| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,860,630 | (C)5→4 | coding (348/894 nt) | yidL → | putative DNA‑binding transcriptional regulator YidL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,860,626 | 0 | C | . | 98.6% | 304.1 / ‑2.0 | 72 | coding (344/894 nt) | yidL | putative DNA‑binding transcriptional regulator YidL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base . (45/26); total (46/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.06e-01 | |||||||||||
AAGGATGTGGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCG > NC_000913/3860488‑3860760 | aaGGATGTGGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTAcc > 1:852316/1‑140 (MQ=255) aTGTGGGAAAATTCTATTAAAGAATTGCGAACAAATACCACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTAccctgt < 1:382679/140‑4 (MQ=255) tgtgGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTAccccacc > 1:771768/1‑137 (MQ=255) tgtgGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTAccccacc > 1:22765/1‑137 (MQ=255) tgtgGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTAccccacc > 1:555862/1‑137 (MQ=255) gtgGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAGCACGGCATGGCATCTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTAccccacca < 2:379922/140‑5 (MQ=255) tgGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAg > 1:66331/1‑140 (MQ=255) tgGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAg > 1:809755/1‑140 (MQ=255) tgGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAg > 2:19438/1‑140 (MQ=255) tgGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAg > 2:757279/1‑140 (MQ=255) aaaaTTCTTTTAAAGCATGGCGCACCAATCACACTGCCTGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTatg < 1:268698/140‑1 (MQ=255) tttAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGatat < 1:712649/140‑1 (MQ=255) aaaGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTcc < 1:757279/140‑1 (MQ=255) tGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTgg < 1:917114/140‑1 (MQ=255) tGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTgg > 1:831894/1‑140 (MQ=255) aaCAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGc < 2:862092/140‑1 (MQ=255) aCAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCa < 2:842941/140‑1 (MQ=255) cAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCaa < 2:797298/140‑1 (MQ=255) aaaTAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCaaa < 2:852316/140‑1 (MQ=255) acacTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGtt < 2:818787/140‑1 (MQ=255) gCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGACATTCCCGTTGGTCGGCAAAGCGttattta > 1:329385/1‑140 (MQ=255) cATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑TCCCACCAGAATGATGGTTATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGttatttat > 2:364036/1‑140 (MQ=255) cATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGttatttat > 2:40309/1‑140 (MQ=255) cATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGttatttat < 2:66331/140‑1 (MQ=255) aTGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCg > 1:985896/1‑131 (MQ=255) aTGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCg < 2:985896/131‑1 (MQ=255) aTGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTtata > 2:96607/1‑140 (MQ=255) aTGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTtata > 2:55047/1‑140 (MQ=255) aaCTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGc < 1:52746/140‑1 (MQ=255) cTGTATTATATTCTTCAAGCCACTGTATATTCACTCTCATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGCTGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTCATAATGGCGa < 1:484459/140‑1 (MQ=255) cTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGa < 1:889028/140‑1 (MQ=255) tataTTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTta < 2:641077/140‑1 (MQ=255) tataTTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTta < 2:22765/140‑1 (MQ=255) ttCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAAt > 1:593581/1‑140 (MQ=255) tCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATc > 2:199562/1‑140 (MQ=255) tCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATc > 1:823217/1‑140 (MQ=255) tCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATc > 1:928739/1‑140 (MQ=255) tCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATc > 1:866257/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCa > 1:170730/1‑140 (MQ=255) ttAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTta < 2:683000/133‑1 (MQ=255) ttAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTta > 1:683000/1‑133 (MQ=255) ttAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAg > 2:76891/1‑140 (MQ=255) ttAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAg < 2:170730/140‑1 (MQ=255) ttAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAg > 1:86111/1‑140 (MQ=255) ttAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAg > 2:653540/1‑140 (MQ=255) ttAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAg > 1:720587/1‑140 (MQ=255) ttAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCCTTAGTTGTAATGGAGAAATTTATAATCAg > 1:461662/1‑140 (MQ=255) ttAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGACAGAAAATCGTTATTTTTAATTGCGAAATTTATAATCAg > 2:384909/1‑140 (MQ=255) aaaGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGGAAAGCGTAATTCATCATGGCGTAATTTATAATCAGGa > 1:430723/1‑140 (MQ=255) aaGCCAATGGATATTCATTCTTATCACTGTGTAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGaa < 2:417468/140‑1 (MQ=255) aaGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGaa < 1:76891/140‑1 (MQ=255) tGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCg > 1:778063/1‑140 (MQ=255) tGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCg > 2:6744/1‑140 (MQ=255) tGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTAAGCAAAGCTTTAGTTAGAATGGCGAGATTTGTAATCAGGAACTCACCg > 2:274821/1‑140 (MQ=255) ttCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTg < 2:809755/140‑1 (MQ=255) ttATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGtt < 1:55047/140‑1 (MQ=255) ttATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTAATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGtt > 2:356115/1‑140 (MQ=255) aTCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCAc < 2:619597/123‑1 (MQ=255) aTCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCAc > 1:619597/1‑123 (MQ=255) aTCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTtaa > 1:394385/1‑140 (MQ=255) tgtgAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACt < 1:210467/140‑1 (MQ=255) gtgAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACtt > 2:881216/1‑140 (MQ=255) gtgAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACtt > 1:551378/1‑140 (MQ=255) gtgAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACtt > 1:960326/1‑140 (MQ=255) gAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACC‑‑‑‑CCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCa > 2:38662/1‑140 (MQ=255) gAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCa > 1:518625/1‑140 (MQ=255) tAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAg > 1:550040/1‑140 (MQ=255) tAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑‑CCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAg > 1:200407/1‑139 (MQ=255) tAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑‑CCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAg < 2:200407/139‑1 (MQ=255) gTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGTTGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCa > 1:631956/1‑140 (MQ=255) ggAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATaaa > 1:636464/1‑140 (MQ=255) gAACAGTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATaaaa > 1:586897/1‑140 (MQ=255) gTACTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACGCACCGAAGGTGCTGAGCTAATAACTACACCGGAAGCAATAAAAaataa > 2:273366/1‑140 (MQ=255) cTGGATGGAATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCt < 2:551378/140‑1 (MQ=255) gatggaATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGc > 1:69239/1‑140 (MQ=255) gatggaATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGc > 1:728036/1‑140 (MQ=255) ggaATTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTCCACCAGAATCAATAAAAAATAATCTGGCAGt > 2:393345/1‑140 (MQ=255) aaTTTA‑CCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCg > 2:34050/1‑140 (MQ=255) | AAGGATGTGGGAAAATTCTTTTAAAGAATGGCGAACAAATAACACTGCATGGCAACTGTATTATATTCTTAAAGCCAATGGATATTCACTCTTATCACTGTGAAGGTTTAGTCTGGGAACAGTACTGGATGGAATTTACCCCCACCAGTATGATGGATATTCCCGTTGGTCAGCAAAGCGTTATTTATAATGGCGAAATTTATAATCAGGAACTCACCGAAGTTGCTGAGTTAATAACTTCACCAGAAGCAATAAAAAATAATCTGGCAGTCG > NC_000913/3860488‑3860760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |