Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,364,164 | (C)5→4 | coding (879/1698 nt) | dsbD ← | protein disulfide oxidoreductase ‑ DsbDreduced |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,364,160 | 0 | C | . | 97.0% | 267.3 / 1.0 | 66 | coding (883/1698 nt) | dsbD | protein disulfide oxidoreductase ‑ DsbDreduced |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base . (37/27); total (38/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATCAGCGGCAGGCCCATGCCCAACGCATAGAGATAAAGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCGCCCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGCCAGCAAGGTAAAGACGA > NC_000913/4364021‑4364294 | aTCAGCGGCAGGCCCATGCCCAACGCATAGAGATAAAGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCGc > 2:415142/1‑140 (MQ=255) tCAGCGGCAGGCCCATGCCCAACGCATAGAGATAAAGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCGcc < 1:731688/140‑1 (MQ=255) gCGGCAGGCCCATGCCCAACGCATAGAGATAAAGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCGcccca > 1:717840/1‑139 (MQ=255) cATGCCCAACGCATAGAGATAAAGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAacac < 2:73598/140‑1 (MQ=255) aTGCCCAACGCATAGAGATAAAGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAacaca > 1:540298/1‑140 (MQ=255) tGCCCAACGCATAGAGATAAAGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAacacac > 1:968677/1‑140 (MQ=255) tAAAGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGccc > 2:68483/1‑140 (MQ=255) aaaGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATTAGTCCGGCCATC‑CCCCCATAACAAAGACACCGCCAGGTGAGCCGCCCt > 2:376711/1‑140 (MQ=255) aaaGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCt > 1:858980/1‑140 (MQ=255) aaGCGTGCCGCCGCCGAGCCACATGCTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTg < 1:385800/140‑1 (MQ=255) tGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CGCCAAAACGAACACACCGCCAGATGAGCCGCCCTGTTGGc > 2:264867/1‑140 (MQ=255) tGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAgccgcc > 1:819202/1‑132 (MQ=255) tGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAgccgcc < 2:819202/132‑1 (MQ=255) tGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGc > 2:835055/1‑140 (MQ=255) tGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGc < 1:224568/140‑1 (MQ=255) tGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCAATAACAAACACGCCACCAGGTAAGCCGCCCTGTTGGc > 1:382065/1‑140 (MQ=255) ccgccgccCAGCCACATGTTCCTGCTTTGGGTGATCTACAGCAGAATCCCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGa < 2:370770/140‑1 (MQ=255) gccgccCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGAtt < 2:859738/140‑1 (MQ=255) ccAGCCACATGTTCCTGCTTTGTGCCATAGACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCtca < 1:376711/140‑1 (MQ=255) ccACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCaa < 2:540298/140‑1 (MQ=255) tGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTga > 2:929092/1‑140 (MQ=255) tCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGAc > 2:507936/1‑140 (MQ=255) tttGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGTGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGttt > 1:76939/1‑140 (MQ=255) tGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGc > 2:842589/1‑140 (MQ=255) gggCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCa < 2:968677/140‑1 (MQ=255) gggCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCAGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCa < 1:743509/140‑1 (MQ=255) gacagATATACAGCATAATCGCCCTCAGCAGTGCGGTTGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCa < 1:259614/136‑1 (MQ=255) cGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCg < 2:717840/140‑1 (MQ=255) cGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCg < 2:81339/140‑1 (MQ=255) gcagAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTTAACGGATCAGTCGGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTG‑TTGCAGCGAAGAGGGGAg < 2:343613/140‑1 (MQ=255) gcagAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGa > 2:986609/1‑140 (MQ=255) agAATCGCGCTAAGCGGTGTGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGt < 1:257137/140‑1 (MQ=255) gAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGGGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTAATCAACGAGAGTCGGGTTTGCCGCGAAGAGGGGAGtt > 1:354615/1‑140 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGTGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTg < 2:76939/140‑1 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCa < 2:119438/124‑1 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCa > 1:119438/1‑124 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTg > 2:653204/1‑140 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTg > 2:527254/1‑140 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTg > 1:47961/1‑140 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTg > 1:890539/1‑140 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTg < 2:728524/140‑1 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTg > 1:701836/1‑140 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTg > 2:253456/1‑140 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTg > 1:847915/1‑140 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTg > 2:911439/1‑140 (MQ=255) aaTCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTAGCGATTGCGCATGAACGTGAGACGTCTTTGTAGCGAAGAggggctgtc > 2:259614/1‑135 (MQ=255) tCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACATATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCa > 1:187182/1‑140 (MQ=255) tCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAATGTGAGACGTGTTTGCAGAGAAGAGGGGaagggca > 2:941460/1‑134 (MQ=255) tCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCa > 1:827078/1‑140 (MQ=255) cgcTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAggg > 1:793906/1‑140 (MQ=255) tAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTaa < 1:986609/140‑1 (MQ=255) aGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAAc < 1:253456/140‑1 (MQ=255) aGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAAc < 2:827078/140‑1 (MQ=255) cggtgcggtgGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACaa < 1:16772/140‑1 (MQ=255) cggtgcggtgGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACaa < 1:929092/140‑1 (MQ=255) gcggtgGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGGTTGCAGCTAAGAGGCGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCa > 1:457607/1‑140 (MQ=255) cATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGAc > 2:811961/1‑140 (MQ=255) tGAACAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGAAGGGTAAACAAGCAAAACATTGACATCGc > 1:328879/1‑140 (MQ=255) tGAACAGATCAGTCCAGCAATCG‑CCACATGACAAACATACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGc < 1:264867/140‑1 (MQ=255) cAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGCCAGc < 1:507936/140‑1 (MQ=255) cAGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATAGCCAGc < 1:911439/140‑1 (MQ=255) aGATCAGTCCGGCAATCGCCCCC‑TAACAAACGCACCGCCCGGTGAGCCCCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGCCAGCa < 2:396827/140‑1 (MQ=255) aGATCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGCCAGCa < 1:68483/140‑1 (MQ=255) aTCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGCCAGCAAg > 2:608332/1‑140 (MQ=255) aTCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGCCAGCAAg > 2:917701/1‑140 (MQ=255) tCAGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGCCAGCAAgg > 1:191169/1‑140 (MQ=255) aGTCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAAGGTAAACCAGCTAACCATTGACATCGCCAGCAAGGTa > 1:396827/1‑140 (MQ=255) tCCGGCAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGCCAGCAAGGTcaa > 1:1018079/1‑140 (MQ=255) cAATCG‑CCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGCCAGCAAGGTAAAGACGa > 2:802453/1‑140 (MQ=255) | ATCAGCGGCAGGCCCATGCCCAACGCATAGAGATAAAGCGTGCCGCCGCCCAGCCACATGTTCCCGCTTTGGGCGATATACAGCAGAATCGCGCTAAGCGGTGCGGTGGTGCATGGTGAACAGATCAGTCCGGCAATCGCCCCCATAACAAACACACCGCCAGGTGAGCCGCCCTGTTGGCGATTGCTCATCAACGTGAGACGTGTTTGCAGCGAAGAGGGGAGTTGCAGGGTAAACAAGCCAAACATTGACATCGCCAGCAAGGTAAAGACGA > NC_000913/4364021‑4364294 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |