| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,280,952 | T→C | D363D (GAT→GAC) | narG → | nitrate reductase A subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,280,952 | 0 | T | C | 98.7% | 280.0 / NA | 80 | D363D (GAT→GAC) | narG | nitrate reductase A subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (39/39); minor base G (1/0); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCACCTCGACAACCCAAGCCAGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGATGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATGGAATCTTGAGCAGCGCGACGG > NC_000913/1280817‑1281086 | ccACCTCGACAACCCAAGCCAGTATCTCAACGACTATCTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACgcgc < 1:456505/140‑1 (MQ=255) cACCTCGACAACCCAAGCCAGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCt > 1:1076769/1‑140 (MQ=255) ccTCGACACCCCAAGCCTGTATCTCACCGACTATGCGCGTCGCTACACAGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTgg < 2:401788/140‑1 (MQ=255) ccTCGACAACCCAAGCCAGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTgg < 2:45440/140‑1 (MQ=255) ccTCGACAACCCAAGCCAGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTgg < 1:1265309/140‑1 (MQ=255) tCGACAACCCAAGCCAATATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGc < 2:1145712/140‑1 (MQ=255) cGACAACCCAAGCCAGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGcc > 2:791842/1‑140 (MQ=255) gACAACCCAAGCCAGTA‑TTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAg < 1:1052020/140‑1 (MQ=255) aCCCAAGCCAGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGAcgcg < 1:807666/128‑1 (MQ=255) aCCCAAGCCAGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGAcgcg > 2:807666/1‑128 (MQ=255) ccAAGCCAGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGATGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGaaaa < 2:325814/140‑1 (MQ=255) ccAGTATTTCACCGACTCTGTGCGTCGCTACTCCGTCATCCCGATGCTAGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATc < 2:441292/140‑1 (MQ=255) ccAGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATc < 2:13066/140‑1 (MQ=255) aGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCg < 2:789072/140‑1 (MQ=255) tATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGa > 2:1312210/1‑140 (MQ=255) cACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATTTGGGTGAGGCGCTGGGACAGGGAAACAATCCGGAATGGa > 2:466401/1‑140 (MQ=255) cACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGa > 1:1046029/1‑140 (MQ=255) aCCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGaa > 2:1383079/1‑140 (MQ=255) aCTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACt > 1:235136/1‑140 (MQ=255) aCTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACt > 1:107656/1‑140 (MQ=255) aCTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACt > 2:81815/1‑140 (MQ=255) tATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGt > 1:1036284/1‑140 (MQ=255) aTGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTc < 2:246681/140‑1 (MQ=255) aTGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTc < 2:88102/140‑1 (MQ=255) aTGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTc < 2:1036284/140‑1 (MQ=255) aTGTACGTGGCTACACCGACATACCGATGCTGGGGCTGCGGGAAGAACTCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTc < 2:735175/140‑1 (MQ=255) gtgCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGc < 2:1076769/140‑1 (MQ=255) tCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGt > 2:1527742/1‑132 (MQ=255) tCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGt < 1:1527742/132‑1 (MQ=255) acacCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATAcc < 2:107656/140‑1 (MQ=255) cacCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCa > 2:940530/1‑140 (MQ=255) ccGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCaaa < 1:81815/140‑2 (MQ=255) aCATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAAGAATTCGGAATGGAAAACTGTCTCCTTTAATACCAATGGc > 2:565150/1‑140 (MQ=255) aCATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTc < 2:377703/122‑1 (MQ=255) aCATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTc > 1:377703/1‑122 (MQ=255) ccGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAAt > 1:946723/1‑140 (MQ=255) ccGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAAt > 2:78170/1‑140 (MQ=255) aTGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGt > 2:303169/1‑140 (MQ=255) aTGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGt > 1:1178527/1‑140 (MQ=255) gATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGa < 1:940530/140‑1 (MQ=255) aTGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGaa < 1:791842/140‑1 (MQ=255) aTGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGaa < 1:762400/140‑1 (MQ=255) aagaaCGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGaa > 2:1060601/1‑133 (MQ=255) aagaaCGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGaa < 1:1060601/133‑1 (MQ=255) aagaaCGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCt > 2:937191/1‑140 (MQ=255) aCGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTg > 2:1138981/1‑140 (MQ=255) cgcgACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTgg > 2:372468/1‑140 (MQ=255) cgcgACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTgg > 2:156146/1‑140 (MQ=255) cGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTcc > 2:1381948/1‑140 (MQ=255) ggTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCCGCGCGCTGCTGCTCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCg < 1:520852/140‑1 (MQ=255) ttACTACGCTGCAGGACGTATGTTGAGCGTTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCt < 1:642457/140‑1 (MQ=255) cTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCgag > 2:803163/1‑140 (MQ=255) cTGCAGGTCGTATGCGGCGCGCGGCTGATGTGGTTGAAGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCgag < 1:674358/140‑1 (MQ=255) tGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGTTTGAGCCCAACGGTTCTATTGACTTCCGCTGGGGCgaga > 2:443487/1‑140 (MQ=255) tGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGGGCCAAACGGTTCCATTGTCTTCCGCTGGGGCgaga > 2:520852/1‑140 (MQ=255) tGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCgaga > 1:188563/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGaa > 2:214175/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGaa > 2:1451865/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGaa > 1:377111/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGaa > 2:859520/1‑140 (MQ=255) aGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAgg < 1:214175/140‑1 (MQ=255) gTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGc < 1:859520/140‑1 (MQ=255) tATGCTGCGCGCTGCCGATCTGCTTTACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAAt < 1:466401/140‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATg < 2:1046029/140‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATg < 1:1138981/140‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATg < 1:1383079/140‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATg < 1:372468/140‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATg < 2:377111/140‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATg < 1:303169/140‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATg < 2:1421247/140‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGATGCGCCGAACGGCTATATTGGCTTCCGCTGGCGCGAGAAGGGCAAATg > 2:674358/1‑140 (MQ=255) aTGCTGCGCGCTGCTAATCTGGTTGACGCTCTGGGCCGGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATg < 1:565150/140‑1 (MQ=255) gcgcgcTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGGCGAACGGTGCTATTGGGTTCCGCTGTGGCGCGAAGGGCAAATGGAATc > 2:598263/1‑140 (MQ=255) cgcgcTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTTCGCCGGGGCGAGAGGGGCAAATGGAATCt > 1:447039/1‑140 (MQ=255) cgcgcTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATg < 1:1371139/134‑1 (MQ=255) cgcgcTGCTGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATg > 2:1371139/1‑134 (MQ=255) gctgctGATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGGAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATGCCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATGGAATCTTGa > 1:1116125/1‑140 (MQ=255) ctgctgATCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATGGAATCTTGag > 1:1228896/1‑140 (MQ=255) aTCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATGGAATCTTGAGCAgcgc < 1:1381948/140‑1 (MQ=255) tCTGGTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATGGAATCTTGAGCAGcgcg < 1:1451865/140‑1 (MQ=255) gTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTTGGGCGAGAAGGGCAAATGGAATCTTGAGCAGCGCGACgg > 2:227903/1‑140 (MQ=255) gTTGACGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGGGAGAAGGGCAAAGGGAAGCTTGAGCAGCGCGACgg > 2:513037/1‑140 (MQ=255) | CCACCTCGACAACCCAAGCCAGTATTTCACCGACTATGTGCGTCGCTACACCGACATGCCGATGCTGGTGATGCTGGAAGAACGCGACGGTTACTACGCTGCAGGTCGTATGCTGCGCGCTGCTGATCTGGTTGATGCGCTGGGCCAGGAAAACAATCCGGAATGGAAAACTGTCGCCTTTAATACCAATGGCGAAATGGTTGCGCCGAACGGTTCTATTGGCTTCCGCTGGGGCGAGAAGGGCAAATGGAATCTTGAGCAGCGCGACGG > NC_000913/1280817‑1281086 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |