| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,200,176 | (G)6→7 | intergenic (+82/‑105) | yjaG → / → hupA | conserved protein YjaG/DNA‑binding protein HU‑alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,200,170 | 1 | . | G | 93.5% | 252.8 / 9.0 | 77 | intergenic (+76/‑111) | yjaG/hupA | conserved protein YjaG/DNA‑binding protein HU‑alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/3); new base G (34/38); total (36/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
TTAGGGCAGACCTGCGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTT‑G‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGAACAAGACTCAACTGATT > NC_000913/4200036‑4200301 | ttAGGGCAGACCTGCGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTT‑g‑gg‑gc > 1:640530/1‑139 (MQ=255)ttAGGGCAGACCTGCGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCATCCGTTTCGCCCCCCGTGTGGTCTACATTT‑g‑gg‑g‑g > 2:329092/1‑140 (MQ=255) cAGACCTGCGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTT‑g‑gg‑g‑gggcaaa > 2:613634/1‑135 (MQ=255) gatcTGCGTGAGGCGGGAGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGaaaa > 2:856320/4‑140 (MQ=255) gACCTGCGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGaaaa > 1:517920/1‑140 (MQ=255) aCCTGCGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGTGTCTTCCCTTTCGCCCACCGTCTGGGCTACTTTTGG‑GG‑G‑GGCGaaaaa > 2:328793/1‑140 (MQ=255) cTGCGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACTTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGaaaaaaa > 2:1019757/1‑140 (MQ=255) cGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTg > 2:19220/1‑140 (MQ=255) cGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTg > 2:572975/1‑140 (MQ=255) cGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTg > 1:981368/1‑140 (MQ=255) ggggggggGAGAGAAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAAAAAACGTAATTTACCGCCTGATTTGTCGTCCCT‑GAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTAt < 2:10799/136‑1 (MQ=255) gCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATc < 1:793244/140‑1 (MQ=255) gggTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCgg < 1:879971/140‑1 (MQ=255) gTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTg > 2:915012/1‑140 (MQ=255) agagCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt < 1:841084/140‑1 (MQ=255) agagCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt < 2:650666/140‑1 (MQ=255) agagCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt < 1:19220/140‑1 (MQ=255) agagCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt < 1:757205/140‑1 (MQ=255) agagCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTT‑G‑GG‑GCGGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt < 2:640530/140‑1 (MQ=255) agagCAATATTGGTACAATTTTTCAGCAAGAAAACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt < 1:431034/140‑1 (MQ=255) agacagatatTGGTATACTTTTACAGCAATATGACTAGATAACGTGATCTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt < 2:282733/134‑1 (MQ=255) aacAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgtgt < 1:1751/138‑1 (MQ=255) tatTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt > 1:620283/1‑133 (MQ=255) tatTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt < 2:620283/133‑1 (MQ=255) tatTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCa > 1:653721/1‑140 (MQ=255) tatTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCa < 1:640063/140‑1 (MQ=255) tatTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCa > 1:790613/1‑140 (MQ=255) tatTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTT‑GTGG‑G‑GGCGGAAAAAATTGGCTAGCGGTGCGTGTATGCa > 1:487698/1‑140 (MQ=255) tatTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGCTCTACATTC‑G‑GGAG‑GGCGAAAAAAAATGGCTATCGGTGCGTGTATGCa > 2:356858/1‑140 (MQ=255) tGGTATAATTTTTCAGCCATAACACCAGAAACCATAATTTAACGCCTGGTTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGga < 2:487698/140‑1 (MQ=255) tGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGga < 1:1002730/140‑1 (MQ=255) gTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGgaga > 2:863156/1‑140 (MQ=255) taATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt < 2:1013908/125‑1 (MQ=255) taATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCgt > 1:1013908/1‑125 (MQ=255) taATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTg < 2:790613/140‑1 (MQ=255) aTTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAGAAAAGTGGCTAGCGATGCGTGAATGCAGgagctgtct > 1:282733/1‑134 (MQ=255) aTTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCt > 1:94871/1‑140 (MQ=255) tttCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTAtt < 2:829675/140‑1 (MQ=255) tCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTg > 2:149795/1‑133 (MQ=255) tCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTg < 1:149795/133‑1 (MQ=255) ccAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTc < 2:917170/140‑1 (MQ=255) aGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTTTATACAGGAGAGCGCTATTCTGGCATTTCCGTCGc > 2:422054/1‑140 (MQ=255) aaaCGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACt < 2:77088/140‑1 (MQ=255) aaaCGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACt > 1:854338/1‑140 (MQ=255) aaaCGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACt < 1:95728/140‑1 (MQ=255) gTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTc > 1:750082/1‑131 (MQ=255) gTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCACGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGAt > 2:327147/1‑140 (MQ=255) gTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCAAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTc < 2:750082/131‑1 (MQ=255) aaCGCCTGATTTGTCGTCCCTGCAGTCTTCCCTTTGGCCCCCCGTCTGCTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGc < 2:380873/140‑1 (MQ=255) aaCGCCTGATTTGTCGTACCTGTAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGc < 2:409843/140‑1 (MQ=255) cGCCTGATTTGTCGTCCCTGGATTCCTCCCTTTCGCCTCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCaa < 1:328793/140‑1 (MQ=255) cGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCGGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCaa > 1:756077/1‑140 (MQ=255) cGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCaa < 2:94871/140‑1 (MQ=255) ttGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATaaa < 1:572975/140‑1 (MQ=255) ttGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATaaa < 2:166314/140‑1 (MQ=255) tGTCGTACCTGGAGTGTTCCCTATCTCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAac < 1:356858/140‑1 (MQ=255) gTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAaca < 1:856320/140‑1 (MQ=255) tCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAacac < 2:653721/140‑1 (MQ=255) cGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAAcaca > 2:620460/1‑140 (MQ=255) gTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACAt > 1:792261/1‑140 (MQ=255) tACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACAtt < 2:205273/140‑1 (MQ=255) tACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACAtt < 1:614720/140‑1 (MQ=255) aCCTGGAGTCTTCCCGTTCGCCCCCTGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTg < 1:422054/140‑1 (MQ=255) ccTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCGGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGt < 2:756077/140‑1 (MQ=255) ttCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAAc > 2:786459/1‑140 (MQ=255) ttCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTCCCGTCGCATTCGGTGCTTAGCAAGCCATAAACACATTGTAAGGATAAc > 2:319734/1‑140 (MQ=255) ttCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTCCCGTCGCAGTCGATGCATAGCAAGCAATAACCACATTGTAAGGATAAc > 2:276463/1‑140 (MQ=255) cccTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACtt > 2:734962/1‑140 (MQ=255) cccTTTCGCCCCCCGTCTGGTCGACATTTGG‑GG‑G‑GGCTAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACtt < 1:319734/140‑1 (MQ=255) cTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTAt < 1:863156/140‑1 (MQ=255) tttCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATg > 1:655564/1‑140 (MQ=255) ttCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGTAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGa > 1:995348/1‑140 (MQ=255) ttCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGa > 1:55430/1‑140 (MQ=255) tCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGaa < 1:734962/140‑1 (MQ=255) tCGCCCCCCGTCTGGTCTACATCT‑GCGG‑G‑TGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGaa < 1:276463/140‑1 (MQ=255) ccccccGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGAACaa > 2:1002983/1‑140 (MQ=255) ccccccGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGAACaa > 2:13559/1‑140 (MQ=255) ccccccGTCTGGTCTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGGCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGAACaa > 1:992209/1‑140 (MQ=255) ggTCTACATTT‑G‑GG‑GTGGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGAACAAGACTCAACtg < 1:1019757/140‑1 (MQ=255) cTACATTTGG‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGAACAAGACTCAACtgatt > 2:619618/1‑140 (MQ=255) | TTAGGGCAGACCTGCGTGAGGCGGGTGAGAGCAATATTGGTATAATTTTTCAGCAATAAGACCAGAAAACGTGATTTAACGCCTGATTTGTCGTACCTGGAGTCTTCCCTTTCGCCCCCCGTCTGGTCTACATTT‑G‑GG‑G‑GGCGAAAAAAAGTGGCTATCGGTGCGTGTATGCAGGAGAGTGCTATTCTGGCATTTCCGTCGCACTCGATGCTTAGCAAGCGATAAACACATTGTAAGGATAACTTATGAACAAGACTCAACTGATT > NC_000913/4200036‑4200301 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |