTCTGGAACTGCTTCATGCAGTTCATCCg > 2:743105/1‑140 (MQ=255) tGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGt < 1:156945/140‑1 (MQ=255) tGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGt > 1:176917/1‑140 (MQ=255) tGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGt < 2:1205915/140‑1 (MQ=255) ccGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGa > 2:976943/1‑140 (MQ=255) cGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTGATGCTCTGGCAGTGGTTCATGGACTTCATCCGGTGag > 1:396211/1‑140 (MQ=255) cGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGag < 2:107732/140‑1 (MQ=255) cGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGACAGCTGGTTTCAAGCTATGGCACTGCTTCACGCACTTCATCCGGTGag > 2:640846/1‑140 (MQ=255) cTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGagta < 2:313910/140‑1 (MQ=255) cTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGagta > 2:1274180/1‑140 (MQ=255) cTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTAGCACTGCTGCATGCACTTCATCCGGTGagta > 2:462105/1‑140 (MQ=255) ggTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCGGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCt > 1:639827/1‑140 (MQ=255) gTCTTCATTGTTGCGCGGTATTGGCCCCCATTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTc < 1:556536/140‑1 (MQ=255) gTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTc < 1:900219/140‑1 (MQ=255) cATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTcaagca < 2:1009348/140‑1 (MQ=255) tgCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTAGCACTGCTGCATCCACTTCATCCGGAGAGTCGTGCTCAAGCAAGGttt > 2:556536/1‑140 (MQ=255) cgcgGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTcc < 1:158448/140‑1 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1:271493/140‑1 (MQ=255) gcCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATACACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCa < 1:1428525/140‑1 (MQ=255) gcCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGCATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCa < 1:653880/140‑1 (MQ=255) cGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGGGTAGTGCGCAAGCAGGGTTTCTCGCAGGAAGCCATTa > 1:397515/1‑140 (MQ=255) cGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTa > 2:824361/1‑140 (MQ=255) cGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTa > 2:175088/1‑140 (MQ=255) cGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTa > 2:1124106/1‑140 (MQ=255) ttGGTCGAGTAGCAGTAGGGGAATTGAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATc < 1:640846/140‑1 (MQ=255) ttGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATc > 1:286982/1‑140 (MQ=255) ttGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATc > 2:140847/1‑140 (MQ=255) ttGGTCGAGTAGCAGAACGGGAATTTAAACCCTTGCTTGCCGCTGGTGCCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATc < 2:396211/140‑1 (MQ=255) ttGGTCGAGTAGCAGAAAGGGAGTTTAAACCGTTGGTTGCCGCTGGTGCCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATc < 2:644559/140‑1 (MQ=255) tGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCg < 1:54934/140‑1 (MQ=255) gTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGaa < 2:273472/140‑1 (MQ=255) cGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAAc > 1:995932/1‑140 (MQ=255) aGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACAt > 2:1406599/1‑140 (MQ=255) aGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACAt < 1:824361/140‑1 (MQ=255) gTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACAtt < 2:810829/140‑1 (MQ=255) gTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACAtt < 2:1010047/140‑1 (MQ=255) gTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACAtt < 1:976943/140‑1 (MQ=255) aGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTa < 1:1124106/140‑1 (MQ=255) cAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACt > 1:810417/1‑140 (MQ=255) aGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTg < 1:135213/140‑1 (MQ=255) gAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCATTCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGt < 2:81697/140‑1 (MQ=255) gAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGt < 2:677261/140‑1 (MQ=255) ggggATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGc > 1:182155/1‑140 (MQ=255) gATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGt > 1:600436/1‑134 (MQ=255) gATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGt < 2:600436/134‑1 (MQ=255) gATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGAt < 1:140847/140‑1 (MQ=255) ttttAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATAc > 1:917626/1‑140 (MQ=255) ttAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGa < 2:846773/140‑1 (MQ=255) ttAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGa < 2:1478625/140‑1 (MQ=255) aCCGTTGTTTGCCGCTAGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCGATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCa < 1:1275052/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCAtt < 1:856459/140‑1 (MQ=255) tgttTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGCAACTCCTTCAGCCATTTCTTCCGGGGGTAAGGGCTCAAGAAGGGTTTCCCCCGGGAAGCCTTTTCCAAAACTTTTA‑TTTAACGGTTCGACTCATTGAGc > 2:78370/1‑140 (MQ=255) gttTGCCGCTGGTGTACTGCCAGCTAGTTCCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGc < 1:713841/140‑1 (MQ=255) gagacagCTGGTGTCCTGCCAGATGGTTTCATGCTCTCGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGcc < 1:495383/134‑1 (MQ=255) cGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCg < 2:176917/140‑1 (MQ=255) gCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGA‑ACGACTCATTGAGCCTGGCggg < 2:89323/140‑1 (MQ=255) cTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCggg < 2:1407201/140‑1 (MQ=255) cTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCggg < 1:1215651/140‑1 (MQ=255) ggTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCTCTGCTTCTTGCACTTCCTCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGaa < 2:482908/140‑1 (MQ=255) gtgtCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAAc > 1:90457/1‑140 (MQ=255) tCCTGCCAGCTGGTTTCATGCTGTGTCACTGCTTCATCCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTc < 1:743105/140‑1 (MQ=255) cTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCTCTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTCGa < 1:1406599/140‑1 (MQ=255) cTGCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTCGa < 2:182155/140‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTCGata < 1:49259/140‑1 (MQ=255) ccAGCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAAGATTTACTGGAGCCATACGACTCATTAAGCCCGGCGGGAACgctgtctc > 2:495383/1‑133 (MQ=255) gCTGGTTTCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTCGATATTGt < 1:175088/140‑1 (MQ=255) tCATGCTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTCGATATTGTTACGttt < 2:90457/140‑1 (MQ=255) | GCGGGTATCACGCACGTCGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCAGCTGGTTTCATACTCTGGCACTGCTTCATGCACTTCATCCGGTGAGTAGTGCTCAAGCAAGGTTTCCCGCAGGAAGCCATTATCGAAACATTTACTGTAGCGATACGACTCATTGAGCCTGGCGGGAACGTCGATATTGTTACGTTT > NC_000913/4585550‑4585822 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |