Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 837,737 | A→G | G63G (GGT→GGC) | ybiJ ← | DUF1471 domain‑containing protein YbiJ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 837,737 | 0 | A | G | 98.9% | 322.0 / NA | 91 | G63G (GGT→GGC) | ybiJ | DUF1471 domain‑containing protein YbiJ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (55/35); minor base T (1/0); total (56/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTAGCGTCGCATCAGGCATCTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCA > NC_000913/837604‑837872 | gTAGCGTCGCATCAGGCATCTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCt > 2:1323628/1‑140 (MQ=255) gTAGCGTCGCATCAGGCATCTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTGGGTGGCGGAAGGGAGGCTGTATCCACTGGCGCCGGCt > 1:467920/1‑140 (MQ=255) cATCAGGCATCTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCt > 1:1092029/1‑140 (MQ=255) tCAGGCATCTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCttt > 1:251784/1‑140 (MQ=255) tCAGGCATCTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTCTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCttt > 1:557725/1‑140 (MQ=255) gCATCTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCa < 2:1401221/140‑1 (MQ=255) aTCTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGc > 2:788361/1‑140 (MQ=255) tGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAg > 2:843170/1‑140 (MQ=255) gCCGGATGCGGCGTAAACGCCTAATCCGTCCGACGTATTACTTATAAAATACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTc < 2:580148/140‑1 (MQ=255) ccGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCg > 2:920989/1‑140 (MQ=255) ccGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGGGATGCTGTATGCACGGGCTCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCg > 2:485291/1‑140 (MQ=255) cGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGc < 1:1038116/140‑1 (MQ=255) aTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGc < 1:1510686/137‑1 (MQ=255) aTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGc > 2:1510686/1‑137 (MQ=255) aTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTc < 1:843170/140‑1 (MQ=255) cggcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTTTCCACTGGTGCCGGCGGCCGCGGCTATCTAAGCCAGTTTCGCTTCCAg > 2:547302/1‑140 (MQ=255) cggcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAg < 2:1073488/140‑1 (MQ=255) cggcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAg < 2:1045668/140‑1 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCa < 2:804839/140‑1 (MQ=255) aCGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTTCCGGGGCGTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGa > 2:544655/1‑140 (MQ=255) tCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATgcgc > 2:913168/1‑140 (MQ=255) ccTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGcc > 2:674886/1‑140 (MQ=255) tACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCAt < 1:192448/140‑1 (MQ=255) tACGAATTACTTATAAAGTACCCCAGTACCGCTTATTTTGTTGTTGTTAGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGAGTGGATGCGCCAt < 2:646608/140‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATc > 2:376745/1‑140 (MQ=255) ccTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGaa > 1:1152949/2‑140 (MQ=255) cTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGaaa > 1:1164756/1‑140 (MQ=255) taAATTACCGCAGTACCCCTTACTTTATTGTCGTTAGTGCCGGAAGTGTTGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCAc < 2:399955/140‑1 (MQ=255) aaaTTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACg < 2:1092029/140‑1 (MQ=255) aaaTTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGACTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCAcc < 2:335336/140‑2 (MQ=255) aaaTTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAATGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACg > 2:41390/1‑140 (MQ=255) aaTTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGc > 2:1457977/1‑140 (MQ=255) aaTTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGc < 1:376745/140‑1 (MQ=255) ttACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCg > 1:1414311/1‑140 (MQ=255) tACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGa < 1:1211502/140‑1 (MQ=255) aCCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGc < 2:147699/136‑1 (MQ=255) aCCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGAt < 1:920989/140‑1 (MQ=255) aCCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGAt > 2:175238/1‑140 (MQ=255) aCCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGAt > 2:232323/1‑140 (MQ=255) aCCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGAt > 1:969118/1‑140 (MQ=255) aCCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGAt > 2:8572/1‑140 (MQ=255) aCCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAATGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGAt < 1:41390/140‑1 (MQ=255) aCCGCAGCACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGc > 1:147699/1‑136 (MQ=255) ccGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCTGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGAtt > 2:817190/1‑140 (MQ=255) ccGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATGGAGGGTGAATGGGCGATCGGCGGAAACCACGCCGAtt > 1:399955/1‑140 (MQ=255) ccGCAGTACCGCTTAATTTATTCTTGTTGGTCGCGAAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGAtt < 2:613234/140‑1 (MQ=255) cGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCAAGGGTGGATGCGCCATCGGCAAAAACCACGCCGAttt > 1:446453/1‑140 (MQ=255) ccGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGTCAGAAACCAAGCCGATTTTATTCAt > 1:702313/1‑140 (MQ=255) ccGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCAt > 2:982059/1‑140 (MQ=255) cTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATTGAGGGTGGATGCTCCATCGGCAGAACCCACGCCGATTTTATTCATGtt > 2:645923/1‑140 (MQ=255) cTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTAtt > 1:1438512/1‑134 (MQ=255) cTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTAtt < 2:1438512/134‑1 (MQ=255) cTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGtt > 1:1289809/1‑140 (MQ=255) cTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGtt > 2:338046/1‑140 (MQ=255) cTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCAATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGtt > 2:1535152/1‑140 (MQ=255) ttAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTc < 2:1358148/140‑1 (MQ=255) tAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCt < 2:1414311/140‑1 (MQ=255) tAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCt < 1:226608/140‑1 (MQ=255) aaTTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCtg > 1:1510316/1‑140 (MQ=255) aTTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCtgt < 1:913168/140‑1 (MQ=255) ttgttgGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGa < 2:1152949/140‑1 (MQ=255) tgttgGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGAt > 2:360831/1‑140 (MQ=255) tgttgGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGACTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGAt > 1:40482/1‑140 (MQ=255) gttgGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATg < 2:1289809/140‑1 (MQ=255) ttgGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGtt > 1:1456666/1‑125 (MQ=255) ttgGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGtt < 2:1456666/125‑1 (MQ=255) ttgGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCt > 1:1077693/1‑127 (MQ=255) ttgGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCt < 2:1077693/127‑1 (MQ=255) ggtggCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGcca > 1:341034/1‑139 (MQ=255) ggtggCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCg > 2:1051488/1‑140 (MQ=255) gCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTAc < 2:140240/140‑1 (MQ=255) gCGGAAGTGATGCTGTAGCCACGGGCGCCGGGTGCTGCGTCTTTCTCAACCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTAc < 2:702313/140‑1 (MQ=255) gCGGAAGTGATGCTGTACCCACTGGCGCCGGCTGCAGCGTCTTTCTCACCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTAc < 2:520572/140‑1 (MQ=255) cGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTgg < 2:61468/128‑1 (MQ=255) cGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTgg > 1:61468/1‑128 (MQ=255) aGTGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGtt > 1:213109/1‑140 (MQ=255) tGATGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGTCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTcc > 2:1013046/1‑140 (MQ=255) tGCTGTATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTccgcc > 2:211772/1‑140 (MQ=255) tGCTGTATCCACTGGAGCCGGCTGCAGCGTCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTccgcc < 1:645923/140‑1 (MQ=255) tATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGaa < 1:674886/140‑1 (MQ=255) tATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGaa > 1:798015/1‑140 (MQ=255) tATCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGaa > 1:1401778/1‑140 (MQ=255) tCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGTATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAaca > 1:1521171/1‑140 (MQ=255) tCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAaca < 1:982059/140‑1 (MQ=255) tCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAaca > 2:109319/1‑140 (MQ=255) tCCACTGGCGCCGGCTGCCGCGACTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAaca < 2:40482/140‑1 (MQ=255) aCTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGc > 2:1004096/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGACAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAaca < 2:1087940/137‑1 (MQ=255) aCTGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGACAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAaca > 1:1087940/1‑137 (MQ=255) tGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCa > 2:1538030/1‑140 (MQ=255) tGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCa > 2:1529763/1‑140 (MQ=255) tGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCa > 1:75287/1‑140 (MQ=255) tGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCa > 2:1548021/1‑140 (MQ=255) tGGCGCCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATACCGCTATCGGTTCAGCCGCGAACACGCCa > 1:722079/1‑140 (MQ=255) | GTAGCGTCGCATCAGGCATCTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCGGCTGCCGCGGCTTTCTCAGCCAGTTTCGCTTCCAGGGCATCGAGGGTGGATGCGCCATCGGCAGAAACCACGCCGATTTTATTCATGTTCTGTGCCTGGGATGCCGTTACCGGTTCCGCCGCGAACACGCCA > NC_000913/837604‑837872 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |