| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,472,600 | T→C | pseudogene (2082/3495 nt) | ydbA → | putative outer membrane protein, N‑terminal fragment |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,472,600 | 0 | T | C | 100.0% | 331.7 / NA | 93 | pseudogene (2082/3495 nt) | ydbA | putative outer membrane protein, N‑terminal fragment |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (45/48); total (45/48) | |||||||||||
ATTTAGCGTACTGGGTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTATGTCGTCGGTACCAAC > NC_000913/1472468‑1472735 | aTTTAGCGTACTGGGTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATagca < 1:772822/140‑1 (MQ=255) tttAGCGTACTGGGTTCAGTAGCTCTTGTAGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATagcag < 1:456681/140‑1 (MQ=255) tttAGCGTACTGGGTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATagcag < 1:1539959/140‑1 (MQ=255) tAGCGTACGGGGTACAGGAGGTGATGTGGTCGAGAACGGAACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCg < 2:724451/140‑1 (MQ=255) aGCGTACTGGGTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATCTTGAAGGTATGTACAGTAACATCGGCAATAGCAGCGa > 1:730797/1‑140 (MQ=255) gCGTACTGGGTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGaa < 2:33220/140‑1 (MQ=255) gCGTACTGGGTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGaa < 2:1298634/140‑1 (MQ=255) cGTACTGGGTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAg > 1:642383/1‑140 (MQ=255) tGGGTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGaa > 1:100657/1‑134 (MQ=255) tGGGTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGaa < 2:100657/134‑1 (MQ=255) gggTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGaa < 2:1368723/133‑1 (MQ=255) gggTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGaa > 1:1368723/1‑133 (MQ=255) gggTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCAtt < 2:1277877/140‑1 (MQ=255) gggTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCAtt > 1:938211/1‑140 (MQ=255) gggTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGGATGAACGGTAAAAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCAtt > 1:633246/1‑140 (MQ=255) tACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATg < 1:92467/140‑1 (MQ=255) tAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAATGGTGACAACGGCAATACCAGCGAAGTGCATTATGGCGAc > 2:584592/1‑140 (MQ=255) gTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGaa > 2:1356169/1‑122 (MQ=255) gTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGaa < 1:1356169/122‑1 (MQ=255) gTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATg < 2:930600/132‑1 (MQ=255) gTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATg > 1:930600/1‑132 (MQ=255) gTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACtat > 1:1367874/1‑140 (MQ=255) gTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACtat > 1:1173842/1‑140 (MQ=255) gTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACtat > 1:1544473/1‑140 (MQ=255) gTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAACATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCTATACCATCGAAGTCCATTATGGCGACtat > 1:483907/1‑140 (MQ=255) gTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTACCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATg > 1:1417847/1‑132 (MQ=255) gTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTACCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATg < 2:1417847/132‑1 (MQ=255) cATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATAc > 2:226263/1‑140 (MQ=255) aTGTGGTTAACAACGTCACGGTTGTGATTGCCGATGGAGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACg < 1:620804/140‑1 (MQ=255) aTGTGGTTAACAACGTCACGGTTGTCATTTCCGATGGTGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACg < 1:508987/140‑1 (MQ=255) aTGTGGTTAACAACGACACGGTAGTCATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACg < 1:714887/140‑1 (MQ=255) tgtgGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGt > 1:1033253/1‑140 (MQ=255) gtgGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGtt > 1:818611/1‑140 (MQ=255) gtgGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGtt > 1:1526759/1‑140 (MQ=255) ggTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATgg > 1:110793/1‑126 (MQ=255) ggTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATgg < 2:110793/126‑1 (MQ=255) gTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGTCAACAGCAGCGAAGTGAATTAGGGCGACTATACGTTGcc > 2:699385/1‑140 (MQ=255) ttAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCg > 1:27128/1‑140 (MQ=255) gCACGGTGGTGATTGCCGATGTCGTTACGTGTTCTGGTCTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCg < 1:432156/140‑1 (MQ=255) gCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCg > 2:178057/1‑140 (MQ=255) cACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCg < 1:283662/139‑1 (MQ=255) cACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCg > 2:283662/1‑139 (MQ=255) cACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGa > 1:1448376/1‑140 (MQ=255) gtgATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCaa < 2:818611/140‑1 (MQ=255) gtgATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCaa < 1:961960/140‑1 (MQ=255) tgATTGCCGATGGGGTTTCGGGATCTGGACTTATCGAGCGGGGCGACATCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAAt < 2:483907/140‑1 (MQ=255) aTTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATAc < 1:1523378/140‑1 (MQ=255) gCCGATGTGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGt < 1:363669/140‑1 (MQ=255) gCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCTACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGt < 2:642383/140‑1 (MQ=255) gCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGt < 2:113426/140‑1 (MQ=255) gCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGt < 1:885195/140‑1 (MQ=255) gCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGt < 2:1084589/140‑1 (MQ=255) gCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGt < 2:1033253/140‑1 (MQ=255) gCCGATGGGGTTACGGGTTCTGAACCGATCAAGCAGGACGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGt < 1:494553/140‑1 (MQ=255) gCCGATGGCGTTACGGCTTCTGTACTGATCGAGCACGGCTACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGt < 2:719644/140‑1 (MQ=255) cGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAAt > 1:1046578/1‑133 (MQ=255) cGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAAt < 2:1046578/133‑1 (MQ=255) cGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAAt < 1:325476/133‑1 (MQ=255) cGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAAt > 2:325476/1‑133 (MQ=255) aTGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAgt > 1:1194817/1‑140 (MQ=255) aTGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAgt > 2:388160/1‑140 (MQ=255) gggTTACGGGTTCTGGACTGATCAAACAGAGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTa < 1:584592/140‑1 (MQ=255) ggTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCggg < 1:178057/140‑1 (MQ=255) ggTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCggg < 2:1526759/140‑1 (MQ=255) ggTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCggg < 2:27128/140‑1 (MQ=255) tCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAg > 2:1314196/1‑140 (MQ=255) tCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAg > 1:913045/1‑140 (MQ=255) cTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGt > 1:389320/1‑140 (MQ=255) aCTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGtgatg < 1:384282/140‑1 (MQ=255) gATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGAATGTGCCGCAGCCCAAAACGGTTAGTGTAAGGTCGGGAAGTGATGAgg > 2:501589/1‑140 (MQ=255) aTCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGc > 2:986631/1‑140 (MQ=255) aTCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGc > 1:1269736/1‑140 (MQ=255) aTCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGCCGGGAAGTGAGAAGGc > 2:1327387/1‑140 (MQ=255) gCAGGGCGACAGCATTAATGTTAAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCtggtg < 1:699385/140‑1 (MQ=255) gggCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGAAACTTCGGGAAGTAATGAGGCTGGTGgca > 1:435847/1‑140 (MQ=255) gCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAgg < 2:944089/129‑1 (MQ=255) gCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAgg > 1:944089/1‑129 (MQ=255) gCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGgcagc > 1:1458060/1‑140 (MQ=255) gCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACCGTTAGTGAAACGTCGGGAAGTCATGAGGCTGGTGgcagc > 2:504302/1‑140 (MQ=255) cGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGgcagca > 1:571917/1‑140 (MQ=255) aCAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATg < 2:1194817/140‑1 (MQ=255) cAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGa < 1:388160/140‑1 (MQ=255) aTGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTc < 1:226263/140‑1 (MQ=255) ttGAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAAc > 1:996123/1‑140 (MQ=255) gAAGGTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACgg > 2:1536514/1‑140 (MQ=255) gTATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTAt > 1:1146128/1‑140 (MQ=255) tATGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTATg < 1:1375770/140‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATCAGGCTGGGGGCCGCATGAACAGCCTCAACGGCTATgt > 1:632816/1‑140 (MQ=255) tGAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTATgtc > 2:1411618/1‑140 (MQ=255) tGAACGGTAACAACGCCAATAGTAGTGAAATGCATTACGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTATgtc < 1:504302/140‑1 (MQ=255) gAACGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATAAGGGTGGAGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTATgtcg > 2:505011/1‑140 (MQ=255) aCGGTAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTATgtcgtc < 1:1536514/140‑1 (MQ=255) tAACAACGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTATGTCGTCGGTa < 2:996123/140‑1 (MQ=255) aacaacGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACATCAACGGCTATGTCGTCGGTAc > 1:510903/1‑140 (MQ=255) caacGGCAATAGCAGCGTAGTGTATTATGGCTACTATACATTGCCGGACGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTATGTCGTCGGTACCa < 2:477744/140‑1 (MQ=255) acGGCAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAACATGAACAACCGCAACGGCTATGTCGTCGGTACCAAc > 1:477744/1‑140 (MQ=255) | ATTTAGCGTACTGGGTACAGTAGGTCATGTGGTTAACAACGGCACGGTGGTGATTGCCGATGGGGTTACGGGTTCTGGACTGATCAAGCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTATGTCGTCGGTACCAAC > NC_000913/1472468‑1472735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |